Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4503-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4503-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 55

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 2363486 A-C HET
SBS Chr1 9052011 A-G HET
SBS Chr1 9339946 G-T HET
SBS Chr1 13300079 C-A HET
SBS Chr1 20439627 G-A HET
SBS Chr1 25957349 C-T HET
SBS Chr1 26708253 T-C HET
SBS Chr2 2330035 G-A HET
SBS Chr2 8590705 C-T HOMO
SBS Chr2 24316276 C-A HET
SBS Chr2 32817033 G-T HET
SBS Chr3 3156372 G-A HET
SBS Chr3 4440032 G-A HOMO
SBS Chr3 6872984 T-A HET
SBS Chr3 8046347 C-A HET
SBS Chr3 13576843 A-G HET
SBS Chr3 14974088 A-G HET
SBS Chr3 29114255 G-A HET
SBS Chr4 4744254 G-A HET
SBS Chr4 6227910 A-G HET
SBS Chr4 6781805 G-C HOMO
SBS Chr4 14063475 G-A HET
SBS Chr4 24026912 G-A HOMO
SBS Chr4 25636856 C-T HOMO
SBS Chr4 27538899 G-A HOMO
SBS Chr4 27538900 A-T HOMO
SBS Chr4 33848160 G-A HET
SBS Chr5 16273377 G-A HET
SBS Chr5 16565037 A-G HET
SBS Chr5 28185443 G-A HOMO
SBS Chr6 12553237 A-T HET
SBS Chr6 14329154 T-C HET
SBS Chr7 1861503 G-T HET
SBS Chr7 4258638 A-C HET
SBS Chr7 7685365 T-C HET
SBS Chr7 19814181 T-C HET
SBS Chr7 21275061 G-T HET
SBS Chr8 1286432 G-C HOMO
SBS Chr8 11392842 T-A HET
SBS Chr8 21615468 T-A HET
SBS Chr8 24331389 T-A HOMO
SBS Chr8 24331390 A-T HOMO
SBS Chr8 29120104 G-A HET
SBS Chr9 7201886 C-T HOMO
SBS Chr9 14830756 A-G HET
SBS Chr10 6987147 G-A HET
SBS Chr10 19187367 T-C HOMO
SBS Chr10 22342457 A-T HET
SBS Chr11 6054831 T-C HOMO
SBS Chr11 7371464 T-A HET
SBS Chr11 7810758 G-A HET
SBS Chr11 14099502 C-T HET
SBS Chr11 22831844 C-G HET
SBS Chr12 18143919 C-A HET
SBS Chr12 25101881 A-G HET

Deletions: 24

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr9 1641001 1653000 12000
Deletion Chr11 2501199 2501203 5
Deletion Chr9 2503655 2503655 1
Deletion Chr11 2688130 2688131 2
Deletion Chr6 3355352 3355352 1
Deletion Chr7 4772228 4772230 3
Deletion Chr12 5115714 5115804 91
Deletion Chr9 5180048 5180048 1
Deletion Chr7 9428001 9445000 17000
Deletion Chr12 9611428 9611428 1
Deletion Chr4 9754617 9754619 3
Deletion Chr5 10259563 10259567 5
Deletion Chr2 11881734 11881734 1
Deletion Chr7 11984659 11984659 1
Deletion Chr6 18776001 18949000 173000 15
Deletion Chr11 18798520 18798520 1
Deletion Chr6 19103001 19158000 55000 8
Deletion Chr6 19165001 19432000 267000 16
Deletion Chr1 23625662 23625662 1
Deletion Chr1 23953618 23953620 3
Deletion Chr4 27538367 27538373 7
Deletion Chr7 29156334 29156341 8
Deletion Chr4 34193899 34193899 1
Deletion Chr4 36959568 36959568 1

Insertions: 11

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 23048583 23048585 1
Insertion Chr5 12527862 12527864 1
Insertion Chr5 16138841 16138844 2
Insertion Chr8 478749 478751 1
Insertion Chr8 2935410 2935412 1
Insertion Chr10 15589969 15589974 4
Insertion Chr11 8637653 8637728 74
Insertion Chr4 31762737 31762739 1
Insertion Chr8 14375772 14375774 1
Insertion Chr10 22721793 22721796 2
Insertion Chr12 17794171 17794173 1

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr2 5868380 6361449 OsKitaake02g080900
Inversion Chr2 5868389 6361459 OsKitaake02g080900

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2363486	A-C	HET
SBS	Chr1	9052011	A-G	HET
SBS	Chr1	9339946	G-T	HET
SBS	Chr1	13300079	C-A	HET
SBS	Chr1	20439627	G-A	HET
SBS	Chr1	25957349	C-T	HET
SBS	Chr1	26708253	T-C	HET
SBS	Chr2	2330035	G-A	HET
SBS	Chr2	8590705	C-T	HOMO
SBS	Chr2	24316276	C-A	HET
SBS	Chr2	32817033	G-T	HET
SBS	Chr3	3156372	G-A	HET
SBS	Chr3	4440032	G-A	HOMO
SBS	Chr3	6872984	T-A	HET
SBS	Chr3	8046347	C-A	HET
SBS	Chr3	13576843	A-G	HET
SBS	Chr3	14974088	A-G	HET
SBS	Chr3	29114255	G-A	HET
SBS	Chr4	4744254	G-A	HET
SBS	Chr4	6227910	A-G	HET
SBS	Chr4	6781805	G-C	HOMO
SBS	Chr4	14063475	G-A	HET
SBS	Chr4	24026912	G-A	HOMO
SBS	Chr4	25636856	C-T	HOMO
SBS	Chr4	27538899	G-A	HOMO
SBS	Chr4	27538900	A-T	HOMO
SBS	Chr4	33848160	G-A	HET
SBS	Chr5	16273377	G-A	HET
SBS	Chr5	16565037	A-G	HET
SBS	Chr5	28185443	G-A	HOMO
SBS	Chr6	12553237	A-T	HET
SBS	Chr6	14329154	T-C	HET
SBS	Chr7	1861503	G-T	HET
SBS	Chr7	4258638	A-C	HET
SBS	Chr7	7685365	T-C	HET
SBS	Chr7	19814181	T-C	HET
SBS	Chr7	21275061	G-T	HET
SBS	Chr8	1286432	G-C	HOMO
SBS	Chr8	11392842	T-A	HET
SBS	Chr8	21615468	T-A	HET
SBS	Chr8	24331389	T-A	HOMO
SBS	Chr8	24331390	A-T	HOMO
SBS	Chr8	29120104	G-A	HET
SBS	Chr9	7201886	C-T	HOMO
SBS	Chr9	14830756	A-G	HET
SBS	Chr10	6987147	G-A	HET
SBS	Chr10	19187367	T-C	HOMO
SBS	Chr10	22342457	A-T	HET
SBS	Chr11	6054831	T-C	HOMO
SBS	Chr11	7371464	T-A	HET
SBS	Chr11	7810758	G-A	HET
SBS	Chr11	14099502	C-T	HET
SBS	Chr11	22831844	C-G	HET
SBS	Chr12	18143919	C-A	HET
SBS	Chr12	25101881	A-G	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr9	1641001	1653000	12000
Deletion	Chr11	2501199	2501203	5
Deletion	Chr9	2503655	2503655	1
Deletion	Chr11	2688130	2688131	2
Deletion	Chr6	3355352	3355352	1
Deletion	Chr7	4772228	4772230	3
Deletion	Chr12	5115714	5115804	91
Deletion	Chr9	5180048	5180048	1
Deletion	Chr7	9428001	9445000	17000
Deletion	Chr12	9611428	9611428	1
Deletion	Chr4	9754617	9754619	3
Deletion	Chr5	10259563	10259567	5
Deletion	Chr2	11881734	11881734	1
Deletion	Chr7	11984659	11984659	1
Deletion	Chr6	18776001	18949000	173000	15
Deletion	Chr11	18798520	18798520	1
Deletion	Chr6	19103001	19158000	55000	8
Deletion	Chr6	19165001	19432000	267000	16
Deletion	Chr1	23625662	23625662	1
Deletion	Chr1	23953618	23953620	3
Deletion	Chr4	27538367	27538373	7
Deletion	Chr7	29156334	29156341	8
Deletion	Chr4	34193899	34193899	1
Deletion	Chr4	36959568	36959568	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	5868380	6361449	OsKitaake02g080900
Inversion	Chr2	5868389	6361459	OsKitaake02g080900

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes