Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4498-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4498-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 71

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3062830 T-C HET
SBS Chr1 7209900 G-T HET OsKitaake01g090100
SBS Chr1 7219664 C-G HET
SBS Chr1 7427001 T-A HET
SBS Chr1 19374108 C-T HET
SBS Chr2 1134205 G-A HET
SBS Chr2 2732147 T-G HET
SBS Chr2 13074694 C-A HET
SBS Chr2 16844739 A-G HET
SBS Chr2 17846779 G-C HET
SBS Chr2 19108335 G-T HOMO OsKitaake02g186500
SBS Chr2 20120537 G-A HET
SBS Chr2 30446096 A-T HET
SBS Chr2 31599264 G-A HET
SBS Chr2 37107799 C-T HOMO
SBS Chr3 55900 G-T HET
SBS Chr3 12911235 C-A HOMO
SBS Chr3 14226940 C-T HOMO
SBS Chr3 19452409 G-A HET
SBS Chr3 25737222 G-A HET
SBS Chr3 26995134 G-A HET
SBS Chr3 28559663 G-A HET
SBS Chr3 28826299 A-T HET
SBS Chr4 4307869 C-A HET
SBS Chr4 4681641 G-A HET
SBS Chr4 7287798 G-T HOMO
SBS Chr4 12483755 C-T HET
SBS Chr4 17017456 A-T HOMO
SBS Chr4 27710541 A-T HET
SBS Chr4 31117763 G-T HET
SBS Chr5 15678107 G-T HET
SBS Chr5 16162735 G-A HET
SBS Chr5 20641478 G-T HET
SBS Chr5 20641480 A-T HET
SBS Chr5 25923506 C-A HET
SBS Chr6 7546234 G-A HET
SBS Chr6 8536186 C-T HET
SBS Chr6 8757152 C-T HET
SBS Chr6 11913693 T-C HET
SBS Chr6 16059460 A-G HET
SBS Chr6 22026390 T-C HET
SBS Chr7 998159 T-A HET
SBS Chr7 5380159 T-C HET
SBS Chr7 14362366 T-C HET
SBS Chr7 14482335 C-A HET
SBS Chr7 19534861 A-T HET
SBS Chr8 11763800 G-C HET OsKitaake08g103300
SBS Chr8 13715405 C-T HET
SBS Chr9 10632646 C-G HET
SBS Chr9 19503142 C-T HOMO
SBS Chr9 19866746 G-A HOMO
SBS Chr10 13116783 T-C HOMO
SBS Chr10 13116794 C-T HOMO
SBS Chr10 15561020 C-T HET
SBS Chr10 15654112 T-C HET
SBS Chr10 18020783 T-A HET
SBS Chr10 18281307 C-G HET
SBS Chr10 20232247 T-C HOMO
SBS Chr11 1617195 C-A HET
SBS Chr11 9670058 C-A HET
SBS Chr11 9670059 C-A HET
SBS Chr11 12595667 A-T HET
SBS Chr11 15181851 G-T HET
SBS Chr11 26788647 G-T HOMO
SBS Chr11 28175743 G-T HOMO
SBS Chr12 13101398 C-T HET OsKitaake12g109300
SBS Chr12 16834085 G-T HOMO
SBS Chr12 21753856 A-G HET
SBS Chr12 22894851 C-T HET
SBS Chr12 25675571 G-T HET
SBS Chr12 25675572 T-G HET

Deletions: 38

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr5 1514262 1514265 4
Deletion Chr10 1858682 1858682 1
Deletion Chr8 2273016 2273016 1
Deletion Chr2 3100450 3100457 8
Deletion Chr7 3446506 3446506 1
Deletion Chr4 4262622 4262710 89
Deletion Chr9 4546541 4546541 1
Deletion Chr11 5343627 5343630 4
Deletion Chr8 5770432 5770433 2
Deletion Chr8 6233826 6233826 1
Deletion Chr7 8746516 8746516 1
Deletion Chr12 9120657 9120658 2
Deletion Chr1 9945487 9945488 2
Deletion Chr4 10094046 10094053 8
Deletion Chr7 11387660 11387667 8
Deletion Chr8 11629589 11629589 1
Deletion Chr6 12686499 12686510 12
Deletion Chr5 13271239 13271239 1
Deletion Chr8 13562150 13562164 15
Deletion Chr7 13721001 13730000 9000
Deletion Chr1 13950716 13950717 2
Deletion Chr8 14129151 14129151 1
Deletion Chr7 14707967 14707983 17
Deletion Chr8 14798413 14798424 12
Deletion Chr8 15804060 15804063 4
Deletion Chr11 16321933 16321944 12
Deletion Chr2 19108322 19108323 2 OsKitaake02g186500
Deletion Chr5 20657428 20657428 1
Deletion Chr5 20679402 20679402 1 OsKitaake05g165100
Deletion Chr2 21197580 21197581 2
Deletion Chr5 22235961 22235962 2
Deletion Chr5 22688833 22688843 11
Deletion Chr7 22700749 22700756 8
Deletion Chr6 24129172 24129173 2
Deletion Chr2 26722530 26722531 2
Deletion Chr7 26732469 26732486 18
Deletion Chr2 29464345 29464354 10
Deletion Chr3 32873456 32873456 1

Insertions: 7

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 20467558 20467560 1
Insertion Chr9 7028901 7028903 1
Insertion Chr12 18879582 18879584 1
Insertion Chr1 31129308 31129310 1
Insertion Chr6 3838888 3838890 1
Insertion Chr7 22830557 22830559 1
Insertion Chr12 25081381 25081384 2

Inversions: 6

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr7 494233 663218
Inversion Chr7 494238 663228
Inversion Chr1 5404926 5405100
Inversion Chr11 21240137 21267743
Inversion Chr11 21240168 21267755
Inversion Chr1 24073276 24688275

Translocations: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr8 1952443 Chr3 24791363
Translocation Chr2 20870717 Chr1 24061046 OsKitaake01g231200
Translocation Chr2 20870726 Chr1 24686282

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3062830	T-C	HET
SBS	Chr1	7209900	G-T	HET		OsKitaake01g090100
SBS	Chr1	7219664	C-G	HET
SBS	Chr1	7427001	T-A	HET
SBS	Chr1	19374108	C-T	HET
SBS	Chr2	1134205	G-A	HET
SBS	Chr2	2732147	T-G	HET
SBS	Chr2	13074694	C-A	HET
SBS	Chr2	16844739	A-G	HET
SBS	Chr2	17846779	G-C	HET
SBS	Chr2	19108335	G-T	HOMO		OsKitaake02g186500
SBS	Chr2	20120537	G-A	HET
SBS	Chr2	30446096	A-T	HET
SBS	Chr2	31599264	G-A	HET
SBS	Chr2	37107799	C-T	HOMO
SBS	Chr3	55900	G-T	HET
SBS	Chr3	12911235	C-A	HOMO
SBS	Chr3	14226940	C-T	HOMO
SBS	Chr3	19452409	G-A	HET
SBS	Chr3	25737222	G-A	HET
SBS	Chr3	26995134	G-A	HET
SBS	Chr3	28559663	G-A	HET
SBS	Chr3	28826299	A-T	HET
SBS	Chr4	4307869	C-A	HET
SBS	Chr4	4681641	G-A	HET
SBS	Chr4	7287798	G-T	HOMO
SBS	Chr4	12483755	C-T	HET
SBS	Chr4	17017456	A-T	HOMO
SBS	Chr4	27710541	A-T	HET
SBS	Chr4	31117763	G-T	HET
SBS	Chr5	15678107	G-T	HET
SBS	Chr5	16162735	G-A	HET
SBS	Chr5	20641478	G-T	HET
SBS	Chr5	20641480	A-T	HET
SBS	Chr5	25923506	C-A	HET
SBS	Chr6	7546234	G-A	HET
SBS	Chr6	8536186	C-T	HET
SBS	Chr6	8757152	C-T	HET
SBS	Chr6	11913693	T-C	HET
SBS	Chr6	16059460	A-G	HET
SBS	Chr6	22026390	T-C	HET
SBS	Chr7	998159	T-A	HET
SBS	Chr7	5380159	T-C	HET
SBS	Chr7	14362366	T-C	HET
SBS	Chr7	14482335	C-A	HET
SBS	Chr7	19534861	A-T	HET
SBS	Chr8	11763800	G-C	HET		OsKitaake08g103300
SBS	Chr8	13715405	C-T	HET
SBS	Chr9	10632646	C-G	HET
SBS	Chr9	19503142	C-T	HOMO
SBS	Chr9	19866746	G-A	HOMO
SBS	Chr10	13116783	T-C	HOMO
SBS	Chr10	13116794	C-T	HOMO
SBS	Chr10	15561020	C-T	HET
SBS	Chr10	15654112	T-C	HET
SBS	Chr10	18020783	T-A	HET
SBS	Chr10	18281307	C-G	HET
SBS	Chr10	20232247	T-C	HOMO
SBS	Chr11	1617195	C-A	HET
SBS	Chr11	9670058	C-A	HET
SBS	Chr11	9670059	C-A	HET
SBS	Chr11	12595667	A-T	HET
SBS	Chr11	15181851	G-T	HET
SBS	Chr11	26788647	G-T	HOMO
SBS	Chr11	28175743	G-T	HOMO
SBS	Chr12	13101398	C-T	HET		OsKitaake12g109300
SBS	Chr12	16834085	G-T	HOMO
SBS	Chr12	21753856	A-G	HET
SBS	Chr12	22894851	C-T	HET
SBS	Chr12	25675571	G-T	HET
SBS	Chr12	25675572	T-G	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	1514262	1514265	4
Deletion	Chr10	1858682	1858682	1
Deletion	Chr8	2273016	2273016	1
Deletion	Chr2	3100450	3100457	8
Deletion	Chr7	3446506	3446506	1
Deletion	Chr4	4262622	4262710	89
Deletion	Chr9	4546541	4546541	1
Deletion	Chr11	5343627	5343630	4
Deletion	Chr8	5770432	5770433	2
Deletion	Chr8	6233826	6233826	1
Deletion	Chr7	8746516	8746516	1
Deletion	Chr12	9120657	9120658	2
Deletion	Chr1	9945487	9945488	2
Deletion	Chr4	10094046	10094053	8
Deletion	Chr7	11387660	11387667	8
Deletion	Chr8	11629589	11629589	1
Deletion	Chr6	12686499	12686510	12
Deletion	Chr5	13271239	13271239	1
Deletion	Chr8	13562150	13562164	15
Deletion	Chr7	13721001	13730000	9000
Deletion	Chr1	13950716	13950717	2
Deletion	Chr8	14129151	14129151	1
Deletion	Chr7	14707967	14707983	17
Deletion	Chr8	14798413	14798424	12
Deletion	Chr8	15804060	15804063	4
Deletion	Chr11	16321933	16321944	12
Deletion	Chr2	19108322	19108323	2	OsKitaake02g186500
Deletion	Chr5	20657428	20657428	1
Deletion	Chr5	20679402	20679402	1	OsKitaake05g165100
Deletion	Chr2	21197580	21197581	2
Deletion	Chr5	22235961	22235962	2
Deletion	Chr5	22688833	22688843	11
Deletion	Chr7	22700749	22700756	8
Deletion	Chr6	24129172	24129173	2
Deletion	Chr2	26722530	26722531	2
Deletion	Chr7	26732469	26732486	18
Deletion	Chr2	29464345	29464354	10
Deletion	Chr3	32873456	32873456	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	494233	663218
Inversion	Chr7	494238	663228
Inversion	Chr1	5404926	5405100
Inversion	Chr11	21240137	21267743
Inversion	Chr11	21240168	21267755
Inversion	Chr1	24073276	24688275

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes