Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4567-2-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4567-2-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 52

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 6507366 T-C HET
SBS Chr1 7519816 G-T HET
SBS Chr1 13159454 G-A HET
SBS Chr1 15932861 C-T HET
SBS Chr1 17036135 C-T HET
SBS Chr1 17036136 C-T HET
SBS Chr1 22679396 G-A HET OsKitaake01g216900
SBS Chr1 25225474 G-T HET
SBS Chr1 25225485 C-T HET OsKitaake01g244200
SBS Chr1 38346206 G-A HET
SBS Chr2 15621429 G-A HET
SBS Chr2 22477375 T-C HET
SBS Chr2 28729584 C-A HET
SBS Chr2 28876633 A-T HET
SBS Chr2 30367864 G-T HET
SBS Chr2 31010982 G-T HET
SBS Chr2 33375942 C-T HET
SBS Chr3 7823380 A-G HET
SBS Chr3 22931804 G-A HET OsKitaake03g248000
SBS Chr4 665435 C-T HET OsKitaake04g005300
SBS Chr4 7474026 G-A HOMO
SBS Chr4 7474027 C-A HOMO
SBS Chr4 11331977 C-A HOMO
SBS Chr4 19297039 T-C HOMO
SBS Chr4 22393167 C-A HOMO
SBS Chr4 28365640 G-T HOMO
SBS Chr5 5713423 G-T HOMO
SBS Chr5 22169196 A-T HET
SBS Chr6 2872125 A-G HET
SBS Chr6 16451493 T-G HET
SBS Chr6 22019770 T-A HET
SBS Chr6 27288160 C-A HET
SBS Chr7 6697457 A-G HET
SBS Chr7 7430766 G-T HOMO
SBS Chr7 13933229 T-C HET
SBS Chr7 24799838 T-G HET
SBS Chr7 25328522 C-A HET
SBS Chr7 25416446 T-A HET
SBS Chr8 3100184 A-G HET
SBS Chr8 7011494 G-T HET
SBS Chr9 1515639 C-A HET
SBS Chr9 2135872 C-A HET
SBS Chr9 4577601 A-G HOMO
SBS Chr9 20644680 C-G HET
SBS Chr10 17503139 A-G HET OsKitaake10g119300
SBS Chr10 20547930 A-G HET
SBS Chr11 2104151 G-A HOMO
SBS Chr11 9062741 T-A HET
SBS Chr11 10172301 C-T HET
SBS Chr11 20343352 G-A HET
SBS Chr12 7736478 G-A HET
SBS Chr12 9157831 G-A HOMO

Deletions: 21

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr9 599966 599966 1
Deletion Chr8 3552453 3552465 13
Deletion Chr7 5222000 5222009 10
Deletion Chr5 5662001 5859000 197000 15
Deletion Chr5 5863001 6643000 780000 53
Deletion Chr4 7310147 7310147 1
Deletion Chr5 8329180 8329181 2
Deletion Chr10 8357080 8357083 4
Deletion Chr8 10913377 10913377 1
Deletion Chr1 12273981 12273985 5 OsKitaake01g148900
Deletion Chr8 12310839 12310849 11
Deletion Chr5 12393707 12393707 1
Deletion Chr4 12769177 12769179 3
Deletion Chr6 17757236 17757242 7
Deletion Chr3 18897752 18897753 2
Deletion Chr3 20622779 20622782 4
Deletion Chr3 22775237 22775240 4
Deletion Chr12 24254813 24254816 4 OsKitaake12g195200
Deletion Chr6 28260142 28260143 2
Deletion Chr5 30212669 30212669 1
Deletion Chr1 37444172 37444177 6

Insertions: 6

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr6 8032292 8032309 16
Insertion Chr8 20696540 20696542 1
Insertion Chr11 3592816 3592818 1
Insertion Chr2 595707 595710 2
Insertion Chr8 433521 433524 2
Insertion Chr8 16954194 16954196 1

Inversions: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr10 18916968 18917223
Inversion Chr5 23219575 23667262
Inversion Chr3 32577431 33282215
Inversion Chr3 32577440 33282234

Translocations: 1

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 23219511 Chr1 10128652

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	6507366	T-C	HET
SBS	Chr1	7519816	G-T	HET
SBS	Chr1	13159454	G-A	HET
SBS	Chr1	15932861	C-T	HET
SBS	Chr1	17036135	C-T	HET
SBS	Chr1	17036136	C-T	HET
SBS	Chr1	22679396	G-A	HET		OsKitaake01g216900
SBS	Chr1	25225474	G-T	HET
SBS	Chr1	25225485	C-T	HET		OsKitaake01g244200
SBS	Chr1	38346206	G-A	HET
SBS	Chr2	15621429	G-A	HET
SBS	Chr2	22477375	T-C	HET
SBS	Chr2	28729584	C-A	HET
SBS	Chr2	28876633	A-T	HET
SBS	Chr2	30367864	G-T	HET
SBS	Chr2	31010982	G-T	HET
SBS	Chr2	33375942	C-T	HET
SBS	Chr3	7823380	A-G	HET
SBS	Chr3	22931804	G-A	HET		OsKitaake03g248000
SBS	Chr4	665435	C-T	HET		OsKitaake04g005300
SBS	Chr4	7474026	G-A	HOMO
SBS	Chr4	7474027	C-A	HOMO
SBS	Chr4	11331977	C-A	HOMO
SBS	Chr4	19297039	T-C	HOMO
SBS	Chr4	22393167	C-A	HOMO
SBS	Chr4	28365640	G-T	HOMO
SBS	Chr5	5713423	G-T	HOMO
SBS	Chr5	22169196	A-T	HET
SBS	Chr6	2872125	A-G	HET
SBS	Chr6	16451493	T-G	HET
SBS	Chr6	22019770	T-A	HET
SBS	Chr6	27288160	C-A	HET
SBS	Chr7	6697457	A-G	HET
SBS	Chr7	7430766	G-T	HOMO
SBS	Chr7	13933229	T-C	HET
SBS	Chr7	24799838	T-G	HET
SBS	Chr7	25328522	C-A	HET
SBS	Chr7	25416446	T-A	HET
SBS	Chr8	3100184	A-G	HET
SBS	Chr8	7011494	G-T	HET
SBS	Chr9	1515639	C-A	HET
SBS	Chr9	2135872	C-A	HET
SBS	Chr9	4577601	A-G	HOMO
SBS	Chr9	20644680	C-G	HET
SBS	Chr10	17503139	A-G	HET		OsKitaake10g119300
SBS	Chr10	20547930	A-G	HET
SBS	Chr11	2104151	G-A	HOMO
SBS	Chr11	9062741	T-A	HET
SBS	Chr11	10172301	C-T	HET
SBS	Chr11	20343352	G-A	HET
SBS	Chr12	7736478	G-A	HET
SBS	Chr12	9157831	G-A	HOMO

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr9	599966	599966	1
Deletion	Chr8	3552453	3552465	13
Deletion	Chr7	5222000	5222009	10
Deletion	Chr5	5662001	5859000	197000	15
Deletion	Chr5	5863001	6643000	780000	53
Deletion	Chr4	7310147	7310147	1
Deletion	Chr5	8329180	8329181	2
Deletion	Chr10	8357080	8357083	4
Deletion	Chr8	10913377	10913377	1
Deletion	Chr1	12273981	12273985	5	OsKitaake01g148900
Deletion	Chr8	12310839	12310849	11
Deletion	Chr5	12393707	12393707	1
Deletion	Chr4	12769177	12769179	3
Deletion	Chr6	17757236	17757242	7
Deletion	Chr3	18897752	18897753	2
Deletion	Chr3	20622779	20622782	4
Deletion	Chr3	22775237	22775240	4
Deletion	Chr12	24254813	24254816	4	OsKitaake12g195200
Deletion	Chr6	28260142	28260143	2
Deletion	Chr5	30212669	30212669	1
Deletion	Chr1	37444172	37444177	6

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	18916968	18917223
Inversion	Chr5	23219575	23667262
Inversion	Chr3	32577431	33282215
Inversion	Chr3	32577440	33282234

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes