FN4872-S Chr1 14603420 G-C 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr1 14611368 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os01g25800 expressed protein FN4872-S Chr1 14611372 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO LOC_Os01g25800 expressed protein FN4872-S Chr1 17634591 17634591 0 0 Insertion 81 HET FN4872-S Chr1 18594891 18594892 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr1 21120832 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr1 22228238 22228276 0 0 Deletion 39 HET LOC_Os01g39464 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4872-S Chr1 24191400 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr1 27337303 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os01g47770 CS domain containing protein, putative, expressed FN4872-S Chr1 28306762 28306762 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr1 28988811 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr1 31195467 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr1 40074637 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr1 43149559 43149559 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr1 4757561 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr10 15678098 15998869 0 0 Inversion 320771 HET FN4872-S Chr10 15680265 16150490 0 0 Inversion 470225 HET LOC_Os10g30156 starch synthase, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30750 appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30760 pentatricopeptide, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30770 inorganic phosphate transporter, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30790 inorganic phosphate transporter, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30800 expressed protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30820 expressed protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30826 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30832 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30840 AP2 domain containing protein, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30850 zinc finger, RING-type, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30860 nicotiana lesion-inducing like, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30870 expressed protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30880 expressed protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30890 expressed protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30900 hypothetical protein FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30910 transmembrane protein-related, putative, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30930 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr10 16015001 16151000 0 0 Deletion 136000 HET LOC_Os10g30944 expressed protein FN4872-S Chr10 6606342 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr10 7701842 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr10 8313959 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os10g16670 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr10 8557724 8557727 0 0 Deletion 4 HET FN4872-S Chr10 8920462 8920470 0 0 Deletion 9 HET FN4872-S Chr11 14735412 Chr7 15984557 Translocation 0 HET FN4872-S Chr11 14736087 Chr7 15984578 Translocation 0 HET FN4872-S Chr11 15578672 15578672 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr11 17721043 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr11 17728297 17728329 0 0 Deletion 33 HOMO FN4872-S Chr11 22751784 22751790 0 0 Deletion 7 HOMO FN4872-S Chr11 22794299 22794299 0 0 Insertion 39 HET FN4872-S Chr11 25386036 25386036 0 0 Insertion 84 HET FN4872-S Chr11 27620747 27620845 0 0 Deletion 99 HET FN4872-S Chr11 27625718 27625718 0 0 Insertion 2 HET FN4872-S Chr11 27678413 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr11 5200179 5200203 0 0 Deletion 25 HOMO FN4872-S Chr11 6320325 6320487 0 0 Deletion 163 HET FN4872-S Chr11 7812582 7812582 0 0 Deletion 1 HOMO FN4872-S Chr12 11007901 11007901 0 0 Insertion 2 HOMO FN4872-S Chr12 13122681 13789299 0 0 Inversion 666618 HET FN4872-S Chr12 13122689 13789300 0 0 Inversion 666611 HET FN4872-S Chr12 13692477 T-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr12 17680366 17680366 0 0 Insertion 42 HET FN4872-S Chr12 1912059 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr12 22442640 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr12 23754643 23754643 0 0 Insertion 2 HET FN4872-S Chr12 25627668 25627676 0 0 Deletion 9 HOMO LOC_Os12g41350 meiotic asynaptic mutant 1, putative, expressed FN4872-S Chr12 25718277 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr12 26187457 26187488 0 0 Deletion 32 HET FN4872-S Chr12 2625654 2625654 0 0 Insertion 1 HOMO FN4872-S Chr2 14856111 14856111 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr2 16950516 16950516 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr2 1705226 1705226 0 0 Insertion 4 HET FN4872-S Chr2 17832932 17832932 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr2 17891277 17891277 0 0 Insertion 51 HET FN4872-S Chr2 18688409 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr2 20016367 20016694 0 0 Deletion 328 HET FN4872-S Chr2 23462455 23462455 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41710 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41720 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41730 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41740 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41750 transposon protein, putative, unclassified FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41760 NB-ARC domain containing protein, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41770 uncharacterized protein PA4923, putative, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41780 transporter-related, putative, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41790 transposon protein, putative, Ac/Ds sub-class FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41800 auxin response factor, putative, expressed FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41810 expressed protein FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41820 expressed protein FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41830 expressed protein FN4872-S Chr2 25045001 25155000 0 0 Deletion 110000 HET LOC_Os02g41840 DUF584 domain containing protein, putative, expressed FN4872-S Chr2 253772 253772 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr2 27289974 27290017 0 0 Deletion 44 HET FN4872-S Chr2 31226408 31226408 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr2 31619160 31619172 0 0 Deletion 13 HET FN4872-S Chr2 35345387 35345400 0 0 Deletion 14 HET LOC_Os02g57710 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed FN4872-S Chr2 35373384 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os02g57760 O-methyltransferase, putative, expressed FN4872-S Chr2 6294796 6294796 0 0 Deletion 1 HOMO FN4872-S Chr2 7348073 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr3 14716160 14716160 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr3 15859880 15859880 0 0 Insertion 2 HET FN4872-S Chr3 17364983 17364985 0 0 Deletion 3 HET LOC_Os03g30450 retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed FN4872-S Chr3 19191737 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr3 19686782 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os03g35520 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass FN4872-S Chr3 20803562 20803563 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr3 20886990 20886992 0 0 Deletion 3 HET FN4872-S Chr3 21502197 21502216 0 0 Deletion 20 HET LOC_Os03g38740 Dicer, putative, expressed FN4872-S Chr3 23129324 23129343 0 0 Deletion 20 HET FN4872-S Chr3 25388899 25388899 0 0 Insertion 31 HET FN4872-S Chr3 33496354 33496355 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr3 36156175 36156175 0 0 Insertion 6 HET FN4872-S Chr3 36224916 36224917 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr3 6106320 A-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr4 11984242 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr4 13072467 13072468 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr4 13196031 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr4 15135652 15135869 0 0 Deletion 218 HET FN4872-S Chr4 1700804 1700931 0 0 Inversion 127 HET FN4872-S Chr4 18347255 18347255 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr4 19604078 19604086 0 0 Deletion 9 HOMO FN4872-S Chr4 2034630 2034631 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr4 20974079 20974079 0 0 Insertion 6 HET FN4872-S Chr4 21828019 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr4 23205530 T-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr4 24563404 24563404 0 0 Insertion 43 HET FN4872-S Chr4 30820448 30820452 0 0 Deletion 5 HET FN4872-S Chr4 3700240 3700240 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr4 7618518 7618518 0 0 Insertion 4 HET FN4872-S Chr5 11023810 11023810 0 0 Insertion 45 HET FN4872-S Chr5 11434206 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os05g19620 expressed protein FN4872-S Chr5 16070146 16070146 0 0 Insertion 2 HET FN4872-S Chr5 17248510 17248510 0 0 Insertion 45 HET FN4872-S Chr5 17878543 17878543 0 0 Insertion 75 HET FN4872-S Chr5 19766461 19766461 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr5 22508052 22508053 0 0 Deletion 2 HET FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38790 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38800 PWWP domain containing protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38810 PWWP domain containing protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38820 histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38830 HECT-domain domain containing protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38840 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38850 MCM8 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 8, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38860 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38870 conserved hypothetical protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38880 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38890 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38900 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38910 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38920 transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38930 hypothetical protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38940 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38950 TBC domain containing protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38960 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38980 respiratory burst oxidase, putative, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38984 expressed protein FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g38990 CCT motif family protein, expressed FN4872-S Chr5 22753001 22883000 0 0 Deletion 130000 HET LOC_Os05g39000 KIP1, putative, expressed FN4872-S Chr5 25732012 25732012 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr5 27403303 27403303 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr5 5356217 5356217 0 0 Insertion 4 HET FN4872-S Chr5 6434802 6434812 0 0 Deletion 11 HET FN4872-S Chr5 6710307 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr5 6765913 6765918 0 0 Deletion 6 HOMO FN4872-S Chr6 10042521 10042534 0 0 Deletion 14 HET FN4872-S Chr6 1029607 1029612 0 0 Deletion 6 HET FN4872-S Chr6 114527 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22200 expressed protein FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22210 transposon protein, putative, unclassified FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22220 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22230 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22240 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4872-S Chr6 12879001 12921000 0 0 Deletion 42000 HOMO LOC_Os06g22260 conserved hypothetical protein FN4872-S Chr6 13673447 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr6 19551912 19551919 0 0 Deletion 8 HET FN4872-S Chr6 19712055 19712062 0 0 Deletion 8 HET FN4872-S Chr6 20136156 20136158 0 0 Deletion 3 HET FN4872-S Chr6 21396519 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr6 21694693 21694693 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr6 26519411 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr6 27965814 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr6 28977950 28977950 0 0 Deletion 1 HET LOC_Os06g47900 expressed protein FN4872-S Chr6 29337801 29337852 0 0 Deletion 52 HET FN4872-S Chr6 348267 348422 0 0 Deletion 156 HET LOC_Os06g01590 lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed FN4872-S Chr6 7774776 7774776 0 0 Insertion 5 HET FN4872-S Chr6 9711298 9711301 0 0 Deletion 4 HET FN4872-S Chr7 11606141 11606141 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr7 12248590 12248590 0 0 Insertion 4 HET FN4872-S Chr7 15128156 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr7 17696653 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr7 20725571 20725571 0 0 Deletion 1 HOMO FN4872-S Chr7 20777353 20777356 0 0 Deletion 4 HOMO FN4872-S Chr7 23232380 23232380 0 0 Insertion 56 HET FN4872-S Chr7 2372695 A-G 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr7 25628745 25628752 0 0 Deletion 8 HOMO FN4872-S Chr7 29320877 29320877 0 0 Deletion 1 HET FN4872-S Chr7 3630565 3630572 0 0 Deletion 8 HET FN4872-S Chr7 551222 A-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr7 6490423 6490423 0 0 Insertion 1 HET FN4872-S Chr8 11309943 T-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr8 14131266 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr8 14336763 14336763 0 0 Insertion 16 HET FN4872-S Chr8 1454952 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HOMO FN4872-S Chr8 16260544 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os08g26730 retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr8 16458767 16458770 0 0 Deletion 4 HET FN4872-S Chr8 16538787 16538788 0 0 Deletion 2 HET LOC_Os08g27070 co-chaperone protein SBA1, putative, expressed FN4872-S Chr8 19977055 G-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os08g32240 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed FN4872-S Chr8 2103561 2103586 0 0 Deletion 26 HET FN4872-S Chr8 25552116 25552143 0 0 Deletion 28 HET FN4872-S Chr8 27441796 27441798 0 0 Deletion 3 HET FN4872-S Chr8 2831615 2831619 0 0 Deletion 5 HET FN4872-S Chr8 3995432 3995482 0 0 Deletion 51 HET LOC_Os08g07130 transposon protein, putative, unclassified, expressed FN4872-S Chr8 4076654 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET LOC_Os08g07290 HEAT repeat family protein, putative, expressed FN4872-S Chr8 4685227 C-A 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr8 6072687 A-C 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr8 775299 775340 0 0 Deletion 42 HET FN4872-S Chr8 8142700 8142702 0 0 Deletion 3 HET FN4872-S Chr9 13250478 C-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr9 13941412 13941422 0 0 Deletion 11 HOMO FN4872-S Chr9 18829377 G-T 0 0 Single Base Substitution 0 HET FN4872-S Chr9 2370519 2370534 0 0 Deletion 16 HET