FN2611-S Chr1 104077 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 104078 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 14714957 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 15177073 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 15352575 15458667 0 0 Inversion 0 FN2611-S Chr1 15352589 15458682 0 0 Inversion 0 FN2611-S Chr1 15800574 15800592 0 0 Deletion 18 disruptive_inframe_deletion HET LOC_Os01g28200 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr1 15883728 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 18893916 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 2639069 2639317 0 0 Deletion 248 HET FN2611-S Chr1 2693981 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 33247866 33247868 0 0 Deletion 2 frameshift_variant HET LOC_Os01g57550 nodulation protein-related, putative, expressed FN2611-S Chr1 36199271 36199273 0 0 Insertion 2 HET FN2611-S Chr1 36346477 36346490 0 0 Deletion 13 HET FN2611-S Chr1 37691057 37691068 0 0 Deletion 11 HET FN2611-S Chr1 4811802 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 4811943 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr1 7264175 7264182 0 0 Deletion 7 HET FN2611-S Chr1 7849847 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr10 1916536 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr10 21280639 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr10 3020066 3020067 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr10 6526686 6526695 0 0 Insertion 9 HET FN2611-S Chr10 712057 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 11769158 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 12590905 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os11g21950 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN2611-S Chr11 1285405 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 26515235 26515249 0 0 Deletion 14 HET FN2611-S Chr11 28453493 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 28934238 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 6734742 6734743 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr11 7945910 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr11 916753 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr12 10557785 10557791 0 0 Deletion 6 HET FN2611-S Chr12 13898065 13898070 0 0 Deletion 5 frameshift_variant HET LOC_Os12g24364 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN2611-S Chr12 17592261 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr12 18846545 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr12 24307749 Chr7 26315008 0 Translocation 0 FN2611-S Chr12 3603154 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr12 8164116 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os12g14330 disease resistance protein RPM1, putative, expressed FN2611-S Chr12 9179287 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 11228670 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 17259792 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 20490828 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 22811838 22811842 0 0 Deletion 4 HET FN2611-S Chr2 25554625 25554687 0 0 Insertion 62 HET FN2611-S Chr2 26791436 26791437 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr2 29822752 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 29822753 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 305018 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 6196255 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr2 847973 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 11136730 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 12853065 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 13286778 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 13878932 13878935 0 0 Deletion 3 HET FN2611-S Chr3 14019735 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os03g24620 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr3 14589486 14589494 0 0 Deletion 8 HET FN2611-S Chr3 15327057 15327059 0 0 Insertion 2 HET FN2611-S Chr3 1586353 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 1843069 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 19782696 19782697 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr3 27345028 27345030 0 0 Deletion 2 HET FN2611-S Chr3 28924414 28924416 0 0 Deletion 2 HET FN2611-S Chr3 31682301 31682302 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr3 50437 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os03g01070 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr3 7224489 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr3 9075512 9075518 0 0 Deletion 6 inframe_deletion HET LOC_Os03g16450 pentatricopeptide, putative, expressed FN2611-S Chr3 9300637 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr4 13229455 13229634 0 0 Inversion 0 FN2611-S Chr4 14838191 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os04g25600 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr4 16088946 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr4 19058219 19058222 0 0 Deletion 3 inframe_deletion HET LOC_Os04g31804 OsMADS64 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed FN2611-S Chr4 20502726 20502729 0 0 Deletion 3 HET FN2611-S Chr4 26037817 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr4 26247908 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os04g44320 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr4 28212415 28212422 0 0 Deletion 7 HET FN2611-S Chr4 29030686 29030973 0 0 Inversion 0 FN2611-S Chr4 29176321 29176325 0 0 Deletion 4 frameshift_variant HET LOC_Os04g48920 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr4 29929573 29929574 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr4 3270944 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr4 3323806 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os04g06360 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN2611-S Chr4 6153434 6153461 0 0 Deletion 27 HET FN2611-S Chr5 14128691 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr5 15196251 15196258 0 0 Deletion 7 HET FN2611-S Chr5 15732859 15732867 0 0 Deletion 8 frameshift_variant HET LOC_Os05g27060 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr5 15946648 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os05g27430 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN2611-S Chr5 1897778 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr5 22848812 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr5 2350262 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr5 23561600 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr5 24847513 24847515 0 0 Deletion 2 HET FN2611-S Chr5 8174607 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr6 11762509 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr6 1324593 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr6 13735101 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr6 17593397 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os06g30450 expressed protein FN2611-S Chr6 755389 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr7 1437986 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr7 16942565 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr7 3700483 3700485 0 0 Deletion 2 frameshift_variant HET LOC_Os07g07410 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed FN2611-S Chr7 4481162 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr7 8085927 8085930 0 0 Deletion 3 HET FN2611-S Chr8 15062908 15063030 0 0 Inversion 0 LOC_Os08g24880 EDM2, putative, expressed FN2611-S Chr8 157511 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 15902773 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 18609977 18613851 0 0 Inversion 0 FN2611-S Chr8 18895107 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 18895109 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 20445645 20445646 0 0 Deletion 1 HET FN2611-S Chr8 22022449 22022457 0 0 Deletion 8 HET FN2611-S Chr8 27314894 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 7834188 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr8 9783618 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os08g16040 hypothetical protein FN2611-S Chr9 19742630 19742632 0 0 Deletion 2 HET FN2611-S Chr9 20290389 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr9 21016047 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 NON_SYNONYMOUS_CODING HET LOC_Os09g36420 hsp90 protein, expressed FN2611-S Chr9 21019908 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr9 2727180 2727184 0 0 Deletion 4 HET FN2611-S Chr9 4574330 4574333 0 0 Deletion 3 HET FN2611-S Chr9 4600204 4600206 0 0 Deletion 2 HET FN2611-S Chr9 4618902 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN2611-S Chr9 9281498 9281509 0 0 Deletion 11 HET