Mutant Information 

Mutant NameFN-156  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 35

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr122665269C-THETINTERGENIC
SBS  Chr127206905T-AHETINTERGENIC
SBS  Chr133446938C-AHETINTERGENIC
SBS  Chr133446939G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr142779111G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr10692199A-CHETINTRON
SBS  Chr105433969G-CHETINTERGENIC
SBS  Chr1011090118T-CHOMOUTR_3_PRIME
SBS  Chr115858288G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr119755885G-AHOMOINTRON
SBS  Chr1113302835C-AHOMONON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os11g23110
SBS  Chr1118838613G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr1214533888G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr211863537G-AHETINTRON
SBS  Chr2837286T-AHETINTERGENIC
SBS  Chr27820713G-THETINTERGENIC
SBS  Chr326301818A-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr315490187G-AHOMOINTERGENIC
SBS  Chr416135742A-CHOMONON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os04g27310
SBS  Chr42115019G-THETINTERGENIC
SBS  Chr427086898C-THETINTERGENIC
SBS  Chr421460082A-GHOMOINTERGENIC
SBS  Chr431585876C-THETINTERGENIC
SBS  Chr519292856T-CHOMOINTRON
SBS  Chr55296349A-GHETINTRON
SBS  Chr57504978C-THETINTERGENIC
SBS  Chr67163809C-THOMOINTRON
SBS  Chr78563563A-GHETSYNONYMOUS_CODING
SBS  Chr721776185C-AHETINTERGENIC
SBS  Chr719468438G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr77614273G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr84960332T-GHETINTRON
SBS  Chr812107257C-GHETNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os08g20180
SBS  Chr915720519C-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr915498366C-THETINTERGENIC

Deletions: 40

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr128476995284769994LOC_Os01g49500
Deletion  Chr1326081733260818916
Deletion  Chr10207208462072085610LOC_Os10g38890
Deletion  Chr10181056621810567715
Deletion  Chr10360392936039301
Deletion  Chr1017856273178562741
Deletion  Chr1019337384193373851
Deletion  Chr1125105869251069461077LOC_Os11g41780
Deletion  Chr112521583725215938101
Deletion  Chr1121893345218933505LOC_Os11g37090
Deletion  Chr1123449937234499403
Deletion  Chr12546320154632021
Deletion  Chr12975341697534215
Deletion  Chr1221174277211742803
Deletion  Chr2107564651075654984
Deletion  Chr2218290921829101
Deletion  Chr211047247110472481
Deletion  Chr2871442287144242LOC_Os02g15540
Deletion  Chr34005635400565924
Deletion  Chr310487983104879841
Deletion  Chr333142329331423301
Deletion  Chr36092316609233216
Deletion  Chr326736030267360366
Deletion  Chr3778587677858804
Deletion  Chr434592241345922443
Deletion  Chr5480642448064251
Deletion  Chr5660110266011053
Deletion  Chr5607276560727661
Deletion  Chr528071539280715401
Deletion  Chr6605416160541621
Deletion  Chr6734718373471841
Deletion  Chr6214204842142049511
Deletion  Chr68397673839768512LOC_Os06g14800
Deletion  Chr7761427476142751
Deletion  Chr7383183538318427
Deletion  Chr7888549888855013
Deletion  Chr7853797685379782LOC_Os07g14920
Deletion  Chr818755066187550748
Deletion  Chr812707690127076922
Deletion  Chr911348793113488029

Insertions: 40

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr1496744649674466
Insertion  Chr1237241642372416410
Insertion  Chr127782763277827632
Insertion  Chr1385990183859901816
Insertion  Chr10150188541501885460
Insertion  Chr1017559878175598782
Insertion  Chr1021194276211942762
Insertion  Chr11354879335487932LOC_Os11g07124
Insertion  Chr1117054305170543051
Insertion  Chr1122223380222233804
Insertion  Chr1127699077276990772
Insertion  Chr1225556821255568218
Insertion  Chr29555651955565121LOC_Os02g16740
Insertion  Chr2124098331240983318
Insertion  Chr214697465146974651
Insertion  Chr215568946155689463
Insertion  Chr2168119401681194015
Insertion  Chr218534196185341962
Insertion  Chr228081723280817232LOC_Os02g46080
Insertion  Chr3204390942043909414
Insertion  Chr419379274193792741
Insertion  Chr419644590196445902
Insertion  Chr431505595315055952
Insertion  Chr514140444141404442
Insertion  Chr622092940220929401
Insertion  Chr623545576235455763
Insertion  Chr79981329998132914
Insertion  Chr7110059521100595225
Insertion  Chr723100486231004866
Insertion  Chr725221115252211152
Insertion  Chr8128597012859702
Insertion  Chr84309379430937933
Insertion  Chr816394544163945442
Insertion  Chr817539706175397062
Insertion  Chr819775673197756733LOC_Os08g31910
Insertion  Chr9616638361663831
Insertion  Chr9734056673405662
Insertion  Chr910350505103505054
Insertion  Chr915134259151342593
Insertion  Chr915169579151695792

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr31323840813599831LOC_Os03g22900
Inversion  Chr7886625913124599LOC_Os07g23290

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position1

Chromosome

Position2

Number of genes

Translocation  Chr915495015Chr7131246112
Translocation  Chr915499836Chr78866270LOC_Os09g25860