Mutant Information 

Mutant NameFN-17  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 3

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr334066818G-AHomoINTERGENIC
SBS  Chr623207286T-CHomoINTRON
SBS  Chr98720776G-THomoINTRON

Deletions: 30

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr1217017662170178923LOC_Os01g38620
Deletion  Chr1643255464325551LOC_Os01g11880
Deletion  Chr1643255564325561LOC_Os01g11880
Deletion  Chr1417827041782722
Deletion  Chr102055451920554782263
Deletion  Chr10377399337739974
Deletion  Chr1118427127184271358
Deletion  Chr11246543632465437512
Deletion  Chr12680400168740007000011
Deletion  Chr12970947797094781
Deletion  Chr12122608851226091833LOC_Os12g21784
Deletion  Chr2261240542612407319
Deletion  Chr233110607331106081
Deletion  Chr2311406573114069538
Deletion  Chr2721502721681179
Deletion  Chr310617737106177381
Deletion  Chr3163478261634784620LOC_Os03g28370
Deletion  Chr4256550012566600011000LOC_Os04g43390
Deletion  Chr4256760012569700021000LOC_Os04g43410
Deletion  Chr52827091282710413
Deletion  Chr5266104682661048012LOC_Os05g45920
Deletion  Chr5173585751735858914
Deletion  Chr6155953115595332LOC_Os06g03860
Deletion  Chr7707342870734357
Deletion  Chr856797545680267513
Deletion  Chr8309141830914246
Deletion  Chr911129642111296508
Deletion  Chr913979599139796012
Deletion  Chr915654620156546244
Deletion  Chr9909037490903751

Insertions: 27

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr1194633219463322
Insertion  Chr123079848230798482
Insertion  Chr142774203427742032
Insertion  Chr10174209317420934
Insertion  Chr10219119221911923
Insertion  Chr118715538715532
Insertion  Chr11196393161963931612
Insertion  Chr1122202276222022762
Insertion  Chr1122875598228755981
Insertion  Chr12309282930928294
Insertion  Chr2164034331640343333
Insertion  Chr218089824180898242
Insertion  Chr219791930197919302
Insertion  Chr221458409214584094
Insertion  Chr315406674154066746
Insertion  Chr316708020167080202
Insertion  Chr3259662742596627452
Insertion  Chr423881492238814924
Insertion  Chr4313611063136110669
Insertion  Chr5640228764022874
Insertion  Chr617446736174467366
Insertion  Chr7352711335271135
Insertion  Chr717069001170690012
Insertion  Chr719025978190259782
Insertion  Chr726267327262673272
Insertion  Chr815066551150665512LOC_Os08g24900
Insertion  Chr919638827196388272

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr122449714724642536LOC_Os12g39670
Inversion  Chr122449714724642536LOC_Os12g39870
Inversion  Chr42566606425697459LOC_Os04g43390
Inversion  Chr43088546231663737LOC_Os04g53170
Inversion  Chr71490999115657080LOC_Os07g25990