Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4566-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4566-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 53

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 9817393 G-T HET
SBS Chr1 11448593 A-T HOMO
SBS Chr1 12187683 C-T HET
SBS Chr1 12704505 A-G HOMO
SBS Chr1 31382543 C-A HET
SBS Chr1 40390544 G-C HOMO
SBS Chr2 2815373 A-G HET
SBS Chr2 15578175 A-C HOMO
SBS Chr3 2625568 G-T HOMO OsKitaake03g037300
SBS Chr3 6537601 C-T HET
SBS Chr3 10413427 G-A HOMO
SBS Chr4 1686824 G-C HOMO
SBS Chr4 6079896 G-A HET
SBS Chr4 21604709 G-A HET
SBS Chr4 21604710 C-G HET
SBS Chr4 21604711 C-A HET
SBS Chr4 31060973 A-G HET
SBS Chr5 4658775 G-A HET
SBS Chr5 17532118 G-A HET
SBS Chr5 22114618 T-G HET
SBS Chr5 22407821 T-C HET
SBS Chr5 24588130 A-G HET
SBS Chr6 3829649 G-A HET OsKitaake06g052800
SBS Chr6 13539031 C-T HOMO
SBS Chr6 15079454 G-A HET
SBS Chr6 24441212 G-T HET
SBS Chr7 1296564 A-G HOMO
SBS Chr7 14897135 T-C HET
SBS Chr7 18532162 G-C HET
SBS Chr7 25749050 G-A HET
SBS Chr8 3460636 A-G HOMO
SBS Chr8 6046215 G-T HET
SBS Chr8 8784718 C-A HET
SBS Chr8 14939802 C-T HET
SBS Chr8 22774695 C-T HET
SBS Chr8 28362176 C-T HET
SBS Chr9 1267367 T-G HET
SBS Chr9 10538713 C-A HET
SBS Chr9 17728431 C-T HET
SBS Chr10 653159 A-G HET
SBS Chr10 991686 C-T HET
SBS Chr10 2331891 A-G HET
SBS Chr10 4497671 G-C HET
SBS Chr11 8648964 G-T HET
SBS Chr11 15116596 A-T HOMO
SBS Chr11 19741153 T-C HET
SBS Chr11 21715196 T-C HET
SBS Chr12 7417206 G-A HET
SBS Chr12 8173592 C-T HET
SBS Chr12 11407284 C-T HET
SBS Chr12 16397758 T-C HOMO
SBS Chr12 17269061 T-A HOMO OsKitaake12g127100
SBS Chr12 21004217 C-A HET

Deletions: 22

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr2 2257495 2257495 1
Deletion Chr4 3113635 3113635 1
Deletion Chr5 5930631 5930631 1
Deletion Chr2 8827282 8827283 2
Deletion Chr9 12095400 12095400 1
Deletion Chr1 12736025 12736030 6
Deletion Chr4 13650207 13650217 11
Deletion Chr12 16409001 16429000 20000 OsKitaake12g124600
Deletion Chr4 17486704 17486709 6
Deletion Chr4 18117012 18117015 4
Deletion Chr10 18323703 18323703 1
Deletion Chr6 18397017 18397023 7
Deletion Chr7 19156532 19156536 5
Deletion Chr6 20328920 20328920 1
Deletion Chr8 21249107 21249107 1
Deletion Chr3 22228166 22228167 2
Deletion Chr6 23319372 23319372 1
Deletion Chr5 23711757 23711757 1
Deletion Chr2 25676334 25676334 1
Deletion Chr1 25872202 25872202 1
Deletion Chr2 28788922 28788927 6
Deletion Chr2 33200507 33200507 1

Insertions: 4

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr4 32021207 32021209 1
Insertion Chr6 5102491 5102499 7
Insertion Chr7 28787632 28787634 1
Insertion Chr11 21935992 21935994 1

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr4 1079650 Chr1 645518
Translocation Chr4 1080098 Chr1 645508
Translocation Chr8 11689875 Chr2 4513328
Translocation Chr8 11689876 Chr2 4513653

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9817393	G-T	HET
SBS	Chr1	11448593	A-T	HOMO
SBS	Chr1	12187683	C-T	HET
SBS	Chr1	12704505	A-G	HOMO
SBS	Chr1	31382543	C-A	HET
SBS	Chr1	40390544	G-C	HOMO
SBS	Chr2	2815373	A-G	HET
SBS	Chr2	15578175	A-C	HOMO
SBS	Chr3	2625568	G-T	HOMO		OsKitaake03g037300
SBS	Chr3	6537601	C-T	HET
SBS	Chr3	10413427	G-A	HOMO
SBS	Chr4	1686824	G-C	HOMO
SBS	Chr4	6079896	G-A	HET
SBS	Chr4	21604709	G-A	HET
SBS	Chr4	21604710	C-G	HET
SBS	Chr4	21604711	C-A	HET
SBS	Chr4	31060973	A-G	HET
SBS	Chr5	4658775	G-A	HET
SBS	Chr5	17532118	G-A	HET
SBS	Chr5	22114618	T-G	HET
SBS	Chr5	22407821	T-C	HET
SBS	Chr5	24588130	A-G	HET
SBS	Chr6	3829649	G-A	HET		OsKitaake06g052800
SBS	Chr6	13539031	C-T	HOMO
SBS	Chr6	15079454	G-A	HET
SBS	Chr6	24441212	G-T	HET
SBS	Chr7	1296564	A-G	HOMO
SBS	Chr7	14897135	T-C	HET
SBS	Chr7	18532162	G-C	HET
SBS	Chr7	25749050	G-A	HET
SBS	Chr8	3460636	A-G	HOMO
SBS	Chr8	6046215	G-T	HET
SBS	Chr8	8784718	C-A	HET
SBS	Chr8	14939802	C-T	HET
SBS	Chr8	22774695	C-T	HET
SBS	Chr8	28362176	C-T	HET
SBS	Chr9	1267367	T-G	HET
SBS	Chr9	10538713	C-A	HET
SBS	Chr9	17728431	C-T	HET
SBS	Chr10	653159	A-G	HET
SBS	Chr10	991686	C-T	HET
SBS	Chr10	2331891	A-G	HET
SBS	Chr10	4497671	G-C	HET
SBS	Chr11	8648964	G-T	HET
SBS	Chr11	15116596	A-T	HOMO
SBS	Chr11	19741153	T-C	HET
SBS	Chr11	21715196	T-C	HET
SBS	Chr12	7417206	G-A	HET
SBS	Chr12	8173592	C-T	HET
SBS	Chr12	11407284	C-T	HET
SBS	Chr12	16397758	T-C	HOMO
SBS	Chr12	17269061	T-A	HOMO		OsKitaake12g127100
SBS	Chr12	21004217	C-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	2257495	2257495	1
Deletion	Chr4	3113635	3113635	1
Deletion	Chr5	5930631	5930631	1
Deletion	Chr2	8827282	8827283	2
Deletion	Chr9	12095400	12095400	1
Deletion	Chr1	12736025	12736030	6
Deletion	Chr4	13650207	13650217	11
Deletion	Chr12	16409001	16429000	20000	OsKitaake12g124600
Deletion	Chr4	17486704	17486709	6
Deletion	Chr4	18117012	18117015	4
Deletion	Chr10	18323703	18323703	1
Deletion	Chr6	18397017	18397023	7
Deletion	Chr7	19156532	19156536	5
Deletion	Chr6	20328920	20328920	1
Deletion	Chr8	21249107	21249107	1
Deletion	Chr3	22228166	22228167	2
Deletion	Chr6	23319372	23319372	1
Deletion	Chr5	23711757	23711757	1
Deletion	Chr2	25676334	25676334	1
Deletion	Chr1	25872202	25872202	1
Deletion	Chr2	28788922	28788927	6
Deletion	Chr2	33200507	33200507	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr4	1079650	Chr1	645518
Translocation	Chr4	1080098	Chr1	645508
Translocation	Chr8	11689875	Chr2	4513328
Translocation	Chr8	11689876	Chr2	4513653

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes