Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4726-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4726-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 61

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 12117933 G-A HET
SBS Chr1 14654583 G-A HET
SBS Chr1 23458247 T-C HET
SBS Chr1 38172946 T-A HET
SBS Chr2 7057465 A-G HOMO
SBS Chr2 13630273 G-C HOMO
SBS Chr3 1845470 C-T HET
SBS Chr3 19413026 G-A HOMO
SBS Chr3 24418519 T-G HOMO
SBS Chr3 27709612 G-A HET
SBS Chr3 32076199 C-T HET
SBS Chr3 33265975 G-A HET
SBS Chr4 4300438 A-T HET OsKitaake04g021300
SBS Chr4 9136982 G-A HET
SBS Chr4 9185634 G-A HET
SBS Chr4 11597789 T-A HET
SBS Chr4 17754560 T-C HOMO
SBS Chr4 19293689 G-A HET
SBS Chr4 21581390 T-A HET
SBS Chr4 22641636 G-A HOMO
SBS Chr5 428318 A-G HET
SBS Chr5 2943845 A-T HET
SBS Chr5 4276895 G-A HET
SBS Chr5 9756998 C-A HET
SBS Chr5 12466351 T-G HET
SBS Chr5 14273812 C-T HET
SBS Chr5 16126405 T-C HET
SBS Chr5 24740428 A-T HET
SBS Chr5 29697488 G-T HET
SBS Chr6 7224707 G-A HET
SBS Chr6 11636870 G-A HET
SBS Chr6 12497330 C-T HET
SBS Chr6 22640107 A-G HET
SBS Chr6 29078452 G-C HET
SBS Chr7 930291 C-T HET OsKitaake07g011900
SBS Chr7 5266495 C-T HET
SBS Chr7 10276047 C-A HET
SBS Chr7 13935478 G-A HET
SBS Chr7 23479249 T-G HET
SBS Chr8 3077038 G-T HOMO
SBS Chr8 18247374 G-T HET
SBS Chr8 23035794 T-C HET
SBS Chr9 686475 A-G HET
SBS Chr9 4864429 C-T HET
SBS Chr9 5240168 A-T HET
SBS Chr9 7425956 C-T HOMO
SBS Chr9 12726477 C-G HET
SBS Chr9 16740182 T-C HET
SBS Chr9 19888824 A-T HET
SBS Chr10 7050881 G-A HOMO
SBS Chr10 15535474 C-A HOMO
SBS Chr10 23733870 G-T HOMO
SBS Chr11 8627258 G-A HET
SBS Chr11 13692023 C-T HET
SBS Chr11 24291675 C-T HET
SBS Chr11 24417996 G-A HET
SBS Chr11 28906827 C-A HET
SBS Chr12 8598653 C-T HET
SBS Chr12 9769725 G-A HET
SBS Chr12 19729217 T-C HET
SBS Chr12 25656837 T-C HET

Deletions: 18

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr7 405001 455000 50000 9
Deletion Chr7 461001 521000 60000 9
Deletion Chr12 5117492 5117492 1
Deletion Chr4 6737139 6737139 1
Deletion Chr5 8931078 8931078 1
Deletion Chr1 9643192 9643193 2
Deletion Chr1 10058408 10058408 1
Deletion Chr11 13759559 13759561 3
Deletion Chr3 17193955 17193955 1
Deletion Chr1 17284652 17284818 167
Deletion Chr4 18380069 18380069 1
Deletion Chr7 18581474 18581475 2
Deletion Chr12 19758241 19758243 3
Deletion Chr12 23647311 23647312 2
Deletion Chr7 25435564 25435565 2 2
Deletion Chr3 27589861 27589861 1
Deletion Chr2 31687883 31687883 1
Deletion Chr4 34312229 34312229 1

Insertions: 8

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr2 16557499 16557501 1
Insertion Chr6 24014826 24014828 1
Insertion Chr9 13722046 13722048 1
Insertion Chr11 25477991 25477993 1
Insertion Chr2 4257927 4257929 1
Insertion Chr2 19005770 19005772 1
Insertion Chr5 26134549 26134551 1
Insertion Chr9 238209 238211 1

Inversions: 1

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr4 19770243 19770461

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr3 15223511 Chr1 12376755 OsKitaake03g197500
Translocation Chr3 15223518 Chr1 12366655 2

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	12117933	G-A	HET
SBS	Chr1	14654583	G-A	HET
SBS	Chr1	23458247	T-C	HET
SBS	Chr1	38172946	T-A	HET
SBS	Chr2	7057465	A-G	HOMO
SBS	Chr2	13630273	G-C	HOMO
SBS	Chr3	1845470	C-T	HET
SBS	Chr3	19413026	G-A	HOMO
SBS	Chr3	24418519	T-G	HOMO
SBS	Chr3	27709612	G-A	HET
SBS	Chr3	32076199	C-T	HET
SBS	Chr3	33265975	G-A	HET
SBS	Chr4	4300438	A-T	HET		OsKitaake04g021300
SBS	Chr4	9136982	G-A	HET
SBS	Chr4	9185634	G-A	HET
SBS	Chr4	11597789	T-A	HET
SBS	Chr4	17754560	T-C	HOMO
SBS	Chr4	19293689	G-A	HET
SBS	Chr4	21581390	T-A	HET
SBS	Chr4	22641636	G-A	HOMO
SBS	Chr5	428318	A-G	HET
SBS	Chr5	2943845	A-T	HET
SBS	Chr5	4276895	G-A	HET
SBS	Chr5	9756998	C-A	HET
SBS	Chr5	12466351	T-G	HET
SBS	Chr5	14273812	C-T	HET
SBS	Chr5	16126405	T-C	HET
SBS	Chr5	24740428	A-T	HET
SBS	Chr5	29697488	G-T	HET
SBS	Chr6	7224707	G-A	HET
SBS	Chr6	11636870	G-A	HET
SBS	Chr6	12497330	C-T	HET
SBS	Chr6	22640107	A-G	HET
SBS	Chr6	29078452	G-C	HET
SBS	Chr7	930291	C-T	HET		OsKitaake07g011900
SBS	Chr7	5266495	C-T	HET
SBS	Chr7	10276047	C-A	HET
SBS	Chr7	13935478	G-A	HET
SBS	Chr7	23479249	T-G	HET
SBS	Chr8	3077038	G-T	HOMO
SBS	Chr8	18247374	G-T	HET
SBS	Chr8	23035794	T-C	HET
SBS	Chr9	686475	A-G	HET
SBS	Chr9	4864429	C-T	HET
SBS	Chr9	5240168	A-T	HET
SBS	Chr9	7425956	C-T	HOMO
SBS	Chr9	12726477	C-G	HET
SBS	Chr9	16740182	T-C	HET
SBS	Chr9	19888824	A-T	HET
SBS	Chr10	7050881	G-A	HOMO
SBS	Chr10	15535474	C-A	HOMO
SBS	Chr10	23733870	G-T	HOMO
SBS	Chr11	8627258	G-A	HET
SBS	Chr11	13692023	C-T	HET
SBS	Chr11	24291675	C-T	HET
SBS	Chr11	24417996	G-A	HET
SBS	Chr11	28906827	C-A	HET
SBS	Chr12	8598653	C-T	HET
SBS	Chr12	9769725	G-A	HET
SBS	Chr12	19729217	T-C	HET
SBS	Chr12	25656837	T-C	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	405001	455000	50000	9
Deletion	Chr7	461001	521000	60000	9
Deletion	Chr12	5117492	5117492	1
Deletion	Chr4	6737139	6737139	1
Deletion	Chr5	8931078	8931078	1
Deletion	Chr1	9643192	9643193	2
Deletion	Chr1	10058408	10058408	1
Deletion	Chr11	13759559	13759561	3
Deletion	Chr3	17193955	17193955	1
Deletion	Chr1	17284652	17284818	167
Deletion	Chr4	18380069	18380069	1
Deletion	Chr7	18581474	18581475	2
Deletion	Chr12	19758241	19758243	3
Deletion	Chr12	23647311	23647312	2
Deletion	Chr7	25435564	25435565	2	2
Deletion	Chr3	27589861	27589861	1
Deletion	Chr2	31687883	31687883	1
Deletion	Chr4	34312229	34312229	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr4	19770243	19770461

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes