Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4455-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4455-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 55

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 617675 T-C HET
SBS Chr1 6034774 A-G HET
SBS Chr1 8243221 T-A HET
SBS Chr1 14633249 C-T HET
SBS Chr1 16669851 T-C HET
SBS Chr1 38231898 C-A HET
SBS Chr1 39802804 C-T HET
SBS Chr1 44012647 G-T HOMO
SBS Chr2 9956761 A-G HET
SBS Chr2 13630580 T-G HET
SBS Chr2 17022131 T-A HET
SBS Chr2 17688901 A-C HET
SBS Chr2 26978340 C-G HET
SBS Chr2 33602082 T-A HET
SBS Chr2 33602083 C-A HET
SBS Chr2 33868745 G-A HET
SBS Chr3 10763324 T-A HOMO
SBS Chr3 17736780 G-C HET
SBS Chr3 19480460 G-C HET
SBS Chr3 31580588 T-C HET
SBS Chr4 13843463 G-A HOMO
SBS Chr4 15479646 A-G HOMO
SBS Chr4 19863450 T-A HET
SBS Chr4 31190223 G-A HET
SBS Chr4 33716218 A-G HET
SBS Chr4 35229696 T-C HET
SBS Chr5 4275893 G-A HET
SBS Chr5 10126303 T-C HET
SBS Chr5 14791368 A-G HOMO
SBS Chr5 19500243 C-A HOMO
SBS Chr5 22769435 G-A HOMO
SBS Chr5 22769436 C-A HOMO
SBS Chr5 25090043 C-A HET
SBS Chr5 28994316 C-T HOMO
SBS Chr6 8935960 A-T HOMO
SBS Chr7 6273794 T-G HET
SBS Chr7 21326089 G-A HET
SBS Chr8 3839392 T-C HET
SBS Chr8 13233844 A-G HOMO
SBS Chr8 20413750 C-T HET
SBS Chr8 23096577 G-A HET
SBS Chr9 672383 T-C HET
SBS Chr9 3920852 G-A HET
SBS Chr9 16921475 A-G HET
SBS Chr10 8670237 T-A HET
SBS Chr10 8670244 A-T HET
SBS Chr10 22628218 A-C HET
SBS Chr11 1091734 C-T HOMO
SBS Chr11 10133834 G-A HOMO
SBS Chr11 10949260 C-T HET
SBS Chr11 13728931 G-C HOMO
SBS Chr11 26450921 T-G HOMO
SBS Chr12 6068339 T-A HET
SBS Chr12 13668395 C-A HET
SBS Chr12 18864755 C-T HET

Deletions: 20

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr3 1310194 1310194 1
Deletion Chr9 1964248 1964251 4
Deletion Chr5 5002424 5002431 8
Deletion Chr6 5530810 5530814 5
Deletion Chr1 6643988 6643990 3
Deletion Chr6 9671398 9671406 9
Deletion Chr6 10117063 10117067 5
Deletion Chr7 10660768 10660768 1
Deletion Chr11 12641742 12641743 2
Deletion Chr9 13331694 13331694 1
Deletion Chr2 13587745 13587755 11
Deletion Chr4 15622224 15622224 1
Deletion Chr11 16904078 16904082 5
Deletion Chr11 17414938 17414940 3
Deletion Chr11 20544001 20574000 30000 3
Deletion Chr1 22212733 22212733 1
Deletion Chr6 28231138 28231139 2
Deletion Chr6 29466295 29466296 2
Deletion Chr3 31479534 31479534 1
Deletion Chr1 43233152 43233152 1

Insertions: 14

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 24253202 24253204 1
Insertion Chr4 2898788 2898791 2
Insertion Chr5 6358144 6358146 1
Insertion Chr5 30136484 30136486 1
Insertion Chr6 3909547 3909549 1
Insertion Chr6 12269468 12269470 1
Insertion Chr8 24086195 24086197 1
Insertion Chr8 27699359 27699361 1
Insertion Chr1 1140980 1140982 1
Insertion Chr5 14701893 14701895 1
Insertion Chr8 24056107 24056109 1
Insertion Chr9 18302473 18302476 2
Insertion Chr11 8669585 8669587 1
Insertion Chr12 7596489 7596492 2

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr3 8772016 8772200
Inversion Chr5 10583019 10648771
Inversion Chr5 10583024 10648768
Inversion Chr3 14950427 14950625
Inversion Chr1 35779107 35779279 OsKitaake01g379000

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	617675	T-C	HET
SBS	Chr1	6034774	A-G	HET
SBS	Chr1	8243221	T-A	HET
SBS	Chr1	14633249	C-T	HET
SBS	Chr1	16669851	T-C	HET
SBS	Chr1	38231898	C-A	HET
SBS	Chr1	39802804	C-T	HET
SBS	Chr1	44012647	G-T	HOMO
SBS	Chr2	9956761	A-G	HET
SBS	Chr2	13630580	T-G	HET
SBS	Chr2	17022131	T-A	HET
SBS	Chr2	17688901	A-C	HET
SBS	Chr2	26978340	C-G	HET
SBS	Chr2	33602082	T-A	HET
SBS	Chr2	33602083	C-A	HET
SBS	Chr2	33868745	G-A	HET
SBS	Chr3	10763324	T-A	HOMO
SBS	Chr3	17736780	G-C	HET
SBS	Chr3	19480460	G-C	HET
SBS	Chr3	31580588	T-C	HET
SBS	Chr4	13843463	G-A	HOMO
SBS	Chr4	15479646	A-G	HOMO
SBS	Chr4	19863450	T-A	HET
SBS	Chr4	31190223	G-A	HET
SBS	Chr4	33716218	A-G	HET
SBS	Chr4	35229696	T-C	HET
SBS	Chr5	4275893	G-A	HET
SBS	Chr5	10126303	T-C	HET
SBS	Chr5	14791368	A-G	HOMO
SBS	Chr5	19500243	C-A	HOMO
SBS	Chr5	22769435	G-A	HOMO
SBS	Chr5	22769436	C-A	HOMO
SBS	Chr5	25090043	C-A	HET
SBS	Chr5	28994316	C-T	HOMO
SBS	Chr6	8935960	A-T	HOMO
SBS	Chr7	6273794	T-G	HET
SBS	Chr7	21326089	G-A	HET
SBS	Chr8	3839392	T-C	HET
SBS	Chr8	13233844	A-G	HOMO
SBS	Chr8	20413750	C-T	HET
SBS	Chr8	23096577	G-A	HET
SBS	Chr9	672383	T-C	HET
SBS	Chr9	3920852	G-A	HET
SBS	Chr9	16921475	A-G	HET
SBS	Chr10	8670237	T-A	HET
SBS	Chr10	8670244	A-T	HET
SBS	Chr10	22628218	A-C	HET
SBS	Chr11	1091734	C-T	HOMO
SBS	Chr11	10133834	G-A	HOMO
SBS	Chr11	10949260	C-T	HET
SBS	Chr11	13728931	G-C	HOMO
SBS	Chr11	26450921	T-G	HOMO
SBS	Chr12	6068339	T-A	HET
SBS	Chr12	13668395	C-A	HET
SBS	Chr12	18864755	C-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	1310194	1310194	1
Deletion	Chr9	1964248	1964251	4
Deletion	Chr5	5002424	5002431	8
Deletion	Chr6	5530810	5530814	5
Deletion	Chr1	6643988	6643990	3
Deletion	Chr6	9671398	9671406	9
Deletion	Chr6	10117063	10117067	5
Deletion	Chr7	10660768	10660768	1
Deletion	Chr11	12641742	12641743	2
Deletion	Chr9	13331694	13331694	1
Deletion	Chr2	13587745	13587755	11
Deletion	Chr4	15622224	15622224	1
Deletion	Chr11	16904078	16904082	5
Deletion	Chr11	17414938	17414940	3
Deletion	Chr11	20544001	20574000	30000	3
Deletion	Chr1	22212733	22212733	1
Deletion	Chr6	28231138	28231139	2
Deletion	Chr6	29466295	29466296	2
Deletion	Chr3	31479534	31479534	1
Deletion	Chr1	43233152	43233152	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	8772016	8772200
Inversion	Chr5	10583019	10648771
Inversion	Chr5	10583024	10648768
Inversion	Chr3	14950427	14950625
Inversion	Chr1	35779107	35779279	OsKitaake01g379000

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes