Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4592-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4592-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 52

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 4179816 A-G HOMO
SBS Chr1 24697618 C-T HET
SBS Chr1 35736862 A-G HET
SBS Chr2 4759994 C-G HET
SBS Chr2 4759996 A-G HET
SBS Chr2 8106147 G-A HET
SBS Chr2 18277503 A-G HET
SBS Chr2 18312526 G-T HET
SBS Chr2 19249237 G-C HET
SBS Chr2 25632034 A-C HET
SBS Chr2 26464264 G-A HET
SBS Chr3 5579676 T-C HET
SBS Chr3 6448878 T-C HET
SBS Chr3 6544122 C-T HET
SBS Chr3 10925125 A-T HET
SBS Chr3 13575521 C-T HET
SBS Chr3 19420212 G-A HET
SBS Chr3 23816596 A-G HET
SBS Chr4 3406830 A-G HET
SBS Chr4 8222419 G-A HOMO
SBS Chr4 34429995 G-A HET
SBS Chr5 926903 G-A HOMO
SBS Chr5 3916776 G-A HOMO
SBS Chr5 11049656 T-C HET
SBS Chr5 24522186 G-A HET
SBS Chr5 25316563 C-T HET OsKitaake05g220800
SBS Chr5 27940667 C-T HET
SBS Chr5 29066178 A-C HET
SBS Chr6 4808348 G-C HOMO
SBS Chr6 17917297 C-T HET
SBS Chr6 18214984 T-G HET
SBS Chr6 18504176 A-G HET
SBS Chr6 18514626 G-A HET
SBS Chr6 23597002 T-C HET
SBS Chr6 26015127 G-A HET
SBS Chr7 5819038 G-T HET
SBS Chr7 11669942 G-A HET
SBS Chr7 16253415 G-A HET
SBS Chr7 21732496 G-A HET
SBS Chr7 22099781 G-A HET
SBS Chr8 7623417 A-G HET
SBS Chr8 20017792 A-C HET
SBS Chr8 20391758 A-T HET
SBS Chr9 20677327 C-A HET
SBS Chr11 7829877 T-A HOMO
SBS Chr11 12806485 A-G HOMO
SBS Chr12 4102218 T-A HET
SBS Chr12 10211452 G-A HET
SBS Chr12 12328165 T-C HOMO
SBS Chr12 17813709 C-A HET
SBS Chr12 22905325 T-A HET
SBS Chr12 22905326 C-T HET

Deletions: 19

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr4 1133394 1133395 2
Deletion Chr10 1782882 1782882 1
Deletion Chr11 1788078 1788107 30 OsKitaake11g024800
Deletion Chr3 3158291 3158291 1
Deletion Chr9 4819001 4834000 15000 OsKitaake09g027400
Deletion Chr3 6215586 6215589 4
Deletion Chr2 9247004 9247004 1
Deletion Chr7 9267284 9267285 2
Deletion Chr1 11535122 11535122 1
Deletion Chr12 15895001 16178000 283000 11
Deletion Chr12 16183001 16245000 62000 3
Deletion Chr5 18661615 18661616 2
Deletion Chr7 23151582 23151587 6
Deletion Chr4 24427154 24427156 3
Deletion Chr6 25988675 25988683 9
Deletion Chr12 26769695 26769709 15
Deletion Chr1 37610722 37610722 1
Deletion Chr1 38932863 38932864 2
Deletion Chr1 39478963 39478963 1

Insertions: 5

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 33846767 33846769 1
Insertion Chr4 17407612 17407614 1
Insertion Chr6 16312648 16312651 2
Insertion Chr8 27227841 27227843 1
Insertion Chr9 8065522 8065524 1

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr10 5577540 6314575
Inversion Chr11 10067264 10465239
Inversion Chr11 10067269 10465243

Translocations: 6

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr8 5078555 Chr7 27407419
Translocation Chr8 5078595 Chr7 27407419
Translocation Chr10 6314573 Chr8 20462817
Translocation Chr10 7586276 Chr8 20462814
Translocation Chr12 23437705 Chr2 36149372 OsKitaake02g381800
Translocation Chr12 23437708 Chr2 36148051

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	4179816	A-G	HOMO
SBS	Chr1	24697618	C-T	HET
SBS	Chr1	35736862	A-G	HET
SBS	Chr2	4759994	C-G	HET
SBS	Chr2	4759996	A-G	HET
SBS	Chr2	8106147	G-A	HET
SBS	Chr2	18277503	A-G	HET
SBS	Chr2	18312526	G-T	HET
SBS	Chr2	19249237	G-C	HET
SBS	Chr2	25632034	A-C	HET
SBS	Chr2	26464264	G-A	HET
SBS	Chr3	5579676	T-C	HET
SBS	Chr3	6448878	T-C	HET
SBS	Chr3	6544122	C-T	HET
SBS	Chr3	10925125	A-T	HET
SBS	Chr3	13575521	C-T	HET
SBS	Chr3	19420212	G-A	HET
SBS	Chr3	23816596	A-G	HET
SBS	Chr4	3406830	A-G	HET
SBS	Chr4	8222419	G-A	HOMO
SBS	Chr4	34429995	G-A	HET
SBS	Chr5	926903	G-A	HOMO
SBS	Chr5	3916776	G-A	HOMO
SBS	Chr5	11049656	T-C	HET
SBS	Chr5	24522186	G-A	HET
SBS	Chr5	25316563	C-T	HET		OsKitaake05g220800
SBS	Chr5	27940667	C-T	HET
SBS	Chr5	29066178	A-C	HET
SBS	Chr6	4808348	G-C	HOMO
SBS	Chr6	17917297	C-T	HET
SBS	Chr6	18214984	T-G	HET
SBS	Chr6	18504176	A-G	HET
SBS	Chr6	18514626	G-A	HET
SBS	Chr6	23597002	T-C	HET
SBS	Chr6	26015127	G-A	HET
SBS	Chr7	5819038	G-T	HET
SBS	Chr7	11669942	G-A	HET
SBS	Chr7	16253415	G-A	HET
SBS	Chr7	21732496	G-A	HET
SBS	Chr7	22099781	G-A	HET
SBS	Chr8	7623417	A-G	HET
SBS	Chr8	20017792	A-C	HET
SBS	Chr8	20391758	A-T	HET
SBS	Chr9	20677327	C-A	HET
SBS	Chr11	7829877	T-A	HOMO
SBS	Chr11	12806485	A-G	HOMO
SBS	Chr12	4102218	T-A	HET
SBS	Chr12	10211452	G-A	HET
SBS	Chr12	12328165	T-C	HOMO
SBS	Chr12	17813709	C-A	HET
SBS	Chr12	22905325	T-A	HET
SBS	Chr12	22905326	C-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	1133394	1133395	2
Deletion	Chr10	1782882	1782882	1
Deletion	Chr11	1788078	1788107	30	OsKitaake11g024800
Deletion	Chr3	3158291	3158291	1
Deletion	Chr9	4819001	4834000	15000	OsKitaake09g027400
Deletion	Chr3	6215586	6215589	4
Deletion	Chr2	9247004	9247004	1
Deletion	Chr7	9267284	9267285	2
Deletion	Chr1	11535122	11535122	1
Deletion	Chr12	15895001	16178000	283000	11
Deletion	Chr12	16183001	16245000	62000	3
Deletion	Chr5	18661615	18661616	2
Deletion	Chr7	23151582	23151587	6
Deletion	Chr4	24427154	24427156	3
Deletion	Chr6	25988675	25988683	9
Deletion	Chr12	26769695	26769709	15
Deletion	Chr1	37610722	37610722	1
Deletion	Chr1	38932863	38932864	2
Deletion	Chr1	39478963	39478963	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr10	5577540	6314575
Inversion	Chr11	10067264	10465239
Inversion	Chr11	10067269	10465243

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes