Search Kitaake
| Mutant Information |
|---|
| Mutant Name | FN4463-S [Download] |
| Generation | M2 |
| Genus Species | Oryza Sativa |
| Cultivar | Kitaake |
| Alignment File (BAM File) | Download FN4463-S Alignment File |
| Seed Availability | Yes [Order Seeds] |
| Variant Information |
|---|
Single base substitutions: 47
Variant Type |
Chromosome |
Position |
Change |
Genotype |
Effect |
Gene Affected |
| SBS | Chr1 | 14912137 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr1 | 24075151 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr1 | 24243996 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr1 | 28583927 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr1 | 29030285 | G-C | HET | ||
| SBS | Chr1 | 42322162 | T-A | HET | OsKitaake01g466400 | |
| SBS | Chr2 | 15788314 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr2 | 23429438 | T-A | HOMO | OsKitaake02g229500 | |
| SBS | Chr2 | 23429440 | G-T | HOMO | OsKitaake02g229500 | |
| SBS | Chr2 | 23429443 | T-G | HOMO | OsKitaake02g229500 | |
| SBS | Chr3 | 5949167 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr3 | 5949175 | A-T | HOMO | ||
| SBS | Chr3 | 9529760 | C-G | HET | ||
| SBS | Chr3 | 10044607 | C-T | HET | OsKitaake03g137400 | |
| SBS | Chr3 | 18103601 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr3 | 28442205 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr3 | 29742439 | G-A | HOMO | ||
| SBS | Chr4 | 3193508 | G-C | HET | ||
| SBS | Chr4 | 11216437 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr4 | 22229272 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr4 | 27431147 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr5 | 556478 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 556479 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 556480 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 21728179 | A-C | HET | ||
| SBS | Chr6 | 918376 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr6 | 22623697 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr7 | 5847636 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 8595066 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 8874513 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 9248061 | A-C | HET | ||
| SBS | Chr7 | 11088753 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 11960103 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr7 | 18837453 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr7 | 20588874 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 26268257 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 28710322 | A-T | HET | OsKitaake07g273800 | |
| SBS | Chr8 | 26082004 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr10 | 6341020 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr10 | 7760084 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr11 | 7385757 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 8183908 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr11 | 9561125 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 16230898 | G-C | HET | ||
| SBS | Chr11 | 18985005 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 24341842 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr12 | 7789633 | A-G | HET |
Deletions: 12
Insertions: 10
Inversions: 1
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Position 2 |
Number of Genes |
| Inversion | Chr10 | 18966774 | 18966964 |
Translocations: 2
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Chromosome |
Position 2 |
Number of Genes |
| Translocation | Chr9 | 3620850 | Chr2 | 7567420 | |
| Translocation | Chr9 | 3622119 | Chr2 | 7567444 |