Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4522-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4522-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 67

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 20839617 C-A HET
SBS Chr1 22618932 C-A HET
SBS Chr1 27637929 A-G HET
SBS Chr1 30591472 G-T HET
SBS Chr1 36684810 C-T HOMO
SBS Chr2 71390 C-T HET
SBS Chr2 4648650 C-A HOMO
SBS Chr2 4648651 T-A HOMO
SBS Chr2 20270304 G-T HET
SBS Chr2 24665854 G-A HET
SBS Chr2 25785215 C-T HET
SBS Chr2 32050671 A-G HET
SBS Chr3 10252485 G-A HET
SBS Chr3 18050388 C-T HOMO
SBS Chr3 29103700 C-T HET
SBS Chr3 32037671 C-T HET
SBS Chr3 35473721 G-T HET
SBS Chr3 35873074 T-C HET
SBS Chr4 1700909 A-G HET
SBS Chr4 3569250 G-A HET
SBS Chr4 6725146 G-C HET
SBS Chr4 23687173 C-T HET
SBS Chr5 7360352 T-C HET
SBS Chr5 9311186 A-G HET
SBS Chr5 11397393 G-A HET
SBS Chr5 15748172 C-T HET OsKitaake05g121300
SBS Chr5 18926865 G-T HET
SBS Chr5 19668116 A-T HET
SBS Chr5 19668119 G-T HET
SBS Chr5 24722646 G-A HET
SBS Chr6 3715294 G-T HET
SBS Chr6 10041297 T-A HET
SBS Chr6 13704146 C-T HOMO
SBS Chr6 16879595 T-C HET
SBS Chr6 18091630 T-A HET
SBS Chr6 20947388 G-A HOMO
SBS Chr6 23254046 A-G HET
SBS Chr7 2938390 T-A HOMO
SBS Chr7 5526152 C-A HOMO
SBS Chr7 5877195 G-T HET
SBS Chr7 7842667 C-T HOMO
SBS Chr7 7842668 G-A HOMO
SBS Chr7 10455393 A-T HOMO
SBS Chr7 10455394 A-T HOMO
SBS Chr7 23982523 C-A HOMO
SBS Chr8 5376022 G-A HET
SBS Chr8 7110404 G-A HOMO
SBS Chr8 11630518 A-T HET
SBS Chr8 24270259 T-G HET
SBS Chr8 26450267 C-T HET OsKitaake08g212100
SBS Chr9 459583 T-A HET
SBS Chr9 3422802 G-A HET
SBS Chr9 6405368 C-T HET
SBS Chr9 21891099 G-A HET
SBS Chr10 10022838 C-T HET
SBS Chr10 13029077 C-T HOMO
SBS Chr10 16825687 A-T HET
SBS Chr10 18833119 C-T HET OsKitaake10g134100
SBS Chr10 19408090 G-A HOMO OsKitaake10g141700
SBS Chr10 19466602 C-A HET OsKitaake10g142600
SBS Chr10 22315804 G-C HET
SBS Chr11 13302703 G-A HET
SBS Chr11 26316507 C-T HET
SBS Chr11 26316544 A-T HET
SBS Chr12 86509 G-T HET
SBS Chr12 12304254 C-A HET
SBS Chr12 13368270 C-A HET OsKitaake12g111100

Deletions: 15

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr7 1980245 1980245 1
Deletion Chr9 2180837 2180837 1
Deletion Chr1 3922345 3922352 8
Deletion Chr2 4613865 4613865 1
Deletion Chr1 6319008 6319008 1
Deletion Chr11 6595623 6595624 2
Deletion Chr7 7842720 7842720 1
Deletion Chr11 10167563 10167563 1
Deletion Chr9 15147247 15147259 13
Deletion Chr2 17006894 17006894 1
Deletion Chr2 19548902 19548903 2
Deletion Chr1 22106533 22106534 2
Deletion Chr6 26120954 26120973 20 OsKitaake06g233603
Deletion Chr4 28157834 28157834 1
Deletion Chr6 30170996 30171000 5

Insertions: 13

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 39824294 39824296 1
Insertion Chr1 44164184 44164186 1
Insertion Chr2 20834599 20834602 2
Insertion Chr4 1444942 1444945 2
Insertion Chr4 16335113 16335115 1
Insertion Chr5 15427052 15427054 1
Insertion Chr6 6523592 6523594 1
Insertion Chr8 14233074 14233076 1
Insertion Chr11 12457686 12457740 53
Insertion Chr5 6209503 6209505 1
Insertion Chr5 18619938 18619940 1
Insertion Chr6 30064211 30064213 1
Insertion Chr10 9306413 9306415 1

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr1 1810285 2162412 OsKitaake01g021500
Inversion Chr1 1810286 2162426 OsKitaake01g021500
Inversion Chr6 12971095 12971393

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 16764598 Chr4 22995503 OsKitaake04g139400
Translocation Chr5 16820326 Chr4 22997034

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	20839617	C-A	HET
SBS	Chr1	22618932	C-A	HET
SBS	Chr1	27637929	A-G	HET
SBS	Chr1	30591472	G-T	HET
SBS	Chr1	36684810	C-T	HOMO
SBS	Chr2	71390	C-T	HET
SBS	Chr2	4648650	C-A	HOMO
SBS	Chr2	4648651	T-A	HOMO
SBS	Chr2	20270304	G-T	HET
SBS	Chr2	24665854	G-A	HET
SBS	Chr2	25785215	C-T	HET
SBS	Chr2	32050671	A-G	HET
SBS	Chr3	10252485	G-A	HET
SBS	Chr3	18050388	C-T	HOMO
SBS	Chr3	29103700	C-T	HET
SBS	Chr3	32037671	C-T	HET
SBS	Chr3	35473721	G-T	HET
SBS	Chr3	35873074	T-C	HET
SBS	Chr4	1700909	A-G	HET
SBS	Chr4	3569250	G-A	HET
SBS	Chr4	6725146	G-C	HET
SBS	Chr4	23687173	C-T	HET
SBS	Chr5	7360352	T-C	HET
SBS	Chr5	9311186	A-G	HET
SBS	Chr5	11397393	G-A	HET
SBS	Chr5	15748172	C-T	HET		OsKitaake05g121300
SBS	Chr5	18926865	G-T	HET
SBS	Chr5	19668116	A-T	HET
SBS	Chr5	19668119	G-T	HET
SBS	Chr5	24722646	G-A	HET
SBS	Chr6	3715294	G-T	HET
SBS	Chr6	10041297	T-A	HET
SBS	Chr6	13704146	C-T	HOMO
SBS	Chr6	16879595	T-C	HET
SBS	Chr6	18091630	T-A	HET
SBS	Chr6	20947388	G-A	HOMO
SBS	Chr6	23254046	A-G	HET
SBS	Chr7	2938390	T-A	HOMO
SBS	Chr7	5526152	C-A	HOMO
SBS	Chr7	5877195	G-T	HET
SBS	Chr7	7842667	C-T	HOMO
SBS	Chr7	7842668	G-A	HOMO
SBS	Chr7	10455393	A-T	HOMO
SBS	Chr7	10455394	A-T	HOMO
SBS	Chr7	23982523	C-A	HOMO
SBS	Chr8	5376022	G-A	HET
SBS	Chr8	7110404	G-A	HOMO
SBS	Chr8	11630518	A-T	HET
SBS	Chr8	24270259	T-G	HET
SBS	Chr8	26450267	C-T	HET		OsKitaake08g212100
SBS	Chr9	459583	T-A	HET
SBS	Chr9	3422802	G-A	HET
SBS	Chr9	6405368	C-T	HET
SBS	Chr9	21891099	G-A	HET
SBS	Chr10	10022838	C-T	HET
SBS	Chr10	13029077	C-T	HOMO
SBS	Chr10	16825687	A-T	HET
SBS	Chr10	18833119	C-T	HET		OsKitaake10g134100
SBS	Chr10	19408090	G-A	HOMO		OsKitaake10g141700
SBS	Chr10	19466602	C-A	HET		OsKitaake10g142600
SBS	Chr10	22315804	G-C	HET
SBS	Chr11	13302703	G-A	HET
SBS	Chr11	26316507	C-T	HET
SBS	Chr11	26316544	A-T	HET
SBS	Chr12	86509	G-T	HET
SBS	Chr12	12304254	C-A	HET
SBS	Chr12	13368270	C-A	HET		OsKitaake12g111100

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	1980245	1980245	1
Deletion	Chr9	2180837	2180837	1
Deletion	Chr1	3922345	3922352	8
Deletion	Chr2	4613865	4613865	1
Deletion	Chr1	6319008	6319008	1
Deletion	Chr11	6595623	6595624	2
Deletion	Chr7	7842720	7842720	1
Deletion	Chr11	10167563	10167563	1
Deletion	Chr9	15147247	15147259	13
Deletion	Chr2	17006894	17006894	1
Deletion	Chr2	19548902	19548903	2
Deletion	Chr1	22106533	22106534	2
Deletion	Chr6	26120954	26120973	20	OsKitaake06g233603
Deletion	Chr4	28157834	28157834	1
Deletion	Chr6	30170996	30171000	5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	1810285	2162412	OsKitaake01g021500
Inversion	Chr1	1810286	2162426	OsKitaake01g021500
Inversion	Chr6	12971095	12971393

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes