Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4389-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4389-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 298650 T-C HET
SBS Chr1 10167647 G-A HET
SBS Chr1 18498386 G-C HET
SBS Chr1 25988728 C-T HOMO
SBS Chr1 40785213 C-T HET
SBS Chr2 3064011 C-T HOMO
SBS Chr2 4913464 G-T HET OsKitaake02g068200
SBS Chr2 14740556 G-A HET
SBS Chr2 19201983 C-T HET
SBS Chr3 17285809 G-A HET OsKitaake03g213600
SBS Chr3 17285812 T-C HET OsKitaake03g213600
SBS Chr3 29793687 C-T HET
SBS Chr3 35435827 A-T HET
SBS Chr4 3352440 A-T HET
SBS Chr4 7624576 G-T HET
SBS Chr4 15824407 G-A HET
SBS Chr4 17465106 G-A HET
SBS Chr4 21309767 C-T HET
SBS Chr5 40803 T-A HET
SBS Chr5 1927246 G-A HET
SBS Chr5 8195579 G-A HOMO OsKitaake05g080300
SBS Chr5 13854132 A-G HET
SBS Chr5 29071336 A-G HET
SBS Chr6 20150105 T-C HET
SBS Chr6 21716849 C-T HET
SBS Chr6 22551126 G-C HET
SBS Chr6 23768916 C-T HET
SBS Chr6 26312921 A-T HET
SBS Chr6 28369062 T-C HET
SBS Chr7 2724733 G-C HET
SBS Chr7 8457174 C-A HET
SBS Chr7 14446042 G-A HET
SBS Chr7 29409053 A-T HOMO
SBS Chr8 7362611 C-T HET
SBS Chr8 11695471 A-G HET
SBS Chr8 12432701 C-T HET
SBS Chr8 18514340 G-A HET
SBS Chr8 24996917 C-T HET
SBS Chr8 28718932 G-T HET OsKitaake08g246500
SBS Chr9 5712686 C-G HOMO
SBS Chr9 8965984 T-A HET
SBS Chr9 12545508 G-A HOMO
SBS Chr10 4878550 G-A HET
SBS Chr10 6431444 T-A HET
SBS Chr10 6431446 T-G HET
SBS Chr11 13094373 T-C HET
SBS Chr11 17688893 T-G HOMO
SBS Chr12 10335348 A-C HET
SBS Chr12 14387592 G-T HET
SBS Chr12 15301983 G-T HET
SBS Chr12 18460024 G-A HET

Deletions: 27

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr3 503910 503920 11
Deletion Chr2 2303940 2303947 8
Deletion Chr2 2776124 2776124 1
Deletion Chr7 3327342 3327342 1
Deletion Chr1 5777728 5777728 1
Deletion Chr5 6015031 6015035 5
Deletion Chr12 6566584 6566584 1
Deletion Chr4 7357579 7357579 1
Deletion Chr6 7747112 7747112 1
Deletion Chr5 8019585 8019586 2 OsKitaake05g079100
Deletion Chr1 9241765 9241765 1 OsKitaake01g118800
Deletion Chr11 13322200 13322200 1
Deletion Chr12 13768625 13768625 1
Deletion Chr7 13934997 13934999 3
Deletion Chr8 14788377 14788377 1
Deletion Chr7 15187200 15187203 4
Deletion Chr5 16002804 16002870 67
Deletion Chr10 17312580 17312580 1
Deletion Chr5 17983001 18003000 20000 5
Deletion Chr9 18290921 18290921 1
Deletion Chr12 24359547 24359547 1
Deletion Chr2 24441878 24441878 1
Deletion Chr4 25393154 25393160 7
Deletion Chr4 25970734 25970743 10
Deletion Chr7 28557635 28557635 1
Deletion Chr2 28742170 28742172 3
Deletion Chr4 28846791 28846791 1

Insertions: 6

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr4 10959393 10959396 2
Insertion Chr6 30801023 30801026 2
Insertion Chr1 7174894 7174896 1
Insertion Chr1 9948931 9948934 2
Insertion Chr4 13087282 13087284 1
Insertion Chr4 20804497 20804500 2

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr11 9443350 9443557
Inversion Chr5 17138101 17286433
Inversion Chr6 19841173 20095259

Translocations: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 17138101 Chr4 19426082
Translocation Chr5 17286439 Chr4 19427409
Translocation Chr6 19841186 Chr5 9883128

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	298650	T-C	HET
SBS	Chr1	10167647	G-A	HET
SBS	Chr1	18498386	G-C	HET
SBS	Chr1	25988728	C-T	HOMO
SBS	Chr1	40785213	C-T	HET
SBS	Chr2	3064011	C-T	HOMO
SBS	Chr2	4913464	G-T	HET		OsKitaake02g068200
SBS	Chr2	14740556	G-A	HET
SBS	Chr2	19201983	C-T	HET
SBS	Chr3	17285809	G-A	HET		OsKitaake03g213600
SBS	Chr3	17285812	T-C	HET		OsKitaake03g213600
SBS	Chr3	29793687	C-T	HET
SBS	Chr3	35435827	A-T	HET
SBS	Chr4	3352440	A-T	HET
SBS	Chr4	7624576	G-T	HET
SBS	Chr4	15824407	G-A	HET
SBS	Chr4	17465106	G-A	HET
SBS	Chr4	21309767	C-T	HET
SBS	Chr5	40803	T-A	HET
SBS	Chr5	1927246	G-A	HET
SBS	Chr5	8195579	G-A	HOMO		OsKitaake05g080300
SBS	Chr5	13854132	A-G	HET
SBS	Chr5	29071336	A-G	HET
SBS	Chr6	20150105	T-C	HET
SBS	Chr6	21716849	C-T	HET
SBS	Chr6	22551126	G-C	HET
SBS	Chr6	23768916	C-T	HET
SBS	Chr6	26312921	A-T	HET
SBS	Chr6	28369062	T-C	HET
SBS	Chr7	2724733	G-C	HET
SBS	Chr7	8457174	C-A	HET
SBS	Chr7	14446042	G-A	HET
SBS	Chr7	29409053	A-T	HOMO
SBS	Chr8	7362611	C-T	HET
SBS	Chr8	11695471	A-G	HET
SBS	Chr8	12432701	C-T	HET
SBS	Chr8	18514340	G-A	HET
SBS	Chr8	24996917	C-T	HET
SBS	Chr8	28718932	G-T	HET		OsKitaake08g246500
SBS	Chr9	5712686	C-G	HOMO
SBS	Chr9	8965984	T-A	HET
SBS	Chr9	12545508	G-A	HOMO
SBS	Chr10	4878550	G-A	HET
SBS	Chr10	6431444	T-A	HET
SBS	Chr10	6431446	T-G	HET
SBS	Chr11	13094373	T-C	HET
SBS	Chr11	17688893	T-G	HOMO
SBS	Chr12	10335348	A-C	HET
SBS	Chr12	14387592	G-T	HET
SBS	Chr12	15301983	G-T	HET
SBS	Chr12	18460024	G-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	503910	503920	11
Deletion	Chr2	2303940	2303947	8
Deletion	Chr2	2776124	2776124	1
Deletion	Chr7	3327342	3327342	1
Deletion	Chr1	5777728	5777728	1
Deletion	Chr5	6015031	6015035	5
Deletion	Chr12	6566584	6566584	1
Deletion	Chr4	7357579	7357579	1
Deletion	Chr6	7747112	7747112	1
Deletion	Chr5	8019585	8019586	2	OsKitaake05g079100
Deletion	Chr1	9241765	9241765	1	OsKitaake01g118800
Deletion	Chr11	13322200	13322200	1
Deletion	Chr12	13768625	13768625	1
Deletion	Chr7	13934997	13934999	3
Deletion	Chr8	14788377	14788377	1
Deletion	Chr7	15187200	15187203	4
Deletion	Chr5	16002804	16002870	67
Deletion	Chr10	17312580	17312580	1
Deletion	Chr5	17983001	18003000	20000	5
Deletion	Chr9	18290921	18290921	1
Deletion	Chr12	24359547	24359547	1
Deletion	Chr2	24441878	24441878	1
Deletion	Chr4	25393154	25393160	7
Deletion	Chr4	25970734	25970743	10
Deletion	Chr7	28557635	28557635	1
Deletion	Chr2	28742170	28742172	3
Deletion	Chr4	28846791	28846791	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	9443350	9443557
Inversion	Chr5	17138101	17286433
Inversion	Chr6	19841173	20095259

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes