FN4498-S Chr1 13625198 13625198 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr1 14254043 14254073 0 0 Deletion 31 HET FN4498-S Chr1 15788693 15788693 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr1 16628611 16628611 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr1 16894380 16894380 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr1 18277564 18277569 0 0 Deletion 6 HET FN4498-S Chr1 19021600 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr1 2973036 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr1 30326319 30326319 0 0 Insertion 1 HOMO FN4498-S Chr1 32157225 32157225 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr1 34123379 34123379 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr1 5314037 5314211 0 0 Inversion 174 HET FN4498-S Chr1 7084677 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os01g12790 receptor protein kinase, putative, expressed FN4498-S Chr1 7094440 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os01g12810 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr1 7301673 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr1 9786865 9786866 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr10 12386668 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr10 14915385 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr10 15008763 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr10 17276395 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr10 17536680 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr10 18442930 18442930 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr10 19459676 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr10 22405187 22405188 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os10g41610 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr10 4424910 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os10g08180 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4498-S Chr10 4871521 4871522 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr10 7054922 7054922 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr11 11733691 11733691 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr11 12110389 12110389 0 0 Insertion 48 HET FN4498-S Chr11 12172742 12172742 0 0 Insertion 78 HET FN4498-S Chr11 14988391 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr11 16099491 16099502 0 0 Deletion 12 HET FN4498-S Chr11 1674935 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr11 18846692 Chr4 16025045 Translocation 0 HET FN4498-S Chr11 19790504 19790504 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr11 20857986 20885593 0 0 Inversion 27607 HET FN4498-S Chr11 20858017 20885605 0 0 Inversion 27588 HET FN4498-S Chr11 21153201 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr11 25994498 25994498 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr11 26055311 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr11 27372646 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os11g45230 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4498-S Chr11 9354780 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr11 9354781 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os11g16850 expressed protein FN4498-S Chr12 13431970 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os12g23670 expressed protein FN4498-S Chr12 15525289 15525298 0 0 Deletion 10 HET LOC_Os12g26560 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr12 17127385 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr12 19334771 19334771 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr12 22246935 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr12 23347860 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr12 25527266 25527266 0 0 Insertion 2 HET FN4498-S Chr12 25735822 25735822 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr12 26093368 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr12 26093369 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr12 6962567 6962567 0 0 Insertion 7 HET FN4498-S Chr12 905434 905434 0 0 Insertion 2 HET FN4498-S Chr12 9829199 9829199 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr2 1111580 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr2 12118827 12118827 0 0 Insertion 87 HET FN4498-S Chr2 12901312 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr2 17658240 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os02g29660 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4498-S Chr2 18198963 18198963 0 0 Insertion 3 HET FN4498-S Chr2 18769670 18769671 0 0 Deletion 2 HOMO FN4498-S Chr2 18769683 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr2 19726600 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr2 20476679 Chr1 23511189 Translocation 0 HET LOC_Os01g41530 OsFBL2 - F-box domain and LRR containing protein, expressed FN4498-S Chr2 20476688 Chr1 24042911 Translocation 0 HET FN4498-S Chr2 22293367 22293367 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr2 22771892 22771892 0 0 Insertion 23 HET FN4498-S Chr2 24156120 24156277 0 0 Inversion 157 HET FN4498-S Chr2 24253390 24253473 0 0 Deletion 84 HET FN4498-S Chr2 26003675 26003676 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr2 2696339 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os02g05560 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr2 28667087 28667096 0 0 Deletion 10 HET FN4498-S Chr2 29740751 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr2 3045226 3045233 0 0 Deletion 8 HOMO FN4498-S Chr2 35867711 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os02g58710 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4498-S Chr3 12788125 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr3 13468456 13468459 0 0 Deletion 4 HET FN4498-S Chr3 14024124 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr3 14795103 14795103 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr3 16474817 16474832 0 0 Deletion 16 HET LOC_Os03g29020 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class FN4498-S Chr3 17945406 17945406 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr3 19035129 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os03g33280 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4498-S Chr3 25044447 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr3 27465629 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr3 27731676 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr3 28983778 28983778 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr3 31593514 31593514 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr3 46039 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr4 16302299 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr4 1946912 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr4 26455122 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr4 27972062 27972062 0 0 Insertion 14 HET FN4498-S Chr4 29820569 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os04g50000 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr4 3833704 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr4 3977257 3977257 0 0 Insertion 23 HET FN4498-S Chr4 6546355 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr4 9035808 9035808 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr4 9400140 9400147 0 0 Deletion 8 HOMO LOC_Os04g17140 retrotransposon, putative, centromere-specific, expressed FN4498-S Chr5 10369529 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 10705460 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 13239780 13239780 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr5 15639445 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 16122988 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 1696042 1696042 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr5 20587555 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 20587557 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr5 20603497 20603497 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr5 20625487 20625487 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os05g34760 expressed protein FN4498-S Chr5 22113896 22113897 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr5 22567579 22567589 0 0 Deletion 11 HET FN4498-S Chr5 25729610 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr6 11682423 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os06g20330 hypothetical protein FN4498-S Chr6 12434200 12434211 0 0 Deletion 12 HET FN4498-S Chr6 15758825 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr6 20323142 20323149 0 0 Deletion 8 HET FN4498-S Chr6 22357251 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os06g37760 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr6 24531108 24531109 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr6 3779538 3779538 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr6 7381769 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr6 8329705 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr6 8546516 8546516 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr6 8559674 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os06g15100 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4498-S Chr7 11451447 11451454 0 0 Deletion 8 HET FN4498-S Chr7 13991998 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os07g24590 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr7 14110879 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr7 14148063 14148063 0 0 Insertion 50 HET FN4498-S Chr7 14931332 14931348 0 0 Deletion 17 HET FN4498-S Chr7 16998603 Chr6 21004596 Translocation 0 HET FN4498-S Chr7 18184723 18184723 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr7 19603596 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr7 22798753 22798760 0 0 Deletion 8 HOMO FN4498-S Chr7 2417384 2417384 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr7 24335366 24335369 0 0 Deletion 4 HET LOC_Os07g40610 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr7 26765375 26765375 0 0 Insertion 1 HET FN4498-S Chr7 26774183 26774200 0 0 Deletion 18 HET FN4498-S Chr7 3489595 3489595 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr7 423871 592511 0 0 Inversion 168640 HET FN4498-S Chr7 423876 592521 0 0 Inversion 168645 HET FN4498-S Chr7 5493733 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr7 8833360 8833360 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr7 927310 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr8 11044147 11044147 0 0 Insertion 44 HET FN4498-S Chr8 11520003 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr8 13361652 13361666 0 0 Deletion 15 HET FN4498-S Chr8 13510509 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr8 15539798 15539801 0 0 Deletion 4 HET FN4498-S Chr8 19945355 19945355 0 0 Insertion 7 HET FN4498-S Chr8 20164254 20164254 0 0 Insertion 106 HET FN4498-S Chr8 2272854 2272854 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr8 5704069 5704070 0 0 Deletion 2 HET FN4498-S Chr8 6165890 6165890 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr8 6688550 6688550 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr9 11058825 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4498-S Chr9 14134995 14134995 0 0 Insertion 11 HET FN4498-S Chr9 19740806 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr9 20104239 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4498-S Chr9 3178230 3178230 0 0 Insertion 2 HOMO FN4498-S Chr9 4590610 4590610 0 0 Deletion 1 HET FN4498-S Chr9 5517624 5517624 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os09g10140 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4498-S Chr9 7385407 7385407 0 0 Insertion 2 HET