Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4569-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4569-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3139414 T-A HET
SBS Chr1 11686946 C-A HET
SBS Chr1 22283184 T-C HET
SBS Chr1 38546811 T-C HET
SBS Chr2 15200408 A-T HET
SBS Chr2 19129495 A-T HET
SBS Chr3 7604099 A-G HET
SBS Chr4 24561 G-A HET
SBS Chr4 14867627 G-C HET OsKitaake04g070700
SBS Chr4 31275897 C-A HET
SBS Chr4 35825417 C-G HOMO
SBS Chr5 3348204 A-T HET
SBS Chr5 11833005 G-A HET
SBS Chr5 29283536 G-A HET
SBS Chr5 29283548 T-A HET
SBS Chr6 8747368 G-A HET
SBS Chr6 9235778 G-T HET
SBS Chr6 14112545 A-G HET
SBS Chr6 22245889 T-C HET
SBS Chr7 3613900 T-C HET
SBS Chr7 4731699 G-A HET
SBS Chr7 16679710 G-A HET
SBS Chr8 1951506 G-A HET
SBS Chr8 14206732 G-T HET
SBS Chr8 17785771 G-A HET
SBS Chr8 26785694 C-A HET
SBS Chr8 27973790 G-C HET
SBS Chr9 3380160 T-C HET
SBS Chr9 4322340 A-G HET
SBS Chr9 6240828 C-T HET
SBS Chr9 13196152 C-T HOMO
SBS Chr10 3217348 C-T HET
SBS Chr10 21720632 T-A HET
SBS Chr11 4832172 G-T HET
SBS Chr11 13477909 C-T HOMO
SBS Chr11 16719138 T-C HET
SBS Chr11 17584148 A-G HET
SBS Chr11 23427825 T-A HET
SBS Chr11 28144796 G-A HOMO
SBS Chr12 4191728 T-C HET
SBS Chr12 4720521 G-A HET

Deletions: 21

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr11 3415001 3442000 27000
Deletion Chr4 3876265 3876269 5
Deletion Chr12 6383943 6383945 3 OsKitaake12g073700
Deletion Chr7 6757076 6757076 1
Deletion Chr1 7064082 7064084 3
Deletion Chr8 7981188 7981191 4
Deletion Chr10 8217519 8217519 1
Deletion Chr7 9481624 9481635 12
Deletion Chr3 10183074 10183074 1
Deletion Chr2 16323640 16323643 4
Deletion Chr8 17000286 17000290 5
Deletion Chr8 17642274 17642274 1
Deletion Chr9 19076307 19076307 1
Deletion Chr7 21976534 21976535 2
Deletion Chr3 25104298 25104298 1
Deletion Chr7 26426971 26426971 1
Deletion Chr5 28612692 28612692 1
Deletion Chr3 31247117 31247117 1
Deletion Chr4 35697985 35697985 1
Deletion Chr1 38368385 38368387 3
Deletion Chr1 41481817 41481818 2 2

Insertions: 2

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 28179870 28179872 1
Insertion Chr2 16507317 16507319 1

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr8 18048987 18318903
Inversion Chr8 18058755 18318907
Inversion Chr3 21712560 21759718
Inversion Chr6 24490368 24490488
Inversion Chr3 25315708 25315913

Translocations: 14

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 3255616 Chr3 24510307
Translocation Chr11 3442081 Chr3 24510311
Translocation Chr11 3442643 Chr5 3255016
Translocation Chr8 16295221 Chr3 32727599
Translocation Chr8 16295227 Chr3 32754233 OsKitaake03g347700
Translocation Chr9 16590947 Chr3 1720911 OsKitaake03g024600
Translocation Chr9 16590950 Chr3 1720908 OsKitaake03g024600
Translocation Chr8 18048997 Chr2 15332521
Translocation Chr8 18058715 Chr3 21712551
Translocation Chr3 21759706 Chr2 15334260
Translocation Chr6 24164685 Chr2 10478611
Translocation Chr6 24164688 Chr2 10479021
Translocation Chr7 25143536 Chr6 1994267
Translocation Chr7 25143559 Chr6 1994718

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3139414	T-A	HET
SBS	Chr1	11686946	C-A	HET
SBS	Chr1	22283184	T-C	HET
SBS	Chr1	38546811	T-C	HET
SBS	Chr2	15200408	A-T	HET
SBS	Chr2	19129495	A-T	HET
SBS	Chr3	7604099	A-G	HET
SBS	Chr4	24561	G-A	HET
SBS	Chr4	14867627	G-C	HET		OsKitaake04g070700
SBS	Chr4	31275897	C-A	HET
SBS	Chr4	35825417	C-G	HOMO
SBS	Chr5	3348204	A-T	HET
SBS	Chr5	11833005	G-A	HET
SBS	Chr5	29283536	G-A	HET
SBS	Chr5	29283548	T-A	HET
SBS	Chr6	8747368	G-A	HET
SBS	Chr6	9235778	G-T	HET
SBS	Chr6	14112545	A-G	HET
SBS	Chr6	22245889	T-C	HET
SBS	Chr7	3613900	T-C	HET
SBS	Chr7	4731699	G-A	HET
SBS	Chr7	16679710	G-A	HET
SBS	Chr8	1951506	G-A	HET
SBS	Chr8	14206732	G-T	HET
SBS	Chr8	17785771	G-A	HET
SBS	Chr8	26785694	C-A	HET
SBS	Chr8	27973790	G-C	HET
SBS	Chr9	3380160	T-C	HET
SBS	Chr9	4322340	A-G	HET
SBS	Chr9	6240828	C-T	HET
SBS	Chr9	13196152	C-T	HOMO
SBS	Chr10	3217348	C-T	HET
SBS	Chr10	21720632	T-A	HET
SBS	Chr11	4832172	G-T	HET
SBS	Chr11	13477909	C-T	HOMO
SBS	Chr11	16719138	T-C	HET
SBS	Chr11	17584148	A-G	HET
SBS	Chr11	23427825	T-A	HET
SBS	Chr11	28144796	G-A	HOMO
SBS	Chr12	4191728	T-C	HET
SBS	Chr12	4720521	G-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	3415001	3442000	27000
Deletion	Chr4	3876265	3876269	5
Deletion	Chr12	6383943	6383945	3	OsKitaake12g073700
Deletion	Chr7	6757076	6757076	1
Deletion	Chr1	7064082	7064084	3
Deletion	Chr8	7981188	7981191	4
Deletion	Chr10	8217519	8217519	1
Deletion	Chr7	9481624	9481635	12
Deletion	Chr3	10183074	10183074	1
Deletion	Chr2	16323640	16323643	4
Deletion	Chr8	17000286	17000290	5
Deletion	Chr8	17642274	17642274	1
Deletion	Chr9	19076307	19076307	1
Deletion	Chr7	21976534	21976535	2
Deletion	Chr3	25104298	25104298	1
Deletion	Chr7	26426971	26426971	1
Deletion	Chr5	28612692	28612692	1
Deletion	Chr3	31247117	31247117	1
Deletion	Chr4	35697985	35697985	1
Deletion	Chr1	38368385	38368387	3
Deletion	Chr1	41481817	41481818	2	2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr8	18048987	18318903
Inversion	Chr8	18058755	18318907
Inversion	Chr3	21712560	21759718
Inversion	Chr6	24490368	24490488
Inversion	Chr3	25315708	25315913

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes