Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4580-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4580-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 50

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 11623577 G-C HET
SBS Chr1 18055448 A-T HET
SBS Chr1 20773884 A-G HET
SBS Chr1 25295145 A-T HOMO
SBS Chr1 25295146 C-G HOMO
SBS Chr1 25295147 C-T HOMO
SBS Chr1 27697074 C-A HET
SBS Chr1 44052541 T-A HET
SBS Chr2 11785637 T-C HOMO
SBS Chr3 8163127 C-T HOMO
SBS Chr3 9028754 C-T HET
SBS Chr3 16752567 C-T HOMO
SBS Chr3 26014293 G-A HOMO
SBS Chr3 31214450 A-T HET
SBS Chr4 9757482 G-A HET
SBS Chr4 14703700 G-A HET
SBS Chr4 16458969 C-T HET
SBS Chr4 29970959 C-T HET
SBS Chr4 29970961 A-T HET
SBS Chr4 33096056 G-A HET
SBS Chr4 33621635 G-T HET
SBS Chr4 33621636 A-T HET
SBS Chr5 5620641 A-G HET
SBS Chr5 6268975 T-C HET
SBS Chr5 8258634 G-C HET
SBS Chr5 9268751 C-T HET
SBS Chr5 18598077 C-T HET
SBS Chr5 20237204 T-C HET
SBS Chr5 25664339 G-T HET
SBS Chr6 6497084 A-T HET
SBS Chr6 13721953 G-A HET
SBS Chr7 2193884 C-T HET
SBS Chr7 5444687 T-A HET
SBS Chr7 6941242 G-A HOMO
SBS Chr7 8819478 A-T HET
SBS Chr7 21087180 G-A HET
SBS Chr7 25155101 A-T HOMO
SBS Chr8 11280805 G-A HET
SBS Chr9 4143594 C-T HET
SBS Chr9 11350909 G-C HET
SBS Chr9 18602078 G-A HET
SBS Chr9 21041076 C-A HET
SBS Chr10 5603851 G-C HET
SBS Chr10 19341829 T-A HET
SBS Chr11 13221671 G-C HET
SBS Chr11 18260815 G-A HET
SBS Chr11 19048879 C-T HET
SBS Chr11 21985481 A-G HET
SBS Chr11 29415818 T-C HET
SBS Chr12 3796078 G-A HET

Deletions: 22

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr3 447967 447970 4
Deletion Chr11 2593134 2593136 3 OsKitaake11g037300
Deletion Chr8 3305296 3305345 50
Deletion Chr12 4455196 4455197 2
Deletion Chr4 10473598 10473599 2
Deletion Chr10 11537630 11537630 1
Deletion Chr11 13736513 13736513 1
Deletion Chr7 14574783 14574789 7
Deletion Chr9 15414108 15414111 4
Deletion Chr4 19432829 19432829 1
Deletion Chr2 19636001 19706000 70000 6
Deletion Chr11 20034084 20034085 2
Deletion Chr12 20545190 20545191 2
Deletion Chr4 20930055 20930055 1
Deletion Chr4 21125001 21312000 187000 20
Deletion Chr12 21213242 21213245 4
Deletion Chr12 21218563 21218565 3
Deletion Chr6 25265485 25265485 1
Deletion Chr1 26724844 26724846 3
Deletion Chr2 28470892 28470892 1
Deletion Chr4 35334001 35645000 311000 59
Deletion Chr4 35654001 35799000 145000 20

Insertions: 9

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 16811928 16811930 1
Insertion Chr4 17974939 17974941 1
Insertion Chr5 12594783 12594785 1
Insertion Chr6 14291 14350 58
Insertion Chr12 960040 960042 1
Insertion Chr12 6504238 6504240 1
Insertion Chr12 20433584 20433586 1
Insertion Chr4 25490521 25490526 4
Insertion Chr10 4143394 4143396 1

Inversions: 1

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr5 19297160 19496208

Translocations: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr5 17412664 Chr2 27569772 OsKitaake05g133601
Translocation Chr4 33509072 Chr3 30056332
Translocation Chr4 33509087 Chr3 30059114 OsKitaake03g314800

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	11623577	G-C	HET
SBS	Chr1	18055448	A-T	HET
SBS	Chr1	20773884	A-G	HET
SBS	Chr1	25295145	A-T	HOMO
SBS	Chr1	25295146	C-G	HOMO
SBS	Chr1	25295147	C-T	HOMO
SBS	Chr1	27697074	C-A	HET
SBS	Chr1	44052541	T-A	HET
SBS	Chr2	11785637	T-C	HOMO
SBS	Chr3	8163127	C-T	HOMO
SBS	Chr3	9028754	C-T	HET
SBS	Chr3	16752567	C-T	HOMO
SBS	Chr3	26014293	G-A	HOMO
SBS	Chr3	31214450	A-T	HET
SBS	Chr4	9757482	G-A	HET
SBS	Chr4	14703700	G-A	HET
SBS	Chr4	16458969	C-T	HET
SBS	Chr4	29970959	C-T	HET
SBS	Chr4	29970961	A-T	HET
SBS	Chr4	33096056	G-A	HET
SBS	Chr4	33621635	G-T	HET
SBS	Chr4	33621636	A-T	HET
SBS	Chr5	5620641	A-G	HET
SBS	Chr5	6268975	T-C	HET
SBS	Chr5	8258634	G-C	HET
SBS	Chr5	9268751	C-T	HET
SBS	Chr5	18598077	C-T	HET
SBS	Chr5	20237204	T-C	HET
SBS	Chr5	25664339	G-T	HET
SBS	Chr6	6497084	A-T	HET
SBS	Chr6	13721953	G-A	HET
SBS	Chr7	2193884	C-T	HET
SBS	Chr7	5444687	T-A	HET
SBS	Chr7	6941242	G-A	HOMO
SBS	Chr7	8819478	A-T	HET
SBS	Chr7	21087180	G-A	HET
SBS	Chr7	25155101	A-T	HOMO
SBS	Chr8	11280805	G-A	HET
SBS	Chr9	4143594	C-T	HET
SBS	Chr9	11350909	G-C	HET
SBS	Chr9	18602078	G-A	HET
SBS	Chr9	21041076	C-A	HET
SBS	Chr10	5603851	G-C	HET
SBS	Chr10	19341829	T-A	HET
SBS	Chr11	13221671	G-C	HET
SBS	Chr11	18260815	G-A	HET
SBS	Chr11	19048879	C-T	HET
SBS	Chr11	21985481	A-G	HET
SBS	Chr11	29415818	T-C	HET
SBS	Chr12	3796078	G-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	447967	447970	4
Deletion	Chr11	2593134	2593136	3	OsKitaake11g037300
Deletion	Chr8	3305296	3305345	50
Deletion	Chr12	4455196	4455197	2
Deletion	Chr4	10473598	10473599	2
Deletion	Chr10	11537630	11537630	1
Deletion	Chr11	13736513	13736513	1
Deletion	Chr7	14574783	14574789	7
Deletion	Chr9	15414108	15414111	4
Deletion	Chr4	19432829	19432829	1
Deletion	Chr2	19636001	19706000	70000	6
Deletion	Chr11	20034084	20034085	2
Deletion	Chr12	20545190	20545191	2
Deletion	Chr4	20930055	20930055	1
Deletion	Chr4	21125001	21312000	187000	20
Deletion	Chr12	21213242	21213245	4
Deletion	Chr12	21218563	21218565	3
Deletion	Chr6	25265485	25265485	1
Deletion	Chr1	26724844	26724846	3
Deletion	Chr2	28470892	28470892	1
Deletion	Chr4	35334001	35645000	311000	59
Deletion	Chr4	35654001	35799000	145000	20

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	19297160	19496208

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes