Mutant Information 

Mutant NameFN-48  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 11

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr1013916981G-AHomoINTRON
SBS  Chr1013916980T-AHomoINTRON
SBS  Chr1110296594A-THomoINTRON
SBS  Chr115553195T-CHomoINTRON
SBS  Chr1221767168G-AHomoSYNONYMOUS_CODING
SBS  Chr311970613T-CHomoINTERGENIC
SBS  Chr315558654C-THomoINTERGENIC
SBS  Chr315099624C-THomoINTERGENIC
SBS  Chr431457990G-AHomoINTERGENIC
SBS  Chr53657891A-THomoINTRON
SBS  Chr91185694C-THomoINTERGENIC

Deletions: 19

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr1167438811674394160
Deletion  Chr1181315391813159960
Deletion  Chr139666569396665701
Deletion  Chr10119299311192995625
Deletion  Chr1020152270201522711
Deletion  Chr2357234235723464
Deletion  Chr24736727473673811
Deletion  Chr212773226127732271
Deletion  Chr229700174297001751
Deletion  Chr33549175235492198446
Deletion  Chr3977709797770981
Deletion  Chr420830968208309702
Deletion  Chr511442812114428197
Deletion  Chr62300543423021582161484
Deletion  Chr61307500113089000140003
Deletion  Chr617667494176674951
Deletion  Chr8103962881039631527
Deletion  Chr815428614154286173
Deletion  Chr9102736410273651

Insertions: 34

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr1670433267043324
Insertion  Chr1706536870653684
Insertion  Chr114630857146308572
Insertion  Chr123864604238646043
Insertion  Chr138507570385075706
Insertion  Chr118715538715532
Insertion  Chr11371038837103882
Insertion  Chr1128794547287945478LOC_Os11g47730
Insertion  Chr125141655141657
Insertion  Chr12662486966248692
Insertion  Chr12992192999219292
Insertion  Chr3317348031734801
Insertion  Chr3816303081630303
Insertion  Chr325745703257457033
Insertion  Chr334279135342791352
Insertion  Chr4416758041675802
Insertion  Chr410455647104556472
Insertion  Chr417014022170140222
Insertion  Chr5860963886096382LOC_Os05g15160
Insertion  Chr5886192788619271
Insertion  Chr517289595172895954
Insertion  Chr6151022615102261
Insertion  Chr621372446213724466LOC_Os06g36390
Insertion  Chr622683835226838352
Insertion  Chr628300445283004454
Insertion  Chr74714237471423724
Insertion  Chr712851170128511702
Insertion  Chr8565755756575574
Insertion  Chr810131544101315442
Insertion  Chr8164814511648145112
Insertion  Chr820070781200707812
Insertion  Chr823644560236445606
Insertion  Chr826353245263532456
Insertion  Chr9949546694954662

Inversions: 4

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr61229581013075085LOC_Os06g21260
Inversion  Chr61229581013075085LOC_Os06g22500
Inversion  Chr61229582712962127LOC_Os06g21260
Inversion  Chr8967427611251787LOC_Os08g18850

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position1

Chromosome

Position2

Number of genes

Translocation  Chr93145634Chr327960058LOC_Os09g06634
Translocation  Chr93147198Chr810643124LOC_Os09g06634
Translocation  Chr810643649Chr327960043
Translocation  Chr335491761Chr136588092LOC_Os01g63150