Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4585-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4585-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 52

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3195270 C-T HET
SBS Chr1 13161039 G-A HET
SBS Chr1 29809315 G-A HET
SBS Chr1 40187623 A-G HET
SBS Chr2 4139737 G-A HET
SBS Chr2 18774628 G-A HET
SBS Chr2 18949652 T-A HET
SBS Chr2 20244024 C-T HOMO
SBS Chr2 20437975 C-A HET
SBS Chr2 28553631 C-T HET
SBS Chr3 7398474 T-C HET
SBS Chr3 8823494 T-C HOMO
SBS Chr3 11379988 T-C HET OsKitaake03g155800
SBS Chr3 16685798 G-A HET
SBS Chr3 18137623 G-T HET
SBS Chr3 26677180 G-A HET
SBS Chr3 35229128 C-T HET
SBS Chr3 35229129 C-T HET OsKitaake03g385600
SBS Chr4 11238193 G-A HET
SBS Chr4 13787579 C-T HET
SBS Chr4 15793143 C-A HET
SBS Chr4 16641291 G-T HET
SBS Chr4 22659886 C-T HET
SBS Chr4 25067929 G-A HET OsKitaake04g168200
SBS Chr4 28562934 C-T HET
SBS Chr5 4992206 C-A HET
SBS Chr5 6461976 G-T HET
SBS Chr5 7327120 C-A HET
SBS Chr5 9178358 G-A HET
SBS Chr5 21100671 G-T HET
SBS Chr5 28620476 C-T HET
SBS Chr6 2862843 C-A HET
SBS Chr6 6617279 G-A HET
SBS Chr6 13487250 C-G HOMO
SBS Chr6 28518158 A-G HET
SBS Chr7 738749 A-G HET
SBS Chr7 13661430 C-T HET
SBS Chr8 4936282 A-G HET
SBS Chr8 21689876 C-A HET
SBS Chr9 6940205 G-A HET
SBS Chr9 11752818 C-A HET
SBS Chr9 16296053 A-T HET
SBS Chr10 2711563 C-A HET
SBS Chr10 2741693 C-A HET
SBS Chr10 9315582 A-C HET
SBS Chr11 1866931 G-A HET
SBS Chr11 23906840 C-T HET
SBS Chr11 26448637 G-A HET
SBS Chr12 4339102 A-C HET
SBS Chr12 13998516 C-G HET
SBS Chr12 15221834 C-T HET
SBS Chr12 15238112 T-C HOMO

Deletions: 26

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr6 1801247 1801248 2
Deletion Chr1 5483822 5483832 11
Deletion Chr7 6474837 6474837 1
Deletion Chr9 8985899 8985899 1
Deletion Chr3 9268525 9268527 3
Deletion Chr10 9315450 9315459 10
Deletion Chr3 9576253 9576267 15
Deletion Chr10 14996419 14996419 1
Deletion Chr2 15450234 15450234 1
Deletion Chr11 17356631 17356631 1 2
Deletion Chr8 17955954 17955963 10
Deletion Chr3 18291357 18291358 2
Deletion Chr10 19120156 19120157 2
Deletion Chr1 19713688 19713691 4
Deletion Chr9 19840663 19840663 1
Deletion Chr2 20243522 20243535 14
Deletion Chr12 20247290 20247291 2
Deletion Chr2 22239429 22239432 4
Deletion Chr7 22649096 22649096 1
Deletion Chr1 26184973 26184973 1
Deletion Chr5 27905359 27905359 1
Deletion Chr2 27979310 27979311 2
Deletion Chr8 28423828 28423828 1
Deletion Chr3 29498104 29498104 1
Deletion Chr1 30956805 30956816 12
Deletion Chr4 33374613 33374616 4

Insertions: 5

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr11 13697707 13697709 1
Insertion Chr3 23606143 23606146 2
Insertion Chr4 7318419 7318423 3
Insertion Chr9 12006838 12006843 4
Insertion Chr12 8398208 8398210 1

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr9 5813480 5814795
Inversion Chr9 5813488 5813761
Inversion Chr6 6101430 6868484
Inversion Chr6 6101728 6868494
Inversion Chr2 33812328 33812482

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr7 5342527 Chr5 24257516 OsKitaake05g216500
Translocation Chr7 5342528 Chr5 24258512
Translocation Chr11 8607441 Chr6 25026419
Translocation Chr11 8607471 Chr6 25032446

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3195270	C-T	HET
SBS	Chr1	13161039	G-A	HET
SBS	Chr1	29809315	G-A	HET
SBS	Chr1	40187623	A-G	HET
SBS	Chr2	4139737	G-A	HET
SBS	Chr2	18774628	G-A	HET
SBS	Chr2	18949652	T-A	HET
SBS	Chr2	20244024	C-T	HOMO
SBS	Chr2	20437975	C-A	HET
SBS	Chr2	28553631	C-T	HET
SBS	Chr3	7398474	T-C	HET
SBS	Chr3	8823494	T-C	HOMO
SBS	Chr3	11379988	T-C	HET		OsKitaake03g155800
SBS	Chr3	16685798	G-A	HET
SBS	Chr3	18137623	G-T	HET
SBS	Chr3	26677180	G-A	HET
SBS	Chr3	35229128	C-T	HET
SBS	Chr3	35229129	C-T	HET		OsKitaake03g385600
SBS	Chr4	11238193	G-A	HET
SBS	Chr4	13787579	C-T	HET
SBS	Chr4	15793143	C-A	HET
SBS	Chr4	16641291	G-T	HET
SBS	Chr4	22659886	C-T	HET
SBS	Chr4	25067929	G-A	HET		OsKitaake04g168200
SBS	Chr4	28562934	C-T	HET
SBS	Chr5	4992206	C-A	HET
SBS	Chr5	6461976	G-T	HET
SBS	Chr5	7327120	C-A	HET
SBS	Chr5	9178358	G-A	HET
SBS	Chr5	21100671	G-T	HET
SBS	Chr5	28620476	C-T	HET
SBS	Chr6	2862843	C-A	HET
SBS	Chr6	6617279	G-A	HET
SBS	Chr6	13487250	C-G	HOMO
SBS	Chr6	28518158	A-G	HET
SBS	Chr7	738749	A-G	HET
SBS	Chr7	13661430	C-T	HET
SBS	Chr8	4936282	A-G	HET
SBS	Chr8	21689876	C-A	HET
SBS	Chr9	6940205	G-A	HET
SBS	Chr9	11752818	C-A	HET
SBS	Chr9	16296053	A-T	HET
SBS	Chr10	2711563	C-A	HET
SBS	Chr10	2741693	C-A	HET
SBS	Chr10	9315582	A-C	HET
SBS	Chr11	1866931	G-A	HET
SBS	Chr11	23906840	C-T	HET
SBS	Chr11	26448637	G-A	HET
SBS	Chr12	4339102	A-C	HET
SBS	Chr12	13998516	C-G	HET
SBS	Chr12	15221834	C-T	HET
SBS	Chr12	15238112	T-C	HOMO

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	1801247	1801248	2
Deletion	Chr1	5483822	5483832	11
Deletion	Chr7	6474837	6474837	1
Deletion	Chr9	8985899	8985899	1
Deletion	Chr3	9268525	9268527	3
Deletion	Chr10	9315450	9315459	10
Deletion	Chr3	9576253	9576267	15
Deletion	Chr10	14996419	14996419	1
Deletion	Chr2	15450234	15450234	1
Deletion	Chr11	17356631	17356631	1	2
Deletion	Chr8	17955954	17955963	10
Deletion	Chr3	18291357	18291358	2
Deletion	Chr10	19120156	19120157	2
Deletion	Chr1	19713688	19713691	4
Deletion	Chr9	19840663	19840663	1
Deletion	Chr2	20243522	20243535	14
Deletion	Chr12	20247290	20247291	2
Deletion	Chr2	22239429	22239432	4
Deletion	Chr7	22649096	22649096	1
Deletion	Chr1	26184973	26184973	1
Deletion	Chr5	27905359	27905359	1
Deletion	Chr2	27979310	27979311	2
Deletion	Chr8	28423828	28423828	1
Deletion	Chr3	29498104	29498104	1
Deletion	Chr1	30956805	30956816	12
Deletion	Chr4	33374613	33374616	4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	5813480	5814795
Inversion	Chr9	5813488	5813761
Inversion	Chr6	6101430	6868484
Inversion	Chr6	6101728	6868494
Inversion	Chr2	33812328	33812482

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes