Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4546-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4546-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 6497294 G-A HET
SBS Chr1 9400772 A-T HET
SBS Chr1 9501676 G-A HET
SBS Chr1 35734675 C-T HET
SBS Chr2 13104348 G-A HOMO
SBS Chr2 24293510 G-T HOMO
SBS Chr2 28301753 C-T HOMO
SBS Chr3 11792047 C-T HET
SBS Chr3 18164703 C-T HOMO
SBS Chr3 26158677 G-A HET
SBS Chr3 31068837 C-T HET
SBS Chr3 37702313 T-A HET
SBS Chr4 2301064 A-G HOMO
SBS Chr4 4759815 G-A HET
SBS Chr4 10051823 A-G HOMO
SBS Chr5 6265345 A-T HET
SBS Chr5 7368835 G-T HET
SBS Chr5 8793143 C-T HET OsKitaake05g083300
SBS Chr5 28250943 A-G HOMO
SBS Chr6 15506974 T-C HET
SBS Chr6 17105601 T-C HET
SBS Chr7 8051254 A-G HET OsKitaake07g088500
SBS Chr7 13577318 G-A HET
SBS Chr7 27720427 T-A HET
SBS Chr8 4105370 C-T HOMO
SBS Chr8 6041036 G-A HET
SBS Chr8 11134575 C-T HET
SBS Chr8 16735889 A-T HET
SBS Chr8 24482812 T-C HET
SBS Chr9 11731099 G-A HET
SBS Chr10 2960133 A-C HET
SBS Chr10 10935242 C-T HET
SBS Chr10 14438175 G-A HET
SBS Chr10 17318320 G-C HET
SBS Chr10 21176906 T-A HET
SBS Chr11 22111985 T-G HET
SBS Chr11 24447700 T-A HET
SBS Chr12 1110646 G-A HET
SBS Chr12 1450687 A-T HET
SBS Chr12 6508208 G-A HET
SBS Chr12 14898216 T-C HET

Deletions: 28

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr7 2263001 2269000 6000 OsKitaake07g031601
Deletion Chr4 2301039 2301039 1
Deletion Chr2 6034770 6034770 1
Deletion Chr6 8553279 8553279 1 2
Deletion Chr9 8628325 8628326 2
Deletion Chr1 8752292 8752292 1
Deletion Chr8 9483499 9483500 2
Deletion Chr7 10189783 10189783 1
Deletion Chr12 15827367 15827367 1
Deletion Chr8 16432176 16432180 5
Deletion Chr1 17604835 17604837 3
Deletion Chr8 18088353 18088358 6
Deletion Chr1 18242518 18242518 1
Deletion Chr10 20558696 20558696 1
Deletion Chr12 21358189 21358189 1
Deletion Chr4 21420005 21420005 1
Deletion Chr7 22588765 22588775 11
Deletion Chr5 24434174 24434174 1
Deletion Chr2 24692400 24692401 2
Deletion Chr2 25305398 25305400 3
Deletion Chr7 25934535 25934535 1
Deletion Chr1 27635961 27635961 1 OsKitaake01g268700
Deletion Chr2 28303602 28303608 7
Deletion Chr4 31816078 31816079 2
Deletion Chr4 33200932 33200940 9
Deletion Chr1 41504098 41504098 1
Deletion Chr1 41712030 41712033 4
Deletion Chr1 42429899 42429899 1

Insertions: 8

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 1646301 1646303 1
Insertion Chr7 7242602 7242604 1
Insertion Chr2 16676189 16676192 2
Insertion Chr2 29927134 29927136 1
Insertion Chr4 24756078 24756081 2
Insertion Chr6 30137310 30137312 1
Insertion Chr10 10668616 10668619 2
Insertion Chr12 18415749 18415751 1

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr12 4924489 4924626
Inversion Chr10 11248007 11248165
Inversion Chr5 15773303 16206493

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr4 19565336 Chr1 41714447
Translocation Chr4 19565343 Chr1 41711601 OsKitaake01g455900

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	6497294	G-A	HET
SBS	Chr1	9400772	A-T	HET
SBS	Chr1	9501676	G-A	HET
SBS	Chr1	35734675	C-T	HET
SBS	Chr2	13104348	G-A	HOMO
SBS	Chr2	24293510	G-T	HOMO
SBS	Chr2	28301753	C-T	HOMO
SBS	Chr3	11792047	C-T	HET
SBS	Chr3	18164703	C-T	HOMO
SBS	Chr3	26158677	G-A	HET
SBS	Chr3	31068837	C-T	HET
SBS	Chr3	37702313	T-A	HET
SBS	Chr4	2301064	A-G	HOMO
SBS	Chr4	4759815	G-A	HET
SBS	Chr4	10051823	A-G	HOMO
SBS	Chr5	6265345	A-T	HET
SBS	Chr5	7368835	G-T	HET
SBS	Chr5	8793143	C-T	HET		OsKitaake05g083300
SBS	Chr5	28250943	A-G	HOMO
SBS	Chr6	15506974	T-C	HET
SBS	Chr6	17105601	T-C	HET
SBS	Chr7	8051254	A-G	HET		OsKitaake07g088500
SBS	Chr7	13577318	G-A	HET
SBS	Chr7	27720427	T-A	HET
SBS	Chr8	4105370	C-T	HOMO
SBS	Chr8	6041036	G-A	HET
SBS	Chr8	11134575	C-T	HET
SBS	Chr8	16735889	A-T	HET
SBS	Chr8	24482812	T-C	HET
SBS	Chr9	11731099	G-A	HET
SBS	Chr10	2960133	A-C	HET
SBS	Chr10	10935242	C-T	HET
SBS	Chr10	14438175	G-A	HET
SBS	Chr10	17318320	G-C	HET
SBS	Chr10	21176906	T-A	HET
SBS	Chr11	22111985	T-G	HET
SBS	Chr11	24447700	T-A	HET
SBS	Chr12	1110646	G-A	HET
SBS	Chr12	1450687	A-T	HET
SBS	Chr12	6508208	G-A	HET
SBS	Chr12	14898216	T-C	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	2263001	2269000	6000	OsKitaake07g031601
Deletion	Chr4	2301039	2301039	1
Deletion	Chr2	6034770	6034770	1
Deletion	Chr6	8553279	8553279	1	2
Deletion	Chr9	8628325	8628326	2
Deletion	Chr1	8752292	8752292	1
Deletion	Chr8	9483499	9483500	2
Deletion	Chr7	10189783	10189783	1
Deletion	Chr12	15827367	15827367	1
Deletion	Chr8	16432176	16432180	5
Deletion	Chr1	17604835	17604837	3
Deletion	Chr8	18088353	18088358	6
Deletion	Chr1	18242518	18242518	1
Deletion	Chr10	20558696	20558696	1
Deletion	Chr12	21358189	21358189	1
Deletion	Chr4	21420005	21420005	1
Deletion	Chr7	22588765	22588775	11
Deletion	Chr5	24434174	24434174	1
Deletion	Chr2	24692400	24692401	2
Deletion	Chr2	25305398	25305400	3
Deletion	Chr7	25934535	25934535	1
Deletion	Chr1	27635961	27635961	1	OsKitaake01g268700
Deletion	Chr2	28303602	28303608	7
Deletion	Chr4	31816078	31816079	2
Deletion	Chr4	33200932	33200940	9
Deletion	Chr1	41504098	41504098	1
Deletion	Chr1	41712030	41712033	4
Deletion	Chr1	42429899	42429899	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	4924489	4924626
Inversion	Chr10	11248007	11248165
Inversion	Chr5	15773303	16206493

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes