Mutant Information 

Mutant NameFN-18  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 3

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr137972381A-GHomoINTERGENIC
SBS  Chr620882616A-GHomoNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os06g35780
SBS  Chr78889394A-CHomoINTERGENIC

Deletions: 31

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr136712750367127511
Deletion  Chr137924010379240166
Deletion  Chr119164346191643537
Deletion  Chr10532050853205091
Deletion  Chr10246121024612111
Deletion  Chr1117800526178005271
Deletion  Chr114734577473459114
Deletion  Chr12145091141450912511LOC_Os12g25220
Deletion  Chr1221553468215534779
Deletion  Chr122465857246587013
Deletion  Chr233952938339529479
Deletion  Chr3607941960794223LOC_Os03g11650
Deletion  Chr320604589206045978LOC_Os03g37194
Deletion  Chr335235814352358184
Deletion  Chr38138307813832316
Deletion  Chr3820465682046571
Deletion  Chr310137793101377985
Deletion  Chr425925610259256166
Deletion  Chr523070862230708675LOC_Os05g39330
Deletion  Chr529756382297563831
Deletion  Chr520303379203033867
Deletion  Chr545348145350120
Deletion  Chr614145699141457023
Deletion  Chr617702482177024919
Deletion  Chr6109971221099720886
Deletion  Chr723513869235138701
Deletion  Chr716175693161756963
Deletion  Chr7234465892344659910
Deletion  Chr8163678601636787313
Deletion  Chr9602069260207019
Deletion  Chr9216894752168949116

Insertions: 28

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr12549378254937822
Insertion  Chr1271365327136532
Insertion  Chr143059641430596411
Insertion  Chr1014416901144169011
Insertion  Chr11688833168883314LOC_Os11g12340
Insertion  Chr11725495872549582
Insertion  Chr2793077579307752
Insertion  Chr2951832395183232
Insertion  Chr210135304101353044LOC_Os02g17620
Insertion  Chr215314956153149563
Insertion  Chr312114390121143902
Insertion  Chr43685823685824
Insertion  Chr434913717349137171
Insertion  Chr518832874188328742
Insertion  Chr519049178190491782
Insertion  Chr611217514112175141
Insertion  Chr628120293281202936
Insertion  Chr7113641991136419920
Insertion  Chr712793853127938533
Insertion  Chr722930902229309022LOC_Os07g38240
Insertion  Chr724313236243132362
Insertion  Chr724573851245738512
Insertion  Chr724980248249802485
Insertion  Chr729661649296616492
Insertion  Chr81209775120977510
Insertion  Chr8793452379345231
Insertion  Chr819334895193348952
Insertion  Chr820486314204863144

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr21702129617198424LOC_Os02g29040
Inversion  Chr3489437229185531LOC_Os03g51050
Inversion  Chr52759971928003018

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position1

Chromosome

Position2

Number of genes

Translocation  Chr614285625Chr239224702
Translocation  Chr315560364Chr217199004LOC_Os02g29040
Translocation  Chr315560365Chr217198428LOC_Os02g29040
Translocation  Chr1121779399Chr613869717