Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4382-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4382-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 32

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 4421088 T-C HET
SBS Chr1 6653636 A-G HET
SBS Chr1 8643258 C-T HET
SBS Chr1 18135457 A-T HET
SBS Chr1 34933570 C-T HET
SBS Chr1 42515212 G-A HET
SBS Chr2 3482211 C-T HET
SBS Chr2 4606035 C-A HET
SBS Chr2 14372630 C-T HET
SBS Chr2 15715551 C-T HET
SBS Chr2 17168994 G-C HET
SBS Chr3 1405084 T-A HET
SBS Chr3 5650962 G-A HET
SBS Chr3 7068875 C-T HET
SBS Chr3 17020930 C-G HET
SBS Chr3 20926462 A-G HET
SBS Chr3 28362323 G-A HET
SBS Chr4 4477834 C-T HET
SBS Chr4 7401645 T-A HET OsKitaake04g037600
SBS Chr4 7401646 G-A HET
SBS Chr4 7401670 G-A HET
SBS Chr5 11645099 C-T HOMO
SBS Chr5 22897563 G-A HOMO
SBS Chr7 10564726 G-A HET
SBS Chr7 11154988 G-A HET
SBS Chr7 11584468 T-A HET
SBS Chr7 17287334 A-T HET
SBS Chr10 23865930 G-A HET OsKitaake10g205400
SBS Chr11 2613505 T-C HET
SBS Chr11 10081154 T-C HOMO
SBS Chr11 15757283 G-A HET
SBS Chr12 6285813 C-A HET

Deletions: 10

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr5 1382200 1382202 3
Deletion Chr6 2602220 2602220 1
Deletion Chr3 7027870 7027870 1
Deletion Chr4 10461475 10461475 1
Deletion Chr4 11929575 11929575 1
Deletion Chr9 13438218 13438219 2
Deletion Chr3 17324381 17324381 1
Deletion Chr1 20583527 20583528 2
Deletion Chr1 24131584 24131584 1
Deletion Chr1 39243198 39243201 4

Insertions: 6

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 16469569 16469571 1
Insertion Chr7 18096829 18096831 1
Insertion Chr11 12445264 12445318 53
Insertion Chr11 26579909 26579916 6
Insertion Chr4 24404448 24404450 1
Insertion Chr12 10830633 10830635 1

Inversions: 1

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr3 34821137 34821348

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	4421088	T-C	HET
SBS	Chr1	6653636	A-G	HET
SBS	Chr1	8643258	C-T	HET
SBS	Chr1	18135457	A-T	HET
SBS	Chr1	34933570	C-T	HET
SBS	Chr1	42515212	G-A	HET
SBS	Chr2	3482211	C-T	HET
SBS	Chr2	4606035	C-A	HET
SBS	Chr2	14372630	C-T	HET
SBS	Chr2	15715551	C-T	HET
SBS	Chr2	17168994	G-C	HET
SBS	Chr3	1405084	T-A	HET
SBS	Chr3	5650962	G-A	HET
SBS	Chr3	7068875	C-T	HET
SBS	Chr3	17020930	C-G	HET
SBS	Chr3	20926462	A-G	HET
SBS	Chr3	28362323	G-A	HET
SBS	Chr4	4477834	C-T	HET
SBS	Chr4	7401645	T-A	HET		OsKitaake04g037600
SBS	Chr4	7401646	G-A	HET
SBS	Chr4	7401670	G-A	HET
SBS	Chr5	11645099	C-T	HOMO
SBS	Chr5	22897563	G-A	HOMO
SBS	Chr7	10564726	G-A	HET
SBS	Chr7	11154988	G-A	HET
SBS	Chr7	11584468	T-A	HET
SBS	Chr7	17287334	A-T	HET
SBS	Chr10	23865930	G-A	HET		OsKitaake10g205400
SBS	Chr11	2613505	T-C	HET
SBS	Chr11	10081154	T-C	HOMO
SBS	Chr11	15757283	G-A	HET
SBS	Chr12	6285813	C-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	1382200	1382202	3
Deletion	Chr6	2602220	2602220	1
Deletion	Chr3	7027870	7027870	1
Deletion	Chr4	10461475	10461475	1
Deletion	Chr4	11929575	11929575	1
Deletion	Chr9	13438218	13438219	2
Deletion	Chr3	17324381	17324381	1
Deletion	Chr1	20583527	20583528	2
Deletion	Chr1	24131584	24131584	1
Deletion	Chr1	39243198	39243201	4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	34821137	34821348

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes