Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4571-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4571-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 51

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 13723496 T-C HET
SBS Chr1 18198338 G-T HOMO
SBS Chr1 23365004 C-T HOMO
SBS Chr1 43115644 C-T HET
SBS Chr3 11079058 T-A HET OsKitaake03g152000
SBS Chr3 11978086 A-T HET
SBS Chr3 18455572 T-G HOMO
SBS Chr3 33353924 C-A HET
SBS Chr3 33723712 T-A HET OsKitaake03g363300
SBS Chr3 35942116 C-A HET
SBS Chr3 36587517 C-T HET
SBS Chr4 1738898 G-A HET
SBS Chr4 9629304 C-T HET
SBS Chr4 11925925 G-T HET
SBS Chr4 15985627 T-C HET
SBS Chr4 16095986 G-A HET
SBS Chr4 16865515 G-A HET
SBS Chr4 29853243 A-G HET
SBS Chr4 30088480 C-T HET
SBS Chr4 34703602 A-T HET OsKitaake04g289700
SBS Chr4 34950499 T-C HET
SBS Chr5 8935426 T-A HET
SBS Chr5 10745569 C-T HET
SBS Chr5 21407147 G-A HET
SBS Chr6 10100375 C-T HET
SBS Chr6 19050898 A-C HET
SBS Chr6 19050899 T-C HET
SBS Chr7 13085123 T-C HET
SBS Chr7 23620344 A-C HET
SBS Chr8 7182682 C-T HOMO
SBS Chr8 7252415 G-A HET
SBS Chr8 20720710 C-T HOMO
SBS Chr8 21202087 G-T HOMO
SBS Chr9 5399641 G-T HOMO
SBS Chr9 11323267 G-T HET
SBS Chr9 14459657 G-A HOMO
SBS Chr9 20491011 A-G HET
SBS Chr9 20781309 T-C HOMO OsKitaake09g176900
SBS Chr10 34537 C-T HET
SBS Chr10 2763220 A-T HET
SBS Chr10 7876274 A-T HET
SBS Chr10 8331195 T-C HET
SBS Chr10 20169394 T-A HOMO
SBS Chr11 11796137 G-A HET
SBS Chr11 12447820 G-A HET
SBS Chr11 15896269 T-G HET
SBS Chr11 24337151 C-A HET
SBS Chr11 25969009 C-T HET
SBS Chr12 9860332 G-T HOMO
SBS Chr12 17759265 C-T HET
SBS Chr12 24240228 A-G HET

Deletions: 27

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr8 2607297 2607298 2
Deletion Chr12 3557021 3557021 1 2
Deletion Chr10 4594146 4594146 1
Deletion Chr5 9212001 9376000 164000 11
Deletion Chr1 9864936 9864954 19
Deletion Chr8 10889198 10889205 8
Deletion Chr10 13007001 13160000 153000 8
Deletion Chr3 13048480 13048480 1
Deletion Chr10 13162001 13217000 55000
Deletion Chr7 13615550 13615550 1
Deletion Chr10 14325035 14325077 43
Deletion Chr3 15085865 15085866 2
Deletion Chr7 15622769 15622770 2
Deletion Chr11 16212447 16212455 9
Deletion Chr11 16212631 16212635 5
Deletion Chr4 16885853 16885853 1
Deletion Chr11 18350522 18350522 1
Deletion Chr11 18576873 18576874 2
Deletion Chr6 19748611 19748612 2
Deletion Chr2 23777472 23777662 191
Deletion Chr6 24368589 24368604 16
Deletion Chr8 25697963 25697963 1
Deletion Chr5 29661581 29661589 9
Deletion Chr5 29864340 29864355 16
Deletion Chr4 34011130 34011146 17
Deletion Chr4 36463062 36463064 3
Deletion Chr1 38284652 38284652 1

Insertions: 9

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr7 3480267 3480269 1
Insertion Chr2 3599702 3599704 1
Insertion Chr3 35038710 35038712 1
Insertion Chr6 1839286 1839288 1
Insertion Chr6 2350906 2350908 1
Insertion Chr6 2632290 2632292 1
Insertion Chr9 16162061 16162063 1
Insertion Chr10 23130140 23130142 1
Insertion Chr11 5037754 5037756 1

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr4 30500311 30656113
Inversion Chr4 30656110 30723758

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	13723496	T-C	HET
SBS	Chr1	18198338	G-T	HOMO
SBS	Chr1	23365004	C-T	HOMO
SBS	Chr1	43115644	C-T	HET
SBS	Chr3	11079058	T-A	HET		OsKitaake03g152000
SBS	Chr3	11978086	A-T	HET
SBS	Chr3	18455572	T-G	HOMO
SBS	Chr3	33353924	C-A	HET
SBS	Chr3	33723712	T-A	HET		OsKitaake03g363300
SBS	Chr3	35942116	C-A	HET
SBS	Chr3	36587517	C-T	HET
SBS	Chr4	1738898	G-A	HET
SBS	Chr4	9629304	C-T	HET
SBS	Chr4	11925925	G-T	HET
SBS	Chr4	15985627	T-C	HET
SBS	Chr4	16095986	G-A	HET
SBS	Chr4	16865515	G-A	HET
SBS	Chr4	29853243	A-G	HET
SBS	Chr4	30088480	C-T	HET
SBS	Chr4	34703602	A-T	HET		OsKitaake04g289700
SBS	Chr4	34950499	T-C	HET
SBS	Chr5	8935426	T-A	HET
SBS	Chr5	10745569	C-T	HET
SBS	Chr5	21407147	G-A	HET
SBS	Chr6	10100375	C-T	HET
SBS	Chr6	19050898	A-C	HET
SBS	Chr6	19050899	T-C	HET
SBS	Chr7	13085123	T-C	HET
SBS	Chr7	23620344	A-C	HET
SBS	Chr8	7182682	C-T	HOMO
SBS	Chr8	7252415	G-A	HET
SBS	Chr8	20720710	C-T	HOMO
SBS	Chr8	21202087	G-T	HOMO
SBS	Chr9	5399641	G-T	HOMO
SBS	Chr9	11323267	G-T	HET
SBS	Chr9	14459657	G-A	HOMO
SBS	Chr9	20491011	A-G	HET
SBS	Chr9	20781309	T-C	HOMO		OsKitaake09g176900
SBS	Chr10	34537	C-T	HET
SBS	Chr10	2763220	A-T	HET
SBS	Chr10	7876274	A-T	HET
SBS	Chr10	8331195	T-C	HET
SBS	Chr10	20169394	T-A	HOMO
SBS	Chr11	11796137	G-A	HET
SBS	Chr11	12447820	G-A	HET
SBS	Chr11	15896269	T-G	HET
SBS	Chr11	24337151	C-A	HET
SBS	Chr11	25969009	C-T	HET
SBS	Chr12	9860332	G-T	HOMO
SBS	Chr12	17759265	C-T	HET
SBS	Chr12	24240228	A-G	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr8	2607297	2607298	2
Deletion	Chr12	3557021	3557021	1	2
Deletion	Chr10	4594146	4594146	1
Deletion	Chr5	9212001	9376000	164000	11
Deletion	Chr1	9864936	9864954	19
Deletion	Chr8	10889198	10889205	8
Deletion	Chr10	13007001	13160000	153000	8
Deletion	Chr3	13048480	13048480	1
Deletion	Chr10	13162001	13217000	55000
Deletion	Chr7	13615550	13615550	1
Deletion	Chr10	14325035	14325077	43
Deletion	Chr3	15085865	15085866	2
Deletion	Chr7	15622769	15622770	2
Deletion	Chr11	16212447	16212455	9
Deletion	Chr11	16212631	16212635	5
Deletion	Chr4	16885853	16885853	1
Deletion	Chr11	18350522	18350522	1
Deletion	Chr11	18576873	18576874	2
Deletion	Chr6	19748611	19748612	2
Deletion	Chr2	23777472	23777662	191
Deletion	Chr6	24368589	24368604	16
Deletion	Chr8	25697963	25697963	1
Deletion	Chr5	29661581	29661589	9
Deletion	Chr5	29864340	29864355	16
Deletion	Chr4	34011130	34011146	17
Deletion	Chr4	36463062	36463064	3
Deletion	Chr1	38284652	38284652	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	30500311	30656113
Inversion	Chr4	30656110	30723758

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes