Mutant Information 

Mutant NameFN-50  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability No


Variant Information 

Single base substitutions: 10

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr119713864G-THomoINTERGENIC
SBS  Chr1018056551A-THomoNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os10g33940
SBS  Chr1123528183A-THomoINTRON
SBS  Chr1222737518A-CHomoINTERGENIC
SBS  Chr1223826389A-THomoINTRON
SBS  Chr31479076T-CHomoINTRON
SBS  Chr48326043G-AHomoINTERGENIC
SBS  Chr521203685T-CHomoINTRON
SBS  Chr88159977T-GHomoUTR_3_PRIME
SBS  Chr918007372C-THomoINTRON

Deletions: 24

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr130422285304222894LOC_Os01g52910
Deletion  Chr131341027313410281
Deletion  Chr10191022119102243
Deletion  Chr10129996061299961913LOC_Os10g25180
Deletion  Chr1118769313187693174
Deletion  Chr1225227788252277913
Deletion  Chr1227478963274789641
Deletion  Chr216017874160178762
Deletion  Chr2176027317602785
Deletion  Chr2116310011164300012000
Deletion  Chr322481238224812413
Deletion  Chr333375023333750241LOC_Os03g58600
Deletion  Chr3327955443279556521
Deletion  Chr4267717026771788LOC_Os04g05370
Deletion  Chr48477001886300038600066
Deletion  Chr615135009151350112
Deletion  Chr627897723278977274
Deletion  Chr613956518139565268
Deletion  Chr6224920562249207216LOC_Os06g38040
Deletion  Chr713520009135200145LOC_Os07g23920
Deletion  Chr79287772928780533
Deletion  Chr8343172234317231LOC_Os08g06220
Deletion  Chr823904092239040942LOC_Os08g37740
Deletion  Chr914446446144464471

Insertions: 36

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr12549378254937822
Insertion  Chr110172192101721922
Insertion  Chr123912303239123032
Insertion  Chr1013690346136903462
Insertion  Chr11703812370381233
Insertion  Chr1116367368163673682
Insertion  Chr1118804838188048384
Insertion  Chr1125885371258853714
Insertion  Chr1126038899260388992
Insertion  Chr1126129615261296152
Insertion  Chr1223461991234619912
Insertion  Chr2639487863948782
Insertion  Chr216958987169589873
Insertion  Chr217850754178507542
Insertion  Chr33811523811526
Insertion  Chr310202816102028166
Insertion  Chr3141930591419305941
Insertion  Chr3242681542426815422
Insertion  Chr326901345269013451
Insertion  Chr43477303477304
Insertion  Chr417788550177885503
Insertion  Chr420356376203563762
Insertion  Chr420701596207015962
Insertion  Chr421426409214264098
Insertion  Chr52671292671291
Insertion  Chr57636867636862LOC_Os05g02350
Insertion  Chr5781499978149992
Insertion  Chr516387468163874681
Insertion  Chr6446467844646784
Insertion  Chr7364347736434773
Insertion  Chr7804590680459064
Insertion  Chr717135544171355441
Insertion  Chr89707839707836
Insertion  Chr820425353204253532
Insertion  Chr910786503107865034
Insertion  Chr9171527861715278628

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position1

Position2

Number of genes

Inversion  Chr21164072713153786
Inversion  Chr21268105313151441

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position1

Chromosome

Position2

Number of genes

Translocation  Chr6200212Chr5256039832
Translocation  Chr6205188Chr5256039822