Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4589-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4589-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 41

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 2165231 G-A HET
SBS Chr1 7628241 T-A HET
SBS Chr1 19494812 C-T HET
SBS Chr1 22516559 G-T HET
SBS Chr1 35169802 T-C HOMO
SBS Chr1 43483163 T-C HET
SBS Chr2 3370337 C-T HET
SBS Chr2 3988947 G-T HOMO
SBS Chr2 13699503 C-T HET
SBS Chr3 3103553 G-C HET
SBS Chr3 6055381 T-C HET
SBS Chr3 7233208 G-T HET
SBS Chr3 10660997 T-C HOMO
SBS Chr3 22365763 C-T HET
SBS Chr4 2737329 C-T HET
SBS Chr4 7158969 A-T HET
SBS Chr4 14991133 A-C HOMO
SBS Chr4 20781089 G-T HET
SBS Chr5 7318457 T-C HET
SBS Chr5 12228824 G-T HET
SBS Chr5 25272108 C-T HET
SBS Chr5 29936001 G-A HET
SBS Chr6 6324837 C-T HET
SBS Chr6 10501474 G-A HET
SBS Chr6 17615062 A-G HOMO
SBS Chr7 4022693 C-G HOMO
SBS Chr7 8898458 G-A HET
SBS Chr7 21324899 G-C HET
SBS Chr8 20584728 C-T HET
SBS Chr9 701158 C-T HET
SBS Chr9 1639832 G-T HET
SBS Chr9 12426022 G-T HET
SBS Chr9 12444637 G-T HET
SBS Chr9 18282579 C-T HET
SBS Chr10 4293807 C-T HET
SBS Chr10 20031169 G-C HET
SBS Chr10 20031171 T-C HET
SBS Chr11 4087448 A-G HOMO OsKitaake11g055700
SBS Chr11 4564224 C-T HOMO
SBS Chr11 27503089 G-T HET
SBS Chr12 5432859 G-A HET

Deletions: 14

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr6 2457726 2457726 1
Deletion Chr2 4482170 4482171 2
Deletion Chr4 5843056 5843056 1
Deletion Chr12 8727080 8727127 48
Deletion Chr4 10281239 10281239 1
Deletion Chr11 10305855 10305855 1
Deletion Chr4 10680558 10680562 5
Deletion Chr8 20306069 20306070 2
Deletion Chr6 22955242 22955249 8
Deletion Chr5 23516684 23516690 7
Deletion Chr1 23845513 23845513 1
Deletion Chr1 25933910 25933911 2
Deletion Chr2 35847947 35847951 5
Deletion Chr1 42128793 42128808 16

Insertions: 5

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr9 2476619 2476621 1
Insertion Chr9 20347324 20347326 1
Insertion Chr10 3734234 3734237 2
Insertion Chr10 19126502 19126504 1
Insertion Chr12 20467910 20467912 1

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr10 12697052 Chr5 362626
Translocation Chr10 12697054 Chr5 362372 OsKitaake05g005300

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2165231	G-A	HET
SBS	Chr1	7628241	T-A	HET
SBS	Chr1	19494812	C-T	HET
SBS	Chr1	22516559	G-T	HET
SBS	Chr1	35169802	T-C	HOMO
SBS	Chr1	43483163	T-C	HET
SBS	Chr2	3370337	C-T	HET
SBS	Chr2	3988947	G-T	HOMO
SBS	Chr2	13699503	C-T	HET
SBS	Chr3	3103553	G-C	HET
SBS	Chr3	6055381	T-C	HET
SBS	Chr3	7233208	G-T	HET
SBS	Chr3	10660997	T-C	HOMO
SBS	Chr3	22365763	C-T	HET
SBS	Chr4	2737329	C-T	HET
SBS	Chr4	7158969	A-T	HET
SBS	Chr4	14991133	A-C	HOMO
SBS	Chr4	20781089	G-T	HET
SBS	Chr5	7318457	T-C	HET
SBS	Chr5	12228824	G-T	HET
SBS	Chr5	25272108	C-T	HET
SBS	Chr5	29936001	G-A	HET
SBS	Chr6	6324837	C-T	HET
SBS	Chr6	10501474	G-A	HET
SBS	Chr6	17615062	A-G	HOMO
SBS	Chr7	4022693	C-G	HOMO
SBS	Chr7	8898458	G-A	HET
SBS	Chr7	21324899	G-C	HET
SBS	Chr8	20584728	C-T	HET
SBS	Chr9	701158	C-T	HET
SBS	Chr9	1639832	G-T	HET
SBS	Chr9	12426022	G-T	HET
SBS	Chr9	12444637	G-T	HET
SBS	Chr9	18282579	C-T	HET
SBS	Chr10	4293807	C-T	HET
SBS	Chr10	20031169	G-C	HET
SBS	Chr10	20031171	T-C	HET
SBS	Chr11	4087448	A-G	HOMO		OsKitaake11g055700
SBS	Chr11	4564224	C-T	HOMO
SBS	Chr11	27503089	G-T	HET
SBS	Chr12	5432859	G-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	2457726	2457726	1
Deletion	Chr2	4482170	4482171	2
Deletion	Chr4	5843056	5843056	1
Deletion	Chr12	8727080	8727127	48
Deletion	Chr4	10281239	10281239	1
Deletion	Chr11	10305855	10305855	1
Deletion	Chr4	10680558	10680562	5
Deletion	Chr8	20306069	20306070	2
Deletion	Chr6	22955242	22955249	8
Deletion	Chr5	23516684	23516690	7
Deletion	Chr1	23845513	23845513	1
Deletion	Chr1	25933910	25933911	2
Deletion	Chr2	35847947	35847951	5
Deletion	Chr1	42128793	42128808	16

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	12697052	Chr5	362626
Translocation	Chr10	12697054	Chr5	362372	OsKitaake05g005300

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes