Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4591-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4591-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 45

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 2143596 C-T HET
SBS Chr1 39075497 A-G HET
SBS Chr1 43176983 C-T HET
SBS Chr2 3776542 T-A HET
SBS Chr2 18474823 G-A HET
SBS Chr2 19918260 A-G HET
SBS Chr3 27737527 G-A HET
SBS Chr3 30268146 C-T HET
SBS Chr3 31460448 G-A HET
SBS Chr4 14051303 C-T HET
SBS Chr4 27366158 G-A HET
SBS Chr4 32893509 G-A HET
SBS Chr4 33216893 C-T HET OsKitaake04g270900
SBS Chr4 33701060 G-T HOMO
SBS Chr4 34711639 T-A HET
SBS Chr4 35612458 T-C HET
SBS Chr5 3391871 G-A HET
SBS Chr5 18318226 G-A HET
SBS Chr5 28797963 G-T HOMO
SBS Chr6 2757069 G-A HET OsKitaake06g037600
SBS Chr6 7223421 T-C HET
SBS Chr6 15377568 A-G HET
SBS Chr6 24661086 C-T HET
SBS Chr7 12603845 A-G HOMO
SBS Chr7 25425915 G-A HET
SBS Chr8 418481 C-G HET
SBS Chr8 3891277 C-T HET
SBS Chr8 5199468 A-G HET
SBS Chr8 17474574 T-C HET
SBS Chr9 901087 C-G HOMO
SBS Chr9 8323735 C-T HOMO
SBS Chr9 8933670 T-C HOMO
SBS Chr9 10778394 G-A HOMO
SBS Chr9 12780099 A-T HOMO
SBS Chr9 15223583 T-C HOMO
SBS Chr9 22070674 C-G HOMO
SBS Chr10 51691 G-T HET
SBS Chr10 3929074 A-G HOMO
SBS Chr10 7849925 C-T HOMO
SBS Chr10 8533617 T-A HET
SBS Chr10 20749197 G-A HET
SBS Chr11 3543262 G-A HET
SBS Chr11 17543263 T-A HET OsKitaake11g137400
SBS Chr11 27951581 G-A HET
SBS Chr12 3195771 G-A HET

Deletions: 16

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr2 2260791 2260801 11
Deletion Chr3 3065250 3065250 1
Deletion Chr1 8442857 8442862 6
Deletion Chr12 9555128 9555274 147
Deletion Chr5 10115523 10115523 1
Deletion Chr9 10448603 10448606 4
Deletion Chr7 11922796 11922806 11
Deletion Chr9 13777457 13777461 5
Deletion Chr6 13898060 13898150 91
Deletion Chr1 16169285 16169285 1
Deletion Chr3 16240084 16240085 2
Deletion Chr6 16356637 16356638 2
Deletion Chr8 22525438 22525438 1
Deletion Chr5 24247411 24247412 2
Deletion Chr5 28510507 28510507 1
Deletion Chr1 43501840 43501840 1

Insertions: 8

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 33846767 33846769 1
Insertion Chr8 1396065 1396067 1
Insertion Chr12 18823179 18823182 2
Insertion Chr1 5454995 5454997 1
Insertion Chr7 26225757 26225759 1
Insertion Chr8 19228278 19228280 1
Insertion Chr11 2925542 2925544 1
Insertion Chr12 18508619 18508621 1

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr2 7424608 7424759
Inversion Chr9 10447444 10829548 OsKitaake09g065200
Inversion Chr9 10447452 10829553 OsKitaake09g065200

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2143596	C-T	HET
SBS	Chr1	39075497	A-G	HET
SBS	Chr1	43176983	C-T	HET
SBS	Chr2	3776542	T-A	HET
SBS	Chr2	18474823	G-A	HET
SBS	Chr2	19918260	A-G	HET
SBS	Chr3	27737527	G-A	HET
SBS	Chr3	30268146	C-T	HET
SBS	Chr3	31460448	G-A	HET
SBS	Chr4	14051303	C-T	HET
SBS	Chr4	27366158	G-A	HET
SBS	Chr4	32893509	G-A	HET
SBS	Chr4	33216893	C-T	HET		OsKitaake04g270900
SBS	Chr4	33701060	G-T	HOMO
SBS	Chr4	34711639	T-A	HET
SBS	Chr4	35612458	T-C	HET
SBS	Chr5	3391871	G-A	HET
SBS	Chr5	18318226	G-A	HET
SBS	Chr5	28797963	G-T	HOMO
SBS	Chr6	2757069	G-A	HET		OsKitaake06g037600
SBS	Chr6	7223421	T-C	HET
SBS	Chr6	15377568	A-G	HET
SBS	Chr6	24661086	C-T	HET
SBS	Chr7	12603845	A-G	HOMO
SBS	Chr7	25425915	G-A	HET
SBS	Chr8	418481	C-G	HET
SBS	Chr8	3891277	C-T	HET
SBS	Chr8	5199468	A-G	HET
SBS	Chr8	17474574	T-C	HET
SBS	Chr9	901087	C-G	HOMO
SBS	Chr9	8323735	C-T	HOMO
SBS	Chr9	8933670	T-C	HOMO
SBS	Chr9	10778394	G-A	HOMO
SBS	Chr9	12780099	A-T	HOMO
SBS	Chr9	15223583	T-C	HOMO
SBS	Chr9	22070674	C-G	HOMO
SBS	Chr10	51691	G-T	HET
SBS	Chr10	3929074	A-G	HOMO
SBS	Chr10	7849925	C-T	HOMO
SBS	Chr10	8533617	T-A	HET
SBS	Chr10	20749197	G-A	HET
SBS	Chr11	3543262	G-A	HET
SBS	Chr11	17543263	T-A	HET		OsKitaake11g137400
SBS	Chr11	27951581	G-A	HET
SBS	Chr12	3195771	G-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	2260791	2260801	11
Deletion	Chr3	3065250	3065250	1
Deletion	Chr1	8442857	8442862	6
Deletion	Chr12	9555128	9555274	147
Deletion	Chr5	10115523	10115523	1
Deletion	Chr9	10448603	10448606	4
Deletion	Chr7	11922796	11922806	11
Deletion	Chr9	13777457	13777461	5
Deletion	Chr6	13898060	13898150	91
Deletion	Chr1	16169285	16169285	1
Deletion	Chr3	16240084	16240085	2
Deletion	Chr6	16356637	16356638	2
Deletion	Chr8	22525438	22525438	1
Deletion	Chr5	24247411	24247412	2
Deletion	Chr5	28510507	28510507	1
Deletion	Chr1	43501840	43501840	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr2	7424608	7424759
Inversion	Chr9	10447444	10829548	OsKitaake09g065200
Inversion	Chr9	10447452	10829553	OsKitaake09g065200

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes