FN4862-S Chr1 15165730 15165732 0 0 Deletion 3 HOMO FN4862-S Chr1 20169290 20169290 0 0 Insertion 2 HET FN4862-S Chr1 20570480 20570480 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr1 21525647 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr1 33576628 33576628 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr1 35305386 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr1 39416958 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr1 41891679 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr1 42588613 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr10 10314680 10314778 0 0 Deletion 99 HET FN4862-S Chr10 12451830 12451830 0 0 Insertion 2 HET FN4862-S Chr10 13395688 13395688 0 0 Insertion 4 HET FN4862-S Chr10 17561535 17561535 0 0 Deletion 1 HOMO FN4862-S Chr10 19123557 19123626 0 0 Deletion 70 HET FN4862-S Chr10 5102586 5102622 0 0 Deletion 37 HET LOC_Os10g09460 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4862-S Chr10 6625968 6625968 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr11 11043849 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr11 11291614 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os11g19590 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4862-S Chr11 12096620 12096620 0 0 Insertion 80 HET FN4862-S Chr11 14992007 14992007 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr11 18755376 18755376 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr11 19769404 Chr2 19964341 Translocation 0 HET FN4862-S Chr11 19795127 19795129 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os11g33454 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4862-S Chr11 26147165 26147165 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr11 26537400 26537400 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr11 27146858 27146858 0 0 Insertion 28 HET FN4862-S Chr11 4780578 4780580 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os11g09000 transposon protein, putative, unclassified FN4862-S Chr11 4838495 4838495 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr11 6305401 6305401 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr11 9922579 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr12 14133670 14133702 0 0 Deletion 33 HET LOC_Os12g24680 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4862-S Chr12 17165668 17165668 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr12 3270584 C-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os12g06720 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4862-S Chr12 3760330 3760339 0 0 Deletion 10 HET FN4862-S Chr12 4512001 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr12 7424845 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr2 10998372 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr2 14668769 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr2 15003444 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os02g25650 expressed protein FN4862-S Chr2 16997009 16997009 0 0 Insertion 5 HOMO FN4862-S Chr2 185979 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr2 22973093 23152749 0 0 Inversion 179656 HET LOC_Os02g38290 cytochrome P450, putative, expressed FN4862-S Chr2 23548822 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os02g38970 expressed protein FN4862-S Chr2 25841628 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr2 3659246 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr2 9198288 9198288 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr3 1046534 1046534 0 0 Insertion 1 HOMO FN4862-S Chr3 13399505 13399505 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr3 13479599 13479867 0 0 Deletion 269 HET FN4862-S Chr3 13503100 13503104 0 0 Deletion 5 HET FN4862-S Chr3 13525733 13525734 0 0 Deletion 2 HET FN4862-S Chr3 33742528 33742955 0 0 Inversion 427 HET FN4862-S Chr3 8369184 8369184 0 0 Insertion 87 HET FN4862-S Chr3 8979539 8979539 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr3 996193 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr4 10015592 10015592 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr4 11993956 11993957 0 0 Deletion 2 HET FN4862-S Chr4 13754369 13754369 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr4 15439170 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr4 1774575 1774575 0 0 Insertion 83 HET FN4862-S Chr4 18571871 18571871 0 0 Insertion 63 HET FN4862-S Chr4 26190331 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr4 29378842 29378842 0 0 Insertion 2 HET FN4862-S Chr4 30674010 30674010 0 0 Insertion 13 HET FN4862-S Chr4 4339294 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr4 8682111 8682111 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr4 9626315 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr5 15431998 15431998 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr5 19836715 19836715 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr5 20080844 20080844 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr5 21307838 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr5 21854550 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr5 2747942 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr5 28981387 28981387 0 0 Insertion 21 HET LOC_Os05g50540 retrotransposon protein, putative, unclassified FN4862-S Chr5 8761021 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr5 8835501 8835524 0 0 Deletion 24 HET FN4862-S Chr6 1031964 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr6 12159237 12159237 0 0 Insertion 2 HET FN4862-S Chr6 16630623 16630623 0 0 Insertion 1 HET LOC_Os06g29140 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4862-S Chr6 17119256 17555208 0 0 Inversion 435952 HET FN4862-S Chr6 17119273 17555217 0 0 Inversion 435944 HET FN4862-S Chr6 29973101 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr6 449557 449558 0 0 Deletion 2 HET FN4862-S Chr6 8204456 8204456 0 0 Insertion 12 HET LOC_Os06g14570 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4862-S Chr7 10465621 10465621 0 0 Insertion 4 HET FN4862-S Chr7 1535226 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4862-S Chr7 16062022 16062022 0 0 Insertion 4 HET FN4862-S Chr7 17385277 17385277 0 0 Insertion 10 HET FN4862-S Chr7 20979321 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr7 21189031 21189042 0 0 Deletion 12 HET FN4862-S Chr7 24542516 24542516 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr7 26227806 26227806 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr7 5719782 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4862-S Chr7 9846175 9846175 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr7 9892461 9892461 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr8 14242226 14242226 0 0 Insertion 4 HET FN4862-S Chr8 21294944 21294944 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr8 25987762 25987762 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr8 26956438 26956438 0 0 Deletion 1 HET FN4862-S Chr8 4823846 4823871 0 0 Deletion 26 HET LOC_Os08g08370 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4862-S Chr8 5440131 5440161 0 0 Deletion 31 HET FN4862-S Chr9 12792840 12792840 0 0 Insertion 1 HET FN4862-S Chr9 14689801 14869659 0 0 Inversion 179858 HET LOC_Os09g24680 pentatricopeptide, putative, expressed