Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4434-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4434-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 37

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3388341 A-T HET
SBS Chr1 13232927 C-T HET
SBS Chr1 36497180 C-A HET OsKitaake01g387800
SBS Chr2 10280343 T-A HOMO
SBS Chr2 25495378 A-G HET
SBS Chr2 33303427 C-T HET
SBS Chr3 1928613 C-A HET OsKitaake03g027600
SBS Chr3 17069547 C-A HET
SBS Chr4 15932140 G-A HET OsKitaake04g075900
SBS Chr4 20051419 C-T HET
SBS Chr4 22231650 G-A HET
SBS Chr4 29527057 T-C HET
SBS Chr6 6606541 T-G HOMO
SBS Chr6 11832576 A-G HET
SBS Chr6 19836266 G-A HET
SBS Chr6 22295070 C-A HET
SBS Chr6 25377354 G-A HOMO
SBS Chr7 18342902 T-C HET
SBS Chr7 18625661 G-T HOMO
SBS Chr7 26002194 T-G HET OsKitaake07g238300
SBS Chr7 29016338 G-A HOMO
SBS Chr7 29016339 A-T HOMO
SBS Chr8 1930493 T-C HOMO
SBS Chr8 13540189 A-G HET
SBS Chr9 2489514 A-G HOMO
SBS Chr9 11281895 C-A HOMO
SBS Chr9 22412508 T-C HET
SBS Chr10 4042700 G-A HET
SBS Chr10 6166388 A-G HET
SBS Chr10 6690289 G-A HET
SBS Chr10 9574679 C-T HET
SBS Chr10 11304059 G-A HET
SBS Chr10 16636078 G-A HET OsKitaake10g113800
SBS Chr11 14674067 G-A HOMO
SBS Chr11 17578923 A-T HOMO
SBS Chr12 4249151 G-A HET
SBS Chr12 25421537 T-A HET OsKitaake12g208600

Deletions: 18

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr11 2575001 2600000 25000 3
Deletion Chr5 3619167 3619167 1
Deletion Chr1 7271720 7271720 1
Deletion Chr10 7436755 7436755 1
Deletion Chr7 7888001 7928000 40000 4
Deletion Chr6 8841385 8841405 21
Deletion Chr9 10074856 10074857 2
Deletion Chr10 10566739 10566739 1
Deletion Chr12 11613001 11618000 5000
Deletion Chr4 11735279 11735279 1
Deletion Chr9 13282888 13282888 1
Deletion Chr10 14101482 14101482 1
Deletion Chr9 17523781 17523784 4
Deletion Chr2 21392013 21392014 2
Deletion Chr12 26416853 26416853 1
Deletion Chr4 29530329 29530329 1
Deletion Chr1 30260876 30260876 1
Deletion Chr4 33904086 33904086 1

Insertions: 11

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 10266251 10266253 1
Insertion Chr4 24619813 24619815 1
Insertion Chr6 1920804 1920806 1
Insertion Chr7 2034753 2034756 2
Insertion Chr9 447852 447854 1
Insertion Chr11 27867760 27867792 31
Insertion Chr12 18541913 18541915 1
Insertion Chr4 31283401 31283404 2
Insertion Chr5 24246754 24246756 1
Insertion Chr7 1866085 1866087 1
Insertion Chr11 1892964 1892966 1

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr9 3051734 3051836
Inversion Chr1 10858949 10859153
Inversion Chr12 18547442 18547604 OsKitaake12g135500
Inversion Chr1 26778476 26778760
Inversion Chr1 31554301 31580991 OsKitaake01g316800

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 24430546 Chr1 31619087 OsKitaake05g197800
Translocation Chr5 24430562 Chr1 31580999 OsKitaake05g197800
Translocation Chr2 34440392 Chr1 16106912 OsKitaake02g358200
Translocation Chr2 34440398 Chr1 16106484 OsKitaake02g358200

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3388341	A-T	HET
SBS	Chr1	13232927	C-T	HET
SBS	Chr1	36497180	C-A	HET		OsKitaake01g387800
SBS	Chr2	10280343	T-A	HOMO
SBS	Chr2	25495378	A-G	HET
SBS	Chr2	33303427	C-T	HET
SBS	Chr3	1928613	C-A	HET		OsKitaake03g027600
SBS	Chr3	17069547	C-A	HET
SBS	Chr4	15932140	G-A	HET		OsKitaake04g075900
SBS	Chr4	20051419	C-T	HET
SBS	Chr4	22231650	G-A	HET
SBS	Chr4	29527057	T-C	HET
SBS	Chr6	6606541	T-G	HOMO
SBS	Chr6	11832576	A-G	HET
SBS	Chr6	19836266	G-A	HET
SBS	Chr6	22295070	C-A	HET
SBS	Chr6	25377354	G-A	HOMO
SBS	Chr7	18342902	T-C	HET
SBS	Chr7	18625661	G-T	HOMO
SBS	Chr7	26002194	T-G	HET		OsKitaake07g238300
SBS	Chr7	29016338	G-A	HOMO
SBS	Chr7	29016339	A-T	HOMO
SBS	Chr8	1930493	T-C	HOMO
SBS	Chr8	13540189	A-G	HET
SBS	Chr9	2489514	A-G	HOMO
SBS	Chr9	11281895	C-A	HOMO
SBS	Chr9	22412508	T-C	HET
SBS	Chr10	4042700	G-A	HET
SBS	Chr10	6166388	A-G	HET
SBS	Chr10	6690289	G-A	HET
SBS	Chr10	9574679	C-T	HET
SBS	Chr10	11304059	G-A	HET
SBS	Chr10	16636078	G-A	HET		OsKitaake10g113800
SBS	Chr11	14674067	G-A	HOMO
SBS	Chr11	17578923	A-T	HOMO
SBS	Chr12	4249151	G-A	HET
SBS	Chr12	25421537	T-A	HET		OsKitaake12g208600

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	2575001	2600000	25000	3
Deletion	Chr5	3619167	3619167	1
Deletion	Chr1	7271720	7271720	1
Deletion	Chr10	7436755	7436755	1
Deletion	Chr7	7888001	7928000	40000	4
Deletion	Chr6	8841385	8841405	21
Deletion	Chr9	10074856	10074857	2
Deletion	Chr10	10566739	10566739	1
Deletion	Chr12	11613001	11618000	5000
Deletion	Chr4	11735279	11735279	1
Deletion	Chr9	13282888	13282888	1
Deletion	Chr10	14101482	14101482	1
Deletion	Chr9	17523781	17523784	4
Deletion	Chr2	21392013	21392014	2
Deletion	Chr12	26416853	26416853	1
Deletion	Chr4	29530329	29530329	1
Deletion	Chr1	30260876	30260876	1
Deletion	Chr4	33904086	33904086	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	3051734	3051836
Inversion	Chr1	10858949	10859153
Inversion	Chr12	18547442	18547604	OsKitaake12g135500
Inversion	Chr1	26778476	26778760
Inversion	Chr1	31554301	31580991	OsKitaake01g316800

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes