FN4713-S Chr1 10424099 10424099 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr1 11184022 11184022 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os01g19720 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr1 12434839 12434839 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr1 12973391 12973391 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 13644667 13644667 0 0 Insertion 6 HET FN4713-S Chr1 13864321 13864334 0 0 Deletion 14 HET FN4713-S Chr1 15314768 15314768 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 15602530 15602546 0 0 Deletion 17 HET FN4713-S Chr1 15753846 15753846 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 16842151 16842153 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os01g29910 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr1 1824554 1824554 0 0 Insertion 62 HET FN4713-S Chr1 19859248 19859248 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 2186291 2186291 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os01g04780 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr1 22204161 22204161 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 22683720 22683720 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 23062464 23062464 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 23783012 23783012 0 0 Insertion 46 HET FN4713-S Chr1 26020394 26020394 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 26382027 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr1 28128011 28128011 0 0 Deletion 1 HOMO FN4713-S Chr1 28925543 28925543 0 0 Insertion 42 HET FN4713-S Chr1 29861491 29861493 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os01g51950 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr1 31418870 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr1 32403175 32403178 0 0 Deletion 4 HET FN4713-S Chr1 34011951 34011959 0 0 Deletion 9 HET FN4713-S Chr1 35047848 35047848 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr1 35938629 35938631 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr1 36569903 36569916 0 0 Deletion 14 HET FN4713-S Chr1 43264101 43264107 0 0 Deletion 7 HET FN4713-S Chr1 8338422 8338427 0 0 Deletion 6 HET FN4713-S Chr1 9956968 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr10 10042021 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os10g20020 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 10048241 10048241 0 0 Insertion 3 HET FN4713-S Chr10 10067093 10067093 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 10274441 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os10g20430 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr10 12599310 12599329 0 0 Deletion 20 HET FN4713-S Chr10 14393678 14393688 0 0 Deletion 11 HET FN4713-S Chr10 15069317 15069317 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr10 15179631 15179631 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 16577859 16577859 0 0 Deletion 1 HOMO FN4713-S Chr10 16879628 16879628 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os10g32124 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 18044504 18044504 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 20340780 20340780 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 21685681 21685681 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr10 22897618 22897629 0 0 Deletion 12 HET LOC_Os10g42470 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3075284 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os10g06050 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3219385 3219385 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 3243880 3243880 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 3284305 3284305 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os10g06390 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 3480096 Chr2 670580 Translocation 0 HET FN4713-S Chr10 3480686 Chr4 34612287 Translocation 0 HET FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06730 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06740 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06760 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06770 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06780 protein kinase domain containing protein, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06790 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06800 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06810 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06820 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06830 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06840 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06860 FAR1 family protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06890 zinc finger, SWIM-type, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06900 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06910 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06920 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06930 mitogen-activated protein kinase 15, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06939 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06950 calcium-dependent protein kinase 12, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06960 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06970 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06980 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g06990 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g07000 hypothetical protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g07004 expressed protein FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g07010 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed FN4713-S Chr10 3481001 3695000 0 0 Deletion 214000 HET LOC_Os10g07030 expressed protein FN4713-S Chr10 3573049 3573049 0 0 Insertion 3 HET LOC_Os10g06840 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 3756918 3756927 0 0 Deletion 10 HET FN4713-S Chr10 4528745 4528754 0 0 Deletion 10 HET FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08520 hypothetical protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08530 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08540 cytochrome P450, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08550 enolase, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08560 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08570 RNA recognition motif family protein, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08580 FAD binding domain of DNA photolyase domain containing protein, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08590 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08599 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08610 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08620 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08630 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08640 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08650 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08660 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08670 chalcone synthase, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08680 conserved hypothetical protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08690 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08696 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08702 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08710 chalcone synthase, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08720 hypothetical protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08730 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08740 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08750 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08754 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08760 hypothetical protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08780 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08790 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08800 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08810 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08820 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08830 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08840 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08850 nodulin, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08879 nucleotide-sensitive chloride conductance regulator containing protein, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08910 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08920 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08930 S10/S20 domain containing ribosomal protein, putative, expressed FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08940 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08950 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08960 expressed protein FN4713-S Chr10 4617001 4851000 0 0 Deletion 234000 HET LOC_Os10g08970 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 5019579 5019584 0 0 Deletion 6 HET FN4713-S Chr10 5123859 5123859 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 5172216 5172216 0 0 Insertion 17 HET FN4713-S Chr10 5182266 5182266 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09740 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09750 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09760 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09770 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09780 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09790 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09800 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09810 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09820 no apical meristem protein, putative, expressed FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09830 expressed protein FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09850 EF hand family protein, putative, expressed FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09860 chalcone synthase, putative, expressed FN4713-S Chr10 5266001 5347000 0 0 Deletion 81000 HET LOC_Os10g09870 HVA22, putative, expressed FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09890 hypothetical protein FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09900 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09910 expressed protein FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09920 LTPL132 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09930 expressed protein FN4713-S Chr10 5360001 5393000 0 0 Deletion 33000 HET LOC_Os10g09940 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4713-S Chr10 5401918 5401918 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g09970 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g09990 cytokinin-O-glucosyltransferase 3, putative, expressed FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10000 expressed protein FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10010 hypothetical protein FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10020 expressed protein FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10030 OsWAK111 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10040 cytochrome P450, putative, expressed FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10050 expressed protein FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10060 expressed protein FN4713-S Chr10 5408001 5511000 0 0 Deletion 103000 HET LOC_Os10g10080 exostosin family domain containing protein, expressed FN4713-S Chr10 5409757 5409757 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 5514001 5549000 0 0 Deletion 35000 HET LOC_Os10g10100 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 5514001 5549000 0 0 Deletion 35000 HET LOC_Os10g10110 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr10 5514001 5549000 0 0 Deletion 35000 HET LOC_Os10g10130 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed FN4713-S Chr10 5528250 5528250 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 5588025 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr10 5588026 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr10 5671001 5692000 0 0 Deletion 21000 HET LOC_Os10g10320 expressed protein FN4713-S Chr10 5671001 5692000 0 0 Deletion 21000 HET LOC_Os10g10334 expressed protein FN4713-S Chr10 5671001 5692000 0 0 Deletion 21000 HET LOC_Os10g10350 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr10 5892515 5892515 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 6324404 6324404 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 6326283 6326283 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 701639 701640 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr10 7068439 7068441 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr10 7080943 7080943 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 8336442 8336442 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr10 8388381 8388381 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr10 9218590 9218604 0 0 Deletion 15 HET FN4713-S Chr11 10599395 10599395 0 0 Deletion 1 HOMO LOC_Os11g18710 expressed protein FN4713-S Chr11 11173699 11173699 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr11 12108413 12108413 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 12317372 12317372 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 13356703 13356703 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os11g23200 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr11 13426060 13426060 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 14068798 14068799 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr11 15086416 15086416 0 0 Insertion 4 HET FN4713-S Chr11 15633592 15633592 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 16485055 16485055 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr11 16629562 16629562 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 16716218 16716218 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 18726225 18726225 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr11 19157316 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr11 22505826 22505826 0 0 Insertion 115 HET FN4713-S Chr11 23721245 23721245 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr11 23768115 23768115 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os11g39870 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr11 25072336 25072336 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os11g41760 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr11 25683696 25683696 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr11 25692687 25692687 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr11 26157080 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr11 26622499 26622499 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 2695005 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr11 27039209 27039209 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr11 27463442 27463513 0 0 Deletion 72 HET FN4713-S Chr11 28352361 28352361 0 0 Insertion 40 HET FN4713-S Chr11 492334 492335 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr11 4957334 4957357 0 0 Deletion 24 HET LOC_Os11g09250 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr11 6821015 6821016 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr11 7952584 7952584 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 8088490 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr11 8180483 8180486 0 0 Deletion 4 HET FN4713-S Chr11 9040401 9040401 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr11 9150219 9150219 0 0 Deletion 1 HOMO LOC_Os11g16530 mal, putative, expressed FN4713-S Chr11 9882198 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr12 10033322 10033322 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os12g17510 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr12 12059218 12059218 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 12663077 12663077 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 12766914 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr12 13361956 13361956 0 0 Insertion 4 HET FN4713-S Chr12 13390311 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr12 14137706 14137706 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr12 14279212 14279212 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os12g24890 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr12 15540968 15540968 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr12 16949077 16949077 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 17115290 17115290 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 18132684 18132684 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os12g30214 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr12 18132738 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os12g30214 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr12 18132852 18132852 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr12 18435672 18435672 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 18826500 18826500 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os12g31280 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class FN4713-S Chr12 19017568 19017568 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 20726635 20726654 0 0 Deletion 20 HET FN4713-S Chr12 2115006 2115006 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 21358901 21358901 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 2998730 2998730 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 2998737 2998737 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 4131798 4131798 0 0 Insertion 16 HET FN4713-S Chr12 4277147 4277147 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr12 8218403 8218403 0 0 Insertion 2 HET LOC_Os12g14420 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr12 9150145 9150146 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr12 9452541 9452541 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr2 10005624 10005624 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 11546562 11546562 0 0 Insertion 4 HET FN4713-S Chr2 12571117 12571117 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 13636193 13636234 0 0 Deletion 42 HET FN4713-S Chr2 14767637 14767637 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os02g25330 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr2 1922610 Chr1 33520969 Translocation 0 HET FN4713-S Chr2 20743416 20743416 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr2 21223828 21223828 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 21674243 21674243 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr2 22613716 22613716 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 23236071 23236071 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr2 23780566 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr2 25300498 25300498 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 2706071 2706071 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os02g05570 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class FN4713-S Chr2 29753512 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os02g48600 expressed protein FN4713-S Chr2 30190701 30190702 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os02g49400 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr2 31638520 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr2 33502228 33502228 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr2 33575254 33575254 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr2 33706081 33706083 0 0 Deletion 3 HOMO LOC_Os02g55010 expressed protein FN4713-S Chr2 6881231 6881231 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os02g12980 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr2 9032663 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr2 9637938 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 1258553 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 13352380 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 13369901 13369901 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 13485337 13485339 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr3 17629651 17629654 0 0 Deletion 4 HET FN4713-S Chr3 17767447 17767449 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os03g31200 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4713-S Chr3 18960402 18960402 0 0 Insertion 4 HET LOC_Os03g33140 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr3 19640311 19640311 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 19709953 19709976 0 0 Deletion 24 HET LOC_Os03g35560 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4713-S Chr3 19746790 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 19770685 19770685 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr3 19781222 19781224 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr3 19857077 19857077 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 20804478 20804478 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr3 21568278 21568278 0 0 Insertion 3 HET FN4713-S Chr3 22841372 22841372 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 25568270 25568270 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 26559864 26559864 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os03g46970 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr3 26757031 26757031 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 26900011 26900026 0 0 Deletion 16 HET FN4713-S Chr3 28019982 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 28044767 28044780 0 0 Deletion 14 HET LOC_Os03g49240 expressed protein FN4713-S Chr3 28718047 28718059 0 0 Deletion 13 HET FN4713-S Chr3 29762039 29762039 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr3 30930177 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 5706489 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr3 6257999 6257999 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 664894 664894 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr3 8115768 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os03g14890 AGAP008572-PA, putative, expressed FN4713-S Chr3 9280516 9280536 0 0 Deletion 21 HET FN4713-S Chr4 10158458 10158465 0 0 Deletion 8 HET FN4713-S Chr4 10281761 10281761 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 10322075 10322075 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 10487668 10487668 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 10548414 10548420 0 0 Deletion 7 HET LOC_Os04g18980 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr4 1104389 1104389 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 11182996 11182996 0 0 Insertion 15 HET FN4713-S Chr4 13306934 13306934 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 13537384 13537384 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 13731531 13731531 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 13731582 13731582 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 15267460 15267460 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 1567259 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr4 15715307 15715307 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 15903728 15903728 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 16246135 16246135 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 21020644 21020730 0 0 Deletion 87 HET FN4713-S Chr4 22697409 22697409 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 24548516 Chr3 3032708 Translocation 0 HOMO FN4713-S Chr4 24549557 Chr3 3032697 Translocation 0 HOMO FN4713-S Chr4 2586849 2586849 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 27007832 27007833 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr4 30405277 30405277 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 32920847 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr4 34032517 34032518 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os04g57110 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr4 34600245 34600245 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 34611636 Chr2 670611 Translocation 0 HET FN4713-S Chr4 35261571 35261571 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr4 5770706 5770706 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr4 5784208 5784208 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 6745825 6745825 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os04g12230 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr4 7238958 7238958 0 0 Insertion 6 HET FN4713-S Chr4 7738494 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr4 7793373 7793373 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr4 9835295 9835296 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os04g17890 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr5 10000302 10000302 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 10145633 10145634 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os05g17630 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr5 10591073 10591073 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 10622104 10622104 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 10724235 10724235 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr5 11130990 11130990 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 11140225 11140225 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 11176743 11176743 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 11525637 11525637 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 11526210 11526210 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 11988951 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os05g20430 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr5 12075856 12075856 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 12952156 12952156 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 14248420 14248420 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 15012379 15012379 0 0 Insertion 28 HET FN4713-S Chr5 15971443 15971443 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr5 18878436 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr5 21989314 21989314 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os05g37580 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr5 22232098 22232098 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 23719110 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr5 23890190 23890190 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 24884813 24884842 0 0 Deletion 30 HET FN4713-S Chr5 26916891 26916891 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 27276306 27276306 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os05g47610 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr5 29879238 29879238 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 3181001 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr5 3884937 3884937 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os05g07310 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr5 3921096 3921098 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr5 571305 571305 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 6652240 6652240 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 7261195 7261195 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr5 7789398 7789398 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os05g13990 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr5 8763698 8763698 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 8819528 8819528 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr5 9675794 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr6 102613 102635 0 0 Deletion 23 HET FN4713-S Chr6 11480235 11480235 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr6 11941538 11941538 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os06g20730 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4713-S Chr6 1284839 1284867 0 0 Deletion 29 HET FN4713-S Chr6 18648236 18648236 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os06g32060 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr6 20376991 20376991 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr6 20389245 20389262 0 0 Deletion 18 HET LOC_Os06g35040 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr6 2105360 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr6 21789993 21789993 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr6 21920856 21920856 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr6 2195880 2195880 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr6 22419689 22419712 0 0 Deletion 24 HET FN4713-S Chr6 24550144 24550144 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 25377852 25377852 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr6 2550402 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr6 25817953 25817955 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr6 29193522 29193536 0 0 Deletion 15 HET FN4713-S Chr6 29300028 29300028 0 0 Insertion 31 HET FN4713-S Chr6 29310444 29310444 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 29613748 29613748 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 29909392 29909411 0 0 Deletion 20 HET FN4713-S Chr6 29914096 29914096 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 29973722 29973722 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr6 3674996 3674996 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 4745706 4745708 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr6 5322872 5322872 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 5483038 5483049 0 0 Deletion 12 HET FN4713-S Chr6 5599467 5599467 0 0 Insertion 4 HET FN4713-S Chr6 63054 63055 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr6 8591280 8591280 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 8806842 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr6 9010070 9010070 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr6 9948568 9948568 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os06g17160 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr7 10226090 10226090 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 10689181 10689181 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os07g18060 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr7 10967417 10967418 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os07g18530 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr7 11811826 11811837 0 0 Deletion 12 HET FN4713-S Chr7 12841341 12841341 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr7 14696082 14696082 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os07g25630 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr7 15827465 15827509 0 0 Deletion 45 HET FN4713-S Chr7 16643871 16643872 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr7 17732737 17732769 0 0 Deletion 33 HET FN4713-S Chr7 24131678 24131678 0 0 Insertion 53 HET FN4713-S Chr7 26198954 26198954 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os07g43780 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4713-S Chr7 27362691 27362697 0 0 Deletion 7 HET FN4713-S Chr7 3291978 3291978 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 6013040 6013040 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr7 6049226 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr7 6384770 6384770 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 6555418 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr7 6649414 6649414 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 7882039 7882041 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr7 8275735 8275735 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 9759239 9759239 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr7 9793142 9793142 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr7 9800906 9800906 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr7 9953565 9953565 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 10863963 10863963 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 11825142 11825142 0 0 Insertion 78 HET FN4713-S Chr8 12039186 12039186 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr8 12548349 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os08g20952 retrotransposon protein, putative, unclassified FN4713-S Chr8 13866577 13866577 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os08g23020 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4713-S Chr8 14004537 14004537 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 1417392 1417403 0 0 Deletion 12 HET FN4713-S Chr8 1474088 1474089 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr8 17056951 17056951 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os08g27990 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr8 17077937 17077953 0 0 Deletion 17 HET FN4713-S Chr8 17278684 17278684 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 17983830 17983844 0 0 Deletion 15 HET FN4713-S Chr8 18910341 18910341 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 21147069 21147071 0 0 Deletion 3 HET FN4713-S Chr8 21921897 21921897 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 24502364 24502364 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 24708410 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr8 24813537 24813537 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os08g39260 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4713-S Chr8 25183551 25183571 0 0 Deletion 21 HET FN4713-S Chr8 26918970 26918970 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 27975666 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr8 4522754 4522754 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 4754318 4754318 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 5045955 5045961 0 0 Deletion 7 HET FN4713-S Chr8 5559955 5559955 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 6369051 6369051 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 6490988 6490988 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 7189549 7189549 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr8 7315208 7315208 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 8401645 8401645 0 0 Insertion 3 HET FN4713-S Chr8 8500155 8500155 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr8 9315264 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr8 9866852 9866852 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os08g16180 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4713-S Chr9 1024844 1024844 0 0 Insertion 2 HET FN4713-S Chr9 12060476 12060477 0 0 Deletion 2 HET FN4713-S Chr9 12901131 12901131 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 1436905 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4713-S Chr9 17057864 17057864 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr9 181242 181242 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 22456585 22456596 0 0 Deletion 12 HET FN4713-S Chr9 22886602 22886602 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 2962177 2962177 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 3260785 3260785 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 4183164 4183164 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr9 4803131 4803131 0 0 Deletion 1 HET FN4713-S Chr9 5756084 5756084 0 0 Insertion 9 HET FN4713-S Chr9 6413842 6413842 0 0 Insertion 1 HET FN4713-S Chr9 7369753 7369792 0 0 Deletion 40 HET FN4713-S Chr9 9157084 9157084 0 0 Insertion 53 HET FN4713-S Chr9 9676857 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4713-S Chr9 9990744 9990744 0 0 Insertion 1 HET