Search Kitaake
| Mutant Information |
|---|
| Mutant Name | FN4561-S [Download] |
| Generation | M2 |
| Genus Species | Oryza Sativa |
| Cultivar | Kitaake |
| Alignment File (BAM File) | Download FN4561-S Alignment File |
| Seed Availability | Yes [Order Seeds] |
| Variant Information |
|---|
Single base substitutions: 65
Variant Type |
Chromosome |
Position |
Change |
Genotype |
Effect |
Gene Affected |
| SBS | Chr1 | 12460217 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr1 | 20537197 | G-T | HOMO | ||
| SBS | Chr1 | 29264243 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr1 | 31104334 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr1 | 34534167 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr1 | 37813167 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr1 | 41439455 | C-T | HOMO | ||
| SBS | Chr2 | 6209706 | C-T | HET | OsKitaake02g084100 | |
| SBS | Chr2 | 6392450 | C-T | HOMO | ||
| SBS | Chr2 | 7145210 | G-A | HOMO | ||
| SBS | Chr2 | 7585867 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr2 | 12381212 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr3 | 16545185 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr3 | 21338967 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr3 | 35047907 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr3 | 37320849 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr4 | 2776991 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr4 | 6790954 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr4 | 25678627 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr4 | 32072065 | G-A | HOMO | ||
| SBS | Chr5 | 6173409 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 9073556 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 21059780 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr5 | 22790101 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 11564553 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 17779309 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 18890961 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr6 | 21314570 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr6 | 23975457 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 24636484 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 24636485 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 25045543 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 7499228 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr7 | 7717208 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr7 | 11759888 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr8 | 2183643 | T-G | HOMO | OsKitaake08g026100 | |
| SBS | Chr8 | 6664470 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr8 | 8623940 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr8 | 28627825 | C-T | HOMO | ||
| SBS | Chr9 | 2193405 | T-C | HOMO | ||
| SBS | Chr9 | 4705541 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr9 | 16355024 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr10 | 5831502 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr10 | 7582994 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr10 | 14291204 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr10 | 16442771 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr11 | 13248893 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 13337023 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 14702892 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 15869244 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr11 | 17021114 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 17937101 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 22000707 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 24096688 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 24264027 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 24415934 | A-T | HOMO | OsKitaake11g196200 | |
| SBS | Chr12 | 2947420 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr12 | 5690860 | G-C | HET | ||
| SBS | Chr12 | 10251835 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr12 | 10251836 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr12 | 11144523 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr12 | 13090839 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr12 | 16119271 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr12 | 17507287 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr12 | 25993727 | C-T | HOMO |
Deletions: 18
Insertions: 8
Inversions: 2
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Position 2 |
Number of Genes |
| Inversion | Chr4 | 12320049 | 12320233 | |
| Inversion | Chr12 | 22736830 | 22737003 |
Translocations: 1
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Chromosome |
Position 2 |
Number of Genes |
| Translocation | Chr5 | 15352510 | Chr1 | 15570648 |