Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4600-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4600-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 52

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr2 3025983 C-T HET OsKitaake02g043300
SBS Chr2 15239357 G-A HET
SBS Chr2 17429894 G-A HET
SBS Chr2 25121080 T-C HET
SBS Chr2 25408903 G-T HOMO
SBS Chr2 30833369 G-C HOMO OsKitaake02g314400
SBS Chr2 31617105 G-A HET
SBS Chr3 13965615 C-A HOMO
SBS Chr3 14490502 T-G HET
SBS Chr3 15811305 T-C HET
SBS Chr3 17134566 T-C HET
SBS Chr4 1403332 G-A HET
SBS Chr4 9410079 C-G HET
SBS Chr4 18242510 G-A HET
SBS Chr4 25902598 C-T HET
SBS Chr4 30405645 G-A HET
SBS Chr4 36472741 G-T HET
SBS Chr4 36472742 G-T HET
SBS Chr5 12014125 G-A HET
SBS Chr5 14618338 C-T HET
SBS Chr5 18826204 T-G HET
SBS Chr5 20753101 G-A HET
SBS Chr6 3736824 G-C HET OsKitaake06g051800
SBS Chr6 26242166 A-G HET
SBS Chr7 6586118 G-T HET
SBS Chr7 14360196 G-T HET
SBS Chr7 15893412 G-A HOMO
SBS Chr7 17525135 G-A HET
SBS Chr7 19929704 C-T HET
SBS Chr8 10257398 C-T HET
SBS Chr9 4336205 G-T HET
SBS Chr9 4336207 C-T HET
SBS Chr9 5875966 C-T HET
SBS Chr9 7170720 A-T HET
SBS Chr9 9102100 C-T HET
SBS Chr9 19566691 T-C HET
SBS Chr10 603830 A-T HET
SBS Chr10 7607045 C-A HET OsKitaake10g049000
SBS Chr10 7607049 G-T HET
SBS Chr10 11215807 T-G HET
SBS Chr10 17860543 C-T HET
SBS Chr10 19004298 G-A HET
SBS Chr11 3768293 A-C HET
SBS Chr11 7544420 C-G HET
SBS Chr11 8869727 C-G HET
SBS Chr11 12482309 A-T HET
SBS Chr11 13428705 A-T HOMO
SBS Chr11 13428708 T-C HOMO
SBS Chr11 17871648 C-T HOMO
SBS Chr11 17871649 C-T HOMO
SBS Chr12 11917864 T-C HET
SBS Chr12 21018097 A-C HOMO

Deletions: 22

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr1 2158242 2158263 22 OsKitaake01g027200
Deletion Chr2 2188334 2188334 1 2
Deletion Chr6 5258893 5258895 3
Deletion Chr4 6464858 6464858 1
Deletion Chr6 7229452 7229452 1
Deletion Chr7 7360754 7360754 1
Deletion Chr7 8827820 8827830 11
Deletion Chr7 9352196 9352196 1
Deletion Chr6 11174310 11174310 1
Deletion Chr8 11368997 11368999 3
Deletion Chr2 12263613 12263613 1
Deletion Chr10 12380001 12409000 29000 2
Deletion Chr7 12394955 12394962 8
Deletion Chr10 13029517 13029522 6
Deletion Chr7 18581549 18581549 1
Deletion Chr4 18665461 18665469 9
Deletion Chr5 19913015 19913033 19
Deletion Chr10 21179326 21179347 22 OsKitaake10g164400
Deletion Chr10 22754240 22754240 1
Deletion Chr3 22838143 22838144 2
Deletion Chr6 26656566 26656567 2
Deletion Chr4 35690001 35719000 29000 4

Insertions: 11

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr1 11133052 11133054 1
Insertion Chr4 9828774 9828776 1
Insertion Chr4 11570664 11570667 2
Insertion Chr4 20865577 20865579 1
Insertion Chr7 21530716 21530718 1
Insertion Chr8 20088228 20088230 1
Insertion Chr11 14083180 14083182 1
Insertion Chr12 14826085 14826087 1
Insertion Chr10 6967665 6967667 1
Insertion Chr10 18598587 18598590 2
Insertion Chr11 9233400 9233402 1

Inversions: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr1 24483299 24657549
Inversion Chr5 27929632 27929935 OsKitaake05g257100

Translocations: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr8 18233635 Chr1 26074569
Translocation Chr11 18321173 Chr1 22048429 OsKitaake11g142500
Translocation Chr7 22933475 Chr4 34419265
Translocation Chr7 22934307 Chr4 34419263
Translocation Chr3 35185137 Chr1 43623808

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr2	3025983	C-T	HET		OsKitaake02g043300
SBS	Chr2	15239357	G-A	HET
SBS	Chr2	17429894	G-A	HET
SBS	Chr2	25121080	T-C	HET
SBS	Chr2	25408903	G-T	HOMO
SBS	Chr2	30833369	G-C	HOMO		OsKitaake02g314400
SBS	Chr2	31617105	G-A	HET
SBS	Chr3	13965615	C-A	HOMO
SBS	Chr3	14490502	T-G	HET
SBS	Chr3	15811305	T-C	HET
SBS	Chr3	17134566	T-C	HET
SBS	Chr4	1403332	G-A	HET
SBS	Chr4	9410079	C-G	HET
SBS	Chr4	18242510	G-A	HET
SBS	Chr4	25902598	C-T	HET
SBS	Chr4	30405645	G-A	HET
SBS	Chr4	36472741	G-T	HET
SBS	Chr4	36472742	G-T	HET
SBS	Chr5	12014125	G-A	HET
SBS	Chr5	14618338	C-T	HET
SBS	Chr5	18826204	T-G	HET
SBS	Chr5	20753101	G-A	HET
SBS	Chr6	3736824	G-C	HET		OsKitaake06g051800
SBS	Chr6	26242166	A-G	HET
SBS	Chr7	6586118	G-T	HET
SBS	Chr7	14360196	G-T	HET
SBS	Chr7	15893412	G-A	HOMO
SBS	Chr7	17525135	G-A	HET
SBS	Chr7	19929704	C-T	HET
SBS	Chr8	10257398	C-T	HET
SBS	Chr9	4336205	G-T	HET
SBS	Chr9	4336207	C-T	HET
SBS	Chr9	5875966	C-T	HET
SBS	Chr9	7170720	A-T	HET
SBS	Chr9	9102100	C-T	HET
SBS	Chr9	19566691	T-C	HET
SBS	Chr10	603830	A-T	HET
SBS	Chr10	7607045	C-A	HET		OsKitaake10g049000
SBS	Chr10	7607049	G-T	HET
SBS	Chr10	11215807	T-G	HET
SBS	Chr10	17860543	C-T	HET
SBS	Chr10	19004298	G-A	HET
SBS	Chr11	3768293	A-C	HET
SBS	Chr11	7544420	C-G	HET
SBS	Chr11	8869727	C-G	HET
SBS	Chr11	12482309	A-T	HET
SBS	Chr11	13428705	A-T	HOMO
SBS	Chr11	13428708	T-C	HOMO
SBS	Chr11	17871648	C-T	HOMO
SBS	Chr11	17871649	C-T	HOMO
SBS	Chr12	11917864	T-C	HET
SBS	Chr12	21018097	A-C	HOMO

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	2158242	2158263	22	OsKitaake01g027200
Deletion	Chr2	2188334	2188334	1	2
Deletion	Chr6	5258893	5258895	3
Deletion	Chr4	6464858	6464858	1
Deletion	Chr6	7229452	7229452	1
Deletion	Chr7	7360754	7360754	1
Deletion	Chr7	8827820	8827830	11
Deletion	Chr7	9352196	9352196	1
Deletion	Chr6	11174310	11174310	1
Deletion	Chr8	11368997	11368999	3
Deletion	Chr2	12263613	12263613	1
Deletion	Chr10	12380001	12409000	29000	2
Deletion	Chr7	12394955	12394962	8
Deletion	Chr10	13029517	13029522	6
Deletion	Chr7	18581549	18581549	1
Deletion	Chr4	18665461	18665469	9
Deletion	Chr5	19913015	19913033	19
Deletion	Chr10	21179326	21179347	22	OsKitaake10g164400
Deletion	Chr10	22754240	22754240	1
Deletion	Chr3	22838143	22838144	2
Deletion	Chr6	26656566	26656567	2
Deletion	Chr4	35690001	35719000	29000	4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	24483299	24657549
Inversion	Chr5	27929632	27929935	OsKitaake05g257100

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes