Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4582-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4582-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 56

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 1689261 C-T HET
SBS Chr1 10530380 C-T HET OsKitaake01g131600
SBS Chr1 19649948 C-A HOMO
SBS Chr1 27069867 A-G HET
SBS Chr1 44160963 G-A HET
SBS Chr2 17336232 G-C HOMO
SBS Chr2 26690070 C-T HET
SBS Chr2 32547016 G-A HOMO
SBS Chr3 9516494 T-A HET
SBS Chr3 19255399 G-A HOMO
SBS Chr4 1445958 G-A HET
SBS Chr4 2741062 G-A HET
SBS Chr4 6525642 G-T HET
SBS Chr4 14455305 T-C HOMO
SBS Chr5 9985924 C-T HET
SBS Chr5 10150301 C-A HET
SBS Chr5 10553363 T-C HET
SBS Chr5 11528867 T-A HOMO
SBS Chr5 15557935 T-C HET
SBS Chr5 17479170 A-G HET
SBS Chr5 28274744 C-T HET
SBS Chr6 10843629 C-G HOMO
SBS Chr6 17517682 G-T HET
SBS Chr6 29792457 G-A HET
SBS Chr7 14890266 G-A HET
SBS Chr7 18335704 A-G HET
SBS Chr7 21449747 C-T HET
SBS Chr8 10917092 C-T HET
SBS Chr8 11516238 T-C HET
SBS Chr8 14195192 G-T HET
SBS Chr8 14195193 C-T HET
SBS Chr8 16518279 C-G HET
SBS Chr8 24154306 C-T HET
SBS Chr8 24351300 T-C HET
SBS Chr8 25905496 G-A HET
SBS Chr8 28431568 T-C HET
SBS Chr8 28939290 T-A HET
SBS Chr9 11618429 A-G HET
SBS Chr9 13328966 C-A HET
SBS Chr9 21105432 A-G HOMO
SBS Chr10 4715929 T-A HET
SBS Chr10 9257850 T-G HET
SBS Chr10 16744507 C-T HET
SBS Chr11 2520755 C-A HET
SBS Chr11 5601996 C-T HET
SBS Chr11 6230630 A-G HET
SBS Chr11 8322302 C-T HET
SBS Chr11 9654389 G-T HET
SBS Chr11 16254808 C-A HET
SBS Chr11 19841567 T-A HET
SBS Chr11 22714558 C-A HET OsKitaake11g180200
SBS Chr12 6003588 T-A HET
SBS Chr12 12179594 A-G HET
SBS Chr12 13738279 C-A HET
SBS Chr12 15222126 C-T HET
SBS Chr12 20565675 A-G HET

Deletions: 24

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr10 553525 553529 5
Deletion Chr10 1321590 1321592 3
Deletion Chr7 2124204 2124225 22
Deletion Chr8 3020001 3032000 12000 3
Deletion Chr6 3588483 3588484 2
Deletion Chr1 3616427 3616428 2 2
Deletion Chr1 9584772 9584776 5
Deletion Chr10 9800757 9800766 10
Deletion Chr10 12710845 12710846 2
Deletion Chr8 15234114 15234119 6
Deletion Chr11 16355654 16355655 2
Deletion Chr1 18219075 18219080 6
Deletion Chr6 18361079 18361087 9
Deletion Chr9 21588371 21588371 1
Deletion Chr1 22555001 22571000 16000 OsKitaake01g215800
Deletion Chr10 23096743 23096745 3
Deletion Chr1 23410289 23410296 8
Deletion Chr1 23453863 23453867 5
Deletion Chr11 26607856 26607856 1
Deletion Chr11 26763996 26763999 4
Deletion Chr4 27567136 27567136 1
Deletion Chr1 29557001 29755000 198000 25
Deletion Chr2 30526229 30526244 16
Deletion Chr2 33543432 33543432 1 OsKitaake02g346550

Insertions: 6

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 39162377 39162379 1
Insertion Chr1 40458622 40458644 21
Insertion Chr10 8305244 8305246 1
Insertion Chr1 11893069 11893071 1
Insertion Chr2 29830062 29830065 2
Insertion Chr5 20613865 20613867 1

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr1 16528895 16529035 OsKitaake01g176900
Inversion Chr11 28503243 28503395

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr3 9729004 Chr1 6826811
Translocation Chr3 9729034 Chr1 6827447

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1689261	C-T	HET
SBS	Chr1	10530380	C-T	HET		OsKitaake01g131600
SBS	Chr1	19649948	C-A	HOMO
SBS	Chr1	27069867	A-G	HET
SBS	Chr1	44160963	G-A	HET
SBS	Chr2	17336232	G-C	HOMO
SBS	Chr2	26690070	C-T	HET
SBS	Chr2	32547016	G-A	HOMO
SBS	Chr3	9516494	T-A	HET
SBS	Chr3	19255399	G-A	HOMO
SBS	Chr4	1445958	G-A	HET
SBS	Chr4	2741062	G-A	HET
SBS	Chr4	6525642	G-T	HET
SBS	Chr4	14455305	T-C	HOMO
SBS	Chr5	9985924	C-T	HET
SBS	Chr5	10150301	C-A	HET
SBS	Chr5	10553363	T-C	HET
SBS	Chr5	11528867	T-A	HOMO
SBS	Chr5	15557935	T-C	HET
SBS	Chr5	17479170	A-G	HET
SBS	Chr5	28274744	C-T	HET
SBS	Chr6	10843629	C-G	HOMO
SBS	Chr6	17517682	G-T	HET
SBS	Chr6	29792457	G-A	HET
SBS	Chr7	14890266	G-A	HET
SBS	Chr7	18335704	A-G	HET
SBS	Chr7	21449747	C-T	HET
SBS	Chr8	10917092	C-T	HET
SBS	Chr8	11516238	T-C	HET
SBS	Chr8	14195192	G-T	HET
SBS	Chr8	14195193	C-T	HET
SBS	Chr8	16518279	C-G	HET
SBS	Chr8	24154306	C-T	HET
SBS	Chr8	24351300	T-C	HET
SBS	Chr8	25905496	G-A	HET
SBS	Chr8	28431568	T-C	HET
SBS	Chr8	28939290	T-A	HET
SBS	Chr9	11618429	A-G	HET
SBS	Chr9	13328966	C-A	HET
SBS	Chr9	21105432	A-G	HOMO
SBS	Chr10	4715929	T-A	HET
SBS	Chr10	9257850	T-G	HET
SBS	Chr10	16744507	C-T	HET
SBS	Chr11	2520755	C-A	HET
SBS	Chr11	5601996	C-T	HET
SBS	Chr11	6230630	A-G	HET
SBS	Chr11	8322302	C-T	HET
SBS	Chr11	9654389	G-T	HET
SBS	Chr11	16254808	C-A	HET
SBS	Chr11	19841567	T-A	HET
SBS	Chr11	22714558	C-A	HET		OsKitaake11g180200
SBS	Chr12	6003588	T-A	HET
SBS	Chr12	12179594	A-G	HET
SBS	Chr12	13738279	C-A	HET
SBS	Chr12	15222126	C-T	HET
SBS	Chr12	20565675	A-G	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr10	553525	553529	5
Deletion	Chr10	1321590	1321592	3
Deletion	Chr7	2124204	2124225	22
Deletion	Chr8	3020001	3032000	12000	3
Deletion	Chr6	3588483	3588484	2
Deletion	Chr1	3616427	3616428	2	2
Deletion	Chr1	9584772	9584776	5
Deletion	Chr10	9800757	9800766	10
Deletion	Chr10	12710845	12710846	2
Deletion	Chr8	15234114	15234119	6
Deletion	Chr11	16355654	16355655	2
Deletion	Chr1	18219075	18219080	6
Deletion	Chr6	18361079	18361087	9
Deletion	Chr9	21588371	21588371	1
Deletion	Chr1	22555001	22571000	16000	OsKitaake01g215800
Deletion	Chr10	23096743	23096745	3
Deletion	Chr1	23410289	23410296	8
Deletion	Chr1	23453863	23453867	5
Deletion	Chr11	26607856	26607856	1
Deletion	Chr11	26763996	26763999	4
Deletion	Chr4	27567136	27567136	1
Deletion	Chr1	29557001	29755000	198000	25
Deletion	Chr2	30526229	30526244	16
Deletion	Chr2	33543432	33543432	1	OsKitaake02g346550

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	16528895	16529035	OsKitaake01g176900
Inversion	Chr11	28503243	28503395

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes