Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4481-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4481-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 47

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 5303615 T-C HET
SBS Chr1 5522993 A-T HET
SBS Chr1 13943625 C-A HET
SBS Chr1 21637963 G-A HOMO
SBS Chr1 40521155 C-T HET
SBS Chr1 40857285 C-T HET
SBS Chr2 15806534 G-A HET
SBS Chr3 6077889 G-A HET
SBS Chr3 22925614 G-A HET
SBS Chr4 5259037 G-A HOMO
SBS Chr4 28257990 G-A HOMO
SBS Chr4 33789276 C-T HET
SBS Chr5 14882065 T-A HOMO
SBS Chr5 26685733 G-A HET
SBS Chr5 26815618 A-G HOMO
SBS Chr6 1142516 G-A HET
SBS Chr6 9008696 T-C HET
SBS Chr6 14798547 G-A HET
SBS Chr6 20042476 C-T HET
SBS Chr6 29036895 G-A HOMO
SBS Chr7 1141044 T-C HET
SBS Chr7 3916054 G-A HOMO
SBS Chr7 11655510 G-T HET
SBS Chr7 15466750 A-T HET
SBS Chr7 25809388 A-G HOMO
SBS Chr7 27803106 G-C HOMO
SBS Chr8 8238736 C-T HOMO
SBS Chr8 12565895 T-A HET
SBS Chr8 20972504 G-A HET
SBS Chr8 21145884 A-T HET
SBS Chr9 621029 T-C HET
SBS Chr9 9219804 C-T HET
SBS Chr9 9303445 A-T HET OsKitaake09g055500
SBS Chr9 15009155 C-T HET
SBS Chr9 16248553 A-G HOMO
SBS Chr10 17532147 G-A HET
SBS Chr10 20051173 C-A HET
SBS Chr11 1360265 G-T HET
SBS Chr11 10314302 C-T HOMO
SBS Chr11 16251000 T-C HET
SBS Chr11 29727745 G-C HET
SBS Chr12 2724669 C-T HOMO
SBS Chr12 2724670 A-T HOMO
SBS Chr12 4087971 A-G HOMO
SBS Chr12 7945887 T-C HET
SBS Chr12 13194044 G-A HET
SBS Chr12 14870081 C-T HET

Deletions: 19

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr3 3947402 3947403 2
Deletion Chr1 4735518 4735518 1
Deletion Chr1 6257263 6257264 2
Deletion Chr5 6869714 6869714 1
Deletion Chr6 15203137 15203137 1
Deletion Chr9 15554838 15554934 97
Deletion Chr5 15851013 15851013 1
Deletion Chr12 16702389 16702389 1
Deletion Chr10 19771009 19771010 2
Deletion Chr5 20899788 20899788 1
Deletion Chr8 21542001 21598000 56000 12
Deletion Chr3 22388595 22388595 1
Deletion Chr11 22812157 22812161 5
Deletion Chr4 22838362 22838365 4
Deletion Chr2 25889095 25889111 17
Deletion Chr8 28086207 28086207 1
Deletion Chr8 29077664 29077668 5
Deletion Chr3 29477293 29477294 2
Deletion Chr6 30015320 30015320 1

Insertions: 5

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr5 25668472 25668475 2
Insertion Chr6 14532918 14532924 5
Insertion Chr8 893177 893179 1
Insertion Chr8 17352396 17352399 2
Insertion Chr10 13722326 13722328 1

Inversions: 6

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr8 12117880 12569625
Inversion Chr2 14278686 14278881 OsKitaake02g153200
Inversion Chr10 16888409 17431779 OsKitaake10g115700
Inversion Chr6 17886856 17887014
Inversion Chr8 21424421 21621066 OsKitaake08g161300
Inversion Chr8 21424436 21621078 OsKitaake08g161300

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	5303615	T-C	HET
SBS	Chr1	5522993	A-T	HET
SBS	Chr1	13943625	C-A	HET
SBS	Chr1	21637963	G-A	HOMO
SBS	Chr1	40521155	C-T	HET
SBS	Chr1	40857285	C-T	HET
SBS	Chr2	15806534	G-A	HET
SBS	Chr3	6077889	G-A	HET
SBS	Chr3	22925614	G-A	HET
SBS	Chr4	5259037	G-A	HOMO
SBS	Chr4	28257990	G-A	HOMO
SBS	Chr4	33789276	C-T	HET
SBS	Chr5	14882065	T-A	HOMO
SBS	Chr5	26685733	G-A	HET
SBS	Chr5	26815618	A-G	HOMO
SBS	Chr6	1142516	G-A	HET
SBS	Chr6	9008696	T-C	HET
SBS	Chr6	14798547	G-A	HET
SBS	Chr6	20042476	C-T	HET
SBS	Chr6	29036895	G-A	HOMO
SBS	Chr7	1141044	T-C	HET
SBS	Chr7	3916054	G-A	HOMO
SBS	Chr7	11655510	G-T	HET
SBS	Chr7	15466750	A-T	HET
SBS	Chr7	25809388	A-G	HOMO
SBS	Chr7	27803106	G-C	HOMO
SBS	Chr8	8238736	C-T	HOMO
SBS	Chr8	12565895	T-A	HET
SBS	Chr8	20972504	G-A	HET
SBS	Chr8	21145884	A-T	HET
SBS	Chr9	621029	T-C	HET
SBS	Chr9	9219804	C-T	HET
SBS	Chr9	9303445	A-T	HET		OsKitaake09g055500
SBS	Chr9	15009155	C-T	HET
SBS	Chr9	16248553	A-G	HOMO
SBS	Chr10	17532147	G-A	HET
SBS	Chr10	20051173	C-A	HET
SBS	Chr11	1360265	G-T	HET
SBS	Chr11	10314302	C-T	HOMO
SBS	Chr11	16251000	T-C	HET
SBS	Chr11	29727745	G-C	HET
SBS	Chr12	2724669	C-T	HOMO
SBS	Chr12	2724670	A-T	HOMO
SBS	Chr12	4087971	A-G	HOMO
SBS	Chr12	7945887	T-C	HET
SBS	Chr12	13194044	G-A	HET
SBS	Chr12	14870081	C-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	3947402	3947403	2
Deletion	Chr1	4735518	4735518	1
Deletion	Chr1	6257263	6257264	2
Deletion	Chr5	6869714	6869714	1
Deletion	Chr6	15203137	15203137	1
Deletion	Chr9	15554838	15554934	97
Deletion	Chr5	15851013	15851013	1
Deletion	Chr12	16702389	16702389	1
Deletion	Chr10	19771009	19771010	2
Deletion	Chr5	20899788	20899788	1
Deletion	Chr8	21542001	21598000	56000	12
Deletion	Chr3	22388595	22388595	1
Deletion	Chr11	22812157	22812161	5
Deletion	Chr4	22838362	22838365	4
Deletion	Chr2	25889095	25889111	17
Deletion	Chr8	28086207	28086207	1
Deletion	Chr8	29077664	29077668	5
Deletion	Chr3	29477293	29477294	2
Deletion	Chr6	30015320	30015320	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr8	12117880	12569625
Inversion	Chr2	14278686	14278881	OsKitaake02g153200
Inversion	Chr10	16888409	17431779	OsKitaake10g115700
Inversion	Chr6	17886856	17887014
Inversion	Chr8	21424421	21621066	OsKitaake08g161300
Inversion	Chr8	21424436	21621078	OsKitaake08g161300

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes