Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4529-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4529-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 111

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 1037188 G-A HET OsKitaake01g012300
SBS Chr1 13124186 A-G HET
SBS Chr1 22156357 C-T HET
SBS Chr1 23794608 G-A HOMO
SBS Chr1 23794609 T-C HOMO
SBS Chr1 23794610 G-T HOMO
SBS Chr1 24946612 T-C HET
SBS Chr1 27175263 T-A HET
SBS Chr1 30540889 C-A HET
SBS Chr1 32534480 A-T HET
SBS Chr1 34756165 T-A HET
SBS Chr1 38669143 T-C HET
SBS Chr2 12285515 A-G HET
SBS Chr2 16082246 C-T HET
SBS Chr2 18006159 G-T HET
SBS Chr2 18029164 T-A HET
SBS Chr2 18606994 T-C HET
SBS Chr2 19874382 C-T HET
SBS Chr2 23483885 T-C HOMO
SBS Chr2 25358251 T-A HET
SBS Chr2 25673067 G-C HET
SBS Chr2 36108951 A-G HET OsKitaake02g380600
SBS Chr3 1791667 G-A HET
SBS Chr3 2683689 C-A HOMO
SBS Chr3 4971400 C-T HOMO
SBS Chr3 7096400 T-A HET
SBS Chr3 7096401 T-A HET
SBS Chr3 7096402 G-A HET
SBS Chr3 8147278 A-G HET
SBS Chr3 8933122 C-A HET
SBS Chr3 15065393 T-A HET
SBS Chr3 15825957 T-C HET
SBS Chr3 19225004 C-G HOMO
SBS Chr3 23185099 G-A HET
SBS Chr3 27139358 G-A HET
SBS Chr3 28047992 G-T HET OsKitaake03g290100
SBS Chr3 33403694 T-A HET
SBS Chr4 2276691 G-A HET
SBS Chr4 9234963 C-A HET OsKitaake04g047500
SBS Chr4 15971354 A-T HOMO
SBS Chr4 21022477 G-A HOMO
SBS Chr4 25074260 C-A HET
SBS Chr4 32829769 G-A HET
SBS Chr4 36422961 T-C HET
SBS Chr5 862102 C-T HET
SBS Chr5 3958760 T-C HET
SBS Chr5 16860461 A-G HET
SBS Chr5 18225764 T-A HET OsKitaake05g142000
SBS Chr5 18225765 G-A HET OsKitaake05g142000
SBS Chr5 18837053 G-A HET
SBS Chr5 19202890 A-C HET
SBS Chr5 19347684 G-A HET
SBS Chr5 19413450 A-T HET
SBS Chr5 23194683 C-A HET
SBS Chr5 26738697 G-T HET
SBS Chr6 2431991 T-G HET
SBS Chr6 5737154 G-A HET
SBS Chr6 8430166 G-A HET
SBS Chr6 10055024 G-A HET
SBS Chr6 12182481 A-G HET
SBS Chr6 12384243 C-T HET
SBS Chr6 13882202 G-T HET
SBS Chr6 17967510 G-T HET OsKitaake06g165100
SBS Chr6 21865980 T-A HET
SBS Chr6 22296671 G-A HET
SBS Chr7 451123 A-G HET
SBS Chr7 2225255 T-A HET
SBS Chr7 7174965 C-T HET
SBS Chr7 9340297 A-G HET
SBS Chr7 10516096 G-T HET
SBS Chr7 12378410 G-T HOMO
SBS Chr7 23225714 A-G HET
SBS Chr7 24828868 C-T HET OsKitaake07g221800
SBS Chr8 10400060 A-T HET
SBS Chr8 13173492 A-G HET
SBS Chr8 14329934 C-A HET
SBS Chr8 16252149 C-T HET
SBS Chr9 2037125 C-T HET
SBS Chr9 4347690 C-T HET
SBS Chr9 5685870 C-A HET
SBS Chr9 8554212 C-T HET
SBS Chr9 10633501 A-T HOMO
SBS Chr9 12620615 A-C HOMO
SBS Chr9 16229282 A-G HET
SBS Chr9 16409480 C-T HET
SBS Chr9 21121241 C-A HET
SBS Chr10 2138547 C-A HET
SBS Chr10 15953702 C-A HET
SBS Chr10 23087544 C-T HET
SBS Chr10 23697119 G-T HET OsKitaake10g203400
SBS Chr11 404195 C-A HET
SBS Chr11 7602509 C-A HET
SBS Chr11 8958115 G-A HET
SBS Chr11 13062477 A-G HET
SBS Chr11 15477477 G-T HET
SBS Chr11 23681011 C-A HET
SBS Chr12 2601080 G-A HET
SBS Chr12 4532901 G-A HET
SBS Chr12 6248793 T-C HET
SBS Chr12 12035071 T-C HET
SBS Chr12 12054377 G-T HET OsKitaake12g105100
SBS Chr12 13386633 G-A HET
SBS Chr12 15054293 G-C HET
SBS Chr12 15509141 T-C HET
SBS Chr12 16350711 A-T HET
SBS Chr12 16809951 T-C HET
SBS Chr12 21841416 C-G HET
SBS Chr12 22647398 C-A HET
SBS Chr12 24971271 T-A HOMO
SBS Chr12 24971273 G-A HOMO
SBS Chr12 26272877 C-A HET

Deletions: 17

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr7 878157 878157 1
Deletion Chr11 2120512 2120512 1
Deletion Chr8 4559420 4559421 2
Deletion Chr6 4737501 4737501 1
Deletion Chr12 7028032 7028041 10
Deletion Chr4 10461475 10461475 1
Deletion Chr5 17802002 17802002 1
Deletion Chr5 19365001 19389000 24000 4
Deletion Chr3 20036003 20036157 155
Deletion Chr4 20841764 20841764 1
Deletion Chr10 21857699 21857732 34
Deletion Chr12 22571060 22571081 22
Deletion Chr1 23798698 23798700 3
Deletion Chr12 26395444 26395444 1
Deletion Chr5 27234001 27397000 163000 21
Deletion Chr7 27308773 27308842 70
Deletion Chr4 32910001 33545000 635000 103

Insertions: 10

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr2 33849029 33849047 17
Insertion Chr3 946932 946934 1
Insertion Chr1 30455922 30455924 1
Insertion Chr2 5632733 5632736 2
Insertion Chr2 34892861 34892863 1
Insertion Chr6 22308015 22308017 1
Insertion Chr6 30918795 30918797 1
Insertion Chr9 13308873 13308875 1
Insertion Chr10 3134106 3134108 1
Insertion Chr11 25691568 25691570 1

Inversions: 6

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr6 7243555 7243756 OsKitaake06g093400
Inversion Chr7 8059215 8059381
Inversion Chr8 9198142 9198231
Inversion Chr10 10509538 10509676
Inversion Chr4 13980105 13980294
Inversion Chr7 15854319 15854562

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1037188	G-A	HET		OsKitaake01g012300
SBS	Chr1	13124186	A-G	HET
SBS	Chr1	22156357	C-T	HET
SBS	Chr1	23794608	G-A	HOMO
SBS	Chr1	23794609	T-C	HOMO
SBS	Chr1	23794610	G-T	HOMO
SBS	Chr1	24946612	T-C	HET
SBS	Chr1	27175263	T-A	HET
SBS	Chr1	30540889	C-A	HET
SBS	Chr1	32534480	A-T	HET
SBS	Chr1	34756165	T-A	HET
SBS	Chr1	38669143	T-C	HET
SBS	Chr2	12285515	A-G	HET
SBS	Chr2	16082246	C-T	HET
SBS	Chr2	18006159	G-T	HET
SBS	Chr2	18029164	T-A	HET
SBS	Chr2	18606994	T-C	HET
SBS	Chr2	19874382	C-T	HET
SBS	Chr2	23483885	T-C	HOMO
SBS	Chr2	25358251	T-A	HET
SBS	Chr2	25673067	G-C	HET
SBS	Chr2	36108951	A-G	HET		OsKitaake02g380600
SBS	Chr3	1791667	G-A	HET
SBS	Chr3	2683689	C-A	HOMO
SBS	Chr3	4971400	C-T	HOMO
SBS	Chr3	7096400	T-A	HET
SBS	Chr3	7096401	T-A	HET
SBS	Chr3	7096402	G-A	HET
SBS	Chr3	8147278	A-G	HET
SBS	Chr3	8933122	C-A	HET
SBS	Chr3	15065393	T-A	HET
SBS	Chr3	15825957	T-C	HET
SBS	Chr3	19225004	C-G	HOMO
SBS	Chr3	23185099	G-A	HET
SBS	Chr3	27139358	G-A	HET
SBS	Chr3	28047992	G-T	HET		OsKitaake03g290100
SBS	Chr3	33403694	T-A	HET
SBS	Chr4	2276691	G-A	HET
SBS	Chr4	9234963	C-A	HET		OsKitaake04g047500
SBS	Chr4	15971354	A-T	HOMO
SBS	Chr4	21022477	G-A	HOMO
SBS	Chr4	25074260	C-A	HET
SBS	Chr4	32829769	G-A	HET
SBS	Chr4	36422961	T-C	HET
SBS	Chr5	862102	C-T	HET
SBS	Chr5	3958760	T-C	HET
SBS	Chr5	16860461	A-G	HET
SBS	Chr5	18225764	T-A	HET		OsKitaake05g142000
SBS	Chr5	18225765	G-A	HET		OsKitaake05g142000
SBS	Chr5	18837053	G-A	HET
SBS	Chr5	19202890	A-C	HET
SBS	Chr5	19347684	G-A	HET
SBS	Chr5	19413450	A-T	HET
SBS	Chr5	23194683	C-A	HET
SBS	Chr5	26738697	G-T	HET
SBS	Chr6	2431991	T-G	HET
SBS	Chr6	5737154	G-A	HET
SBS	Chr6	8430166	G-A	HET
SBS	Chr6	10055024	G-A	HET
SBS	Chr6	12182481	A-G	HET
SBS	Chr6	12384243	C-T	HET
SBS	Chr6	13882202	G-T	HET
SBS	Chr6	17967510	G-T	HET		OsKitaake06g165100
SBS	Chr6	21865980	T-A	HET
SBS	Chr6	22296671	G-A	HET
SBS	Chr7	451123	A-G	HET
SBS	Chr7	2225255	T-A	HET
SBS	Chr7	7174965	C-T	HET
SBS	Chr7	9340297	A-G	HET
SBS	Chr7	10516096	G-T	HET
SBS	Chr7	12378410	G-T	HOMO
SBS	Chr7	23225714	A-G	HET
SBS	Chr7	24828868	C-T	HET		OsKitaake07g221800
SBS	Chr8	10400060	A-T	HET
SBS	Chr8	13173492	A-G	HET
SBS	Chr8	14329934	C-A	HET
SBS	Chr8	16252149	C-T	HET
SBS	Chr9	2037125	C-T	HET
SBS	Chr9	4347690	C-T	HET
SBS	Chr9	5685870	C-A	HET
SBS	Chr9	8554212	C-T	HET
SBS	Chr9	10633501	A-T	HOMO
SBS	Chr9	12620615	A-C	HOMO
SBS	Chr9	16229282	A-G	HET
SBS	Chr9	16409480	C-T	HET
SBS	Chr9	21121241	C-A	HET
SBS	Chr10	2138547	C-A	HET
SBS	Chr10	15953702	C-A	HET
SBS	Chr10	23087544	C-T	HET
SBS	Chr10	23697119	G-T	HET		OsKitaake10g203400
SBS	Chr11	404195	C-A	HET
SBS	Chr11	7602509	C-A	HET
SBS	Chr11	8958115	G-A	HET
SBS	Chr11	13062477	A-G	HET
SBS	Chr11	15477477	G-T	HET
SBS	Chr11	23681011	C-A	HET
SBS	Chr12	2601080	G-A	HET
SBS	Chr12	4532901	G-A	HET
SBS	Chr12	6248793	T-C	HET
SBS	Chr12	12035071	T-C	HET
SBS	Chr12	12054377	G-T	HET		OsKitaake12g105100
SBS	Chr12	13386633	G-A	HET
SBS	Chr12	15054293	G-C	HET
SBS	Chr12	15509141	T-C	HET
SBS	Chr12	16350711	A-T	HET
SBS	Chr12	16809951	T-C	HET
SBS	Chr12	21841416	C-G	HET
SBS	Chr12	22647398	C-A	HET
SBS	Chr12	24971271	T-A	HOMO
SBS	Chr12	24971273	G-A	HOMO
SBS	Chr12	26272877	C-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	878157	878157	1
Deletion	Chr11	2120512	2120512	1
Deletion	Chr8	4559420	4559421	2
Deletion	Chr6	4737501	4737501	1
Deletion	Chr12	7028032	7028041	10
Deletion	Chr4	10461475	10461475	1
Deletion	Chr5	17802002	17802002	1
Deletion	Chr5	19365001	19389000	24000	4
Deletion	Chr3	20036003	20036157	155
Deletion	Chr4	20841764	20841764	1
Deletion	Chr10	21857699	21857732	34
Deletion	Chr12	22571060	22571081	22
Deletion	Chr1	23798698	23798700	3
Deletion	Chr12	26395444	26395444	1
Deletion	Chr5	27234001	27397000	163000	21
Deletion	Chr7	27308773	27308842	70
Deletion	Chr4	32910001	33545000	635000	103

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr6	7243555	7243756	OsKitaake06g093400
Inversion	Chr7	8059215	8059381
Inversion	Chr8	9198142	9198231
Inversion	Chr10	10509538	10509676
Inversion	Chr4	13980105	13980294
Inversion	Chr7	15854319	15854562

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes