Mutant Information 

Mutant NameFN-314  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 28

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr112513187G-AHETINTRON
SBS  Chr118069097A-GHETINTRON
SBS  Chr121500241C-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr142964179C-GHOMOINTRON
SBS  Chr142964180T-AHOMOINTRON
SBS  Chr105036937G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr1114673737C-THETINTRON
SBS  Chr1116391886G-THETINTRON
SBS  Chr1116391887C-THETINTRON
SBS  Chr1211080359T-AHETINTERGENIC
SBS  Chr21571789A-THETINTRON
SBS  Chr217659713C-AHETINTRON
SBS  Chr221910163T-GHETINTERGENIC
SBS  Chr326138862C-THETINTERGENIC
SBS  Chr31624679G-THETINTERGENIC
SBS  Chr41831211G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr428397744G-CHOMOINTERGENIC
SBS  Chr413831933T-AHETINTERGENIC
SBS  Chr416231383A-GHETINTERGENIC
SBS  Chr428397743G-AHOMOINTERGENIC
SBS  Chr515305393G-AHOMOSYNONYMOUS_CODING
SBS  Chr526730642G-CHOMOINTERGENIC
SBS  Chr511042651C-GHETUTR_5_PRIME
SBS  Chr510921136C-AHETINTRON
SBS  Chr7869581C-THETNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os07g02490
SBS  Chr719016635C-GHOMOINTERGENIC
SBS  Chr93902068A-GHETINTERGENIC
SBS  Chr98830882G-AHETINTERGENIC

Deletions: 32

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr1151274681512749022
Deletion  Chr142986245429862516
Deletion  Chr142738107427381092
Deletion  Chr10219485421948639
Deletion  Chr10160072921600738391
Deletion  Chr1127296864272968673
Deletion  Chr11231739602317398727LOC_Os11g38920
Deletion  Chr1126326993263269941
Deletion  Chr11109780611097806212
Deletion  Chr12880216588021749LOC_Os12g15420
Deletion  Chr12202510120251021
Deletion  Chr12721939372193941LOC_Os12g13020
Deletion  Chr121942855194286712LOC_Os12g04595
Deletion  Chr316062973160629752
Deletion  Chr3150213415021362LOC_Os03g03470
Deletion  Chr4294970732949710027LOC_Os04g49430
Deletion  Chr413220953132209596LOC_Os04g23220
Deletion  Chr4568110756811081
Deletion  Chr4298011432980116219
Deletion  Chr515760370157603755
Deletion  Chr59430295943030510
Deletion  Chr519710183197101852
Deletion  Chr518966493189664941
Deletion  Chr6295697792956979112
Deletion  Chr6126062212606231LOC_Os06g03310
Deletion  Chr629932460299324611
Deletion  Chr725357839253578434LOC_Os07g42380
Deletion  Chr817394834173948362
Deletion  Chr8753723075372311
Deletion  Chr911805891118058965LOC_Os09g19734
Deletion  Chr9390207039020711
Deletion  Chr917716959177169634

Insertions: 35

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr14636827463682712
Insertion  Chr123593308235933082
Insertion  Chr142456114424561149
Insertion  Chr1429078794290787918
Insertion  Chr10252864125286412
Insertion  Chr1019038169190381694
Insertion  Chr11488863048886304
Insertion  Chr11725495872549582
Insertion  Chr11170850581708505858
Insertion  Chr1119670883196708832
Insertion  Chr12672887367288734
Insertion  Chr1223551114235511142
Insertion  Chr1223566382235663824
Insertion  Chr2827356782735672
Insertion  Chr218556721185567216LOC_Os02g31060
Insertion  Chr2188076591880765949
Insertion  Chr219267013192670132
Insertion  Chr220960937209609372
Insertion  Chr316253168162531681
Insertion  Chr44124944412494459LOC_Os04g07760
Insertion  Chr4165643111656431122
Insertion  Chr417475534174755344
Insertion  Chr433820414338204141
Insertion  Chr6753017575301751
Insertion  Chr610358406103584068LOC_Os06g17840
Insertion  Chr623336427233364272
Insertion  Chr625246934252469342
Insertion  Chr626692883266928831
Insertion  Chr78350546835054612LOC_Os07g14640
Insertion  Chr7110059521100595225
Insertion  Chr722426877224268774
Insertion  Chr85618575618572
Insertion  Chr8987976298797622
Insertion  Chr816622730166227302
Insertion  Chr820060639200606396

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr1722923533506545LOC_Os01g57960
Inversion  Chr8327513716925910