Mutant Information 

Mutant NameFN-70  [Download]
Generation M2
Genus species Oryza sativa
Cultivar Kitaake
Seed Availability Yes [Order Seeds]


Variant Information 

Single base substitutions: 31

Variant Type

Chromosome

Start_pos

Change

Genotype

Effect

Gene affected

SBS  Chr112682467T-GHETINTRON
SBS  Chr127180197A-THOMOINTRON
SBS  Chr1012206886T-CHETINTERGENIC
SBS  Chr1020510952C-GHOMOINTERGENIC
SBS  Chr1112788717G-AHOMOSTOP_GAINEDLOC_Os11g22310
SBS  Chr1117578997A-CHETINTRON
SBS  Chr1124908329G-AHETINTERGENIC
SBS  Chr1216862391A-THETINTERGENIC
SBS  Chr1223063558G-AHOMONON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os12g37570
SBS  Chr1227207326C-AHETINTERGENIC
SBS  Chr229495590G-CHOMOINTERGENIC
SBS  Chr310789482A-CHETINTERGENIC
SBS  Chr311534106T-AHOMOINTERGENIC
SBS  Chr311534114T-CHOMOINTERGENIC
SBS  Chr316835795C-AHETINTERGENIC
SBS  Chr325780585T-CHOMOINTERGENIC
SBS  Chr327054328T-AHOMOINTERGENIC
SBS  Chr413625697G-THETINTERGENIC
SBS  Chr426258120C-AHOMOUTR_3_PRIME
SBS  Chr41815338C-THETNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os04g03980
SBS  Chr413625698G-THETINTERGENIC
SBS  Chr415280456C-AHETSYNONYMOUS_CODING
SBS  Chr419950274G-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr421163227C-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr58767451C-THETINTRON
SBS  Chr627894913A-GHETINTERGENIC
SBS  Chr613525600C-THETINTRON
SBS  Chr624670146G-THETNON_SYNONYMOUS_CODINGLOC_Os06g41210
SBS  Chr712984225C-THETINTERGENIC
SBS  Chr822951283C-THOMOINTERGENIC
SBS  Chr921046801G-AHOMOUTR_5_PRIME

Deletions: 33

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Deletion  Chr119189943191899518
Deletion  Chr12319385231940217
Deletion  Chr121369948213699524
Deletion  Chr13849226384923610LOC_Os01g07960
Deletion  Chr1018352166183521671
Deletion  Chr11115443461154437428
Deletion  Chr1110586294105862973
Deletion  Chr1117570807175708081
Deletion  Chr1216852104168521062
Deletion  Chr12739773273977364
Deletion  Chr217262407172624081LOC_Os02g29140
Deletion  Chr315150684151506939LOC_Os03g26530
Deletion  Chr3114862321148624513
Deletion  Chr32419593724196100163
Deletion  Chr330145856301458593
Deletion  Chr316377301163773087LOC_Os03g28420
Deletion  Chr4113657711365858LOC_Os04g02900
Deletion  Chr416944201169442021
Deletion  Chr428087366280873671
Deletion  Chr42851942028519722302LOC_Os04g47960
Deletion  Chr4220289332202896734
Deletion  Chr414065772140657775
Deletion  Chr4183920041839208076
Deletion  Chr524453442244534464
Deletion  Chr6111847111184721
Deletion  Chr616183186161831937LOC_Os06g28450
Deletion  Chr7280912982809131921LOC_Os07g47010
Deletion  Chr722747635227476372
Deletion  Chr8222488092224882011
Deletion  Chr827623137276231436
Deletion  Chr823850651238506576LOC_Os08g37650
Deletion  Chr9422441642244237
Deletion  Chr9973538597353938

Insertions: 33

Variant Type

Chromosome

Start_pos

End_pos

Size(bp)

Number of genes

Insertion  Chr1895602089560202
Insertion  Chr127134019271340192LOC_Os01g47470
Insertion  Chr127891734278917342
Insertion  Chr139804019398040192
Insertion  Chr143242276432422766
Insertion  Chr10596187859618782
Insertion  Chr1018961710189617102
Insertion  Chr11753566775356678
Insertion  Chr1218350022183500222
Insertion  Chr1221795985217959852
Insertion  Chr2639487863948782
Insertion  Chr216468454164684544LOC_Os02g27810
Insertion  Chr225361513253615132
Insertion  Chr228851153288511537
Insertion  Chr229249980292499801
Insertion  Chr230290909302909093LOC_Os02g49555
Insertion  Chr34143849414384916
Insertion  Chr4230561823056181
Insertion  Chr431914425319144254
Insertion  Chr5640228764022874
Insertion  Chr7531661953166191
Insertion  Chr712108498121084983
Insertion  Chr715737652157376521LOC_Os07g27140
Insertion  Chr725272927252729273
Insertion  Chr729332646293326462
Insertion  Chr81209775120977510
Insertion  Chr824023471240234713
Insertion  Chr826815767268157672
Insertion  Chr9919767191976712
Insertion  Chr910486654104866542
Insertion  Chr918154253181542536
Insertion  Chr918174528181745286
Insertion  Chr920022822200228221