Search Kitaake
| Mutant Information |
|---|
| Mutant Name | FN4746-S [Download] |
| Generation | M2 |
| Genus Species | Oryza Sativa |
| Cultivar | Kitaake |
| Alignment File (BAM File) | Download FN4746-S Alignment File |
| Seed Availability | Yes [Order Seeds] |
| Variant Information |
|---|
Single base substitutions: 47
Variant Type |
Chromosome |
Position |
Change |
Genotype |
Effect |
Gene Affected |
| SBS | Chr1 | 3352307 | G-A | HET | OsKitaake01g044000 | |
| SBS | Chr1 | 4249403 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr1 | 5522993 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr1 | 21520950 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr1 | 27114763 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr2 | 11657983 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr2 | 14586190 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr2 | 26520010 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr2 | 34441716 | A-T | HET | ||
| SBS | Chr3 | 2312842 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr3 | 11482500 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr3 | 14916385 | T-G | HET | ||
| SBS | Chr3 | 21442510 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr3 | 25733925 | T-C | HET | OsKitaake03g271300 | |
| SBS | Chr3 | 25743710 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr4 | 6578604 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr4 | 8490985 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr4 | 27259221 | T-C | HET | ||
| SBS | Chr4 | 29503607 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr4 | 34268983 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr5 | 4601079 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr5 | 8731522 | G-C | HOMO | ||
| SBS | Chr5 | 12441932 | A-C | HOMO | ||
| SBS | Chr5 | 12773075 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr5 | 14611877 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr6 | 10621149 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr6 | 10839961 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr6 | 12164955 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr6 | 15341359 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr6 | 26072935 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr7 | 29676012 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr8 | 20162066 | G-C | HET | ||
| SBS | Chr8 | 29194369 | A-G | HET | ||
| SBS | Chr9 | 5312226 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr9 | 18890774 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr10 | 3601432 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr10 | 4727781 | T-A | HET | ||
| SBS | Chr10 | 13667048 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 5917174 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr11 | 8246583 | G-A | HOMO | ||
| SBS | Chr11 | 10572164 | C-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 17314464 | C-A | HOMO | ||
| SBS | Chr11 | 24385621 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr11 | 24635996 | G-T | HET | ||
| SBS | Chr11 | 25096756 | C-T | HET | ||
| SBS | Chr12 | 6476892 | G-A | HET | ||
| SBS | Chr12 | 10307218 | G-A | HET |
Deletions: 16
Insertions: 9
Variant Type |
Chromosome |
Start |
End |
Size(bp) |
Number of Genes |
| Insertion | Chr3 | 8236365 | 8236367 | 1 | |
| Insertion | Chr10 | 20552120 | 20552122 | 1 | |
| Insertion | Chr1 | 24603759 | 24603763 | 3 | OsKitaake01g237700  |
| Insertion | Chr3 | 28780293 | 28780295 | 1 | |
| Insertion | Chr4 | 1825659 | 1825664 | 4 | |
| Insertion | Chr8 | 13629374 | 13629376 | 1 | |
| Insertion | Chr11 | 19150309 | 19150311 | 1 | |
| Insertion | Chr11 | 24121265 | 24121267 | 1 | |
| Insertion | Chr12 | 20468119 | 20468121 | 1 |
Translocations: 1
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Chromosome |
Position 2 |
Number of Genes |
| Translocation | Chr11 | 28405909 | Chr7 | 10584864 |