Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4769-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4769-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 81

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 2876473 G-A HOMO
SBS Chr1 10470091 A-C HOMO
SBS Chr1 21002541 G-A HOMO
SBS Chr1 24210206 A-T HET
SBS Chr1 32356077 T-G HOMO
SBS Chr1 34840561 G-T HET
SBS Chr1 34840562 C-T HET
SBS Chr1 38784123 G-T HET
SBS Chr1 43404232 T-A HET
SBS Chr1 43524012 G-A HET
SBS Chr2 10060363 A-G HET
SBS Chr2 11224811 C-T HET
SBS Chr2 22980854 C-T HET
SBS Chr2 22980857 C-A HET
SBS Chr2 31996916 G-A HET
SBS Chr3 4370722 C-T HET
SBS Chr3 8566486 A-T HET
SBS Chr3 8979905 G-C HET
SBS Chr3 9640797 G-T HET
SBS Chr3 13577163 C-T HET
SBS Chr3 22609649 G-A HET
SBS Chr3 25156925 C-T HET
SBS Chr3 32379414 G-A HET
SBS Chr3 35444822 T-C HET
SBS Chr3 37281593 C-G HET
SBS Chr4 4539269 G-A HET
SBS Chr4 6750771 A-T HET
SBS Chr4 10465567 T-C HET
SBS Chr4 13818010 C-A HET
SBS Chr4 15076119 G-T HET
SBS Chr4 24315189 C-A HET
SBS Chr4 26526908 A-T HET
SBS Chr4 28281093 G-C HET
SBS Chr4 34514667 A-G HOMO
SBS Chr4 34859973 T-A HOMO
SBS Chr5 9009987 G-T HET
SBS Chr5 9009988 C-T HET
SBS Chr5 14779237 C-A HET
SBS Chr5 17659781 T-C HET
SBS Chr5 18357730 T-C HET
SBS Chr5 24008808 A-C HET
SBS Chr5 26075129 G-T HET
SBS Chr5 26868960 C-T HET
SBS Chr6 5611589 C-T HET
SBS Chr6 5908499 C-T HOMO
SBS Chr6 9773503 G-C HET
SBS Chr6 28350616 G-T HET
SBS Chr6 28350617 A-C HET
SBS Chr6 30316724 C-T HOMO
SBS Chr7 729312 T-G HOMO
SBS Chr7 6194064 A-G HET
SBS Chr7 17759184 G-A HET
SBS Chr8 10181179 C-T HET
SBS Chr8 12862535 T-A HOMO
SBS Chr8 17125580 G-A HET
SBS Chr8 20247264 A-G HET
SBS Chr8 22617797 G-A HET
SBS Chr8 23106423 C-G HET
SBS Chr9 4172313 C-T HOMO
SBS Chr9 4245180 T-G HET
SBS Chr9 4245186 A-G HET
SBS Chr9 7219592 C-A HET
SBS Chr9 7264111 C-T HET
SBS Chr9 7411446 C-T HET
SBS Chr9 8283688 C-T HET
SBS Chr9 8968379 T-A HET
SBS Chr9 9937167 A-T HET
SBS Chr9 13195047 G-A HET
SBS Chr9 16708643 T-A HET
SBS Chr10 2744443 C-G HOMO
SBS Chr10 19525304 A-T HET
SBS Chr10 20468114 G-A HET
SBS Chr11 4113410 A-T HET
SBS Chr11 5390604 A-G HET
SBS Chr11 10918627 C-T HET
SBS Chr11 18792372 G-T HET
SBS Chr11 25604466 G-A HET
SBS Chr11 27343942 C-A HET
SBS Chr11 28269199 G-T HOMO
SBS Chr12 18526570 T-C HOMO
SBS Chr12 25825385 C-A HET

Deletions: 22

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr6 2806833 2806833 1
Deletion Chr8 3323859 3323859 1
Deletion Chr2 5404899 5404900 2
Deletion Chr7 5953628 5953629 2
Deletion Chr9 6921001 7215000 294000 23
Deletion Chr6 7225338 7225339 2
Deletion Chr2 12506023 12506023 1
Deletion Chr2 12560750 12560750 1
Deletion Chr6 13833421 13833425 5
Deletion Chr8 17088504 17088521 18
Deletion Chr9 17456504 17456507 4
Deletion Chr9 17515167 17515167 1
Deletion Chr7 18009001 18034000 25000 2
Deletion Chr2 18217548 18217551 4
Deletion Chr4 19049717 19049723 7 OsKitaake04g095966
Deletion Chr12 20036160 20036160 1
Deletion Chr12 24243001 24259000 16000 2
Deletion Chr8 24889001 24919000 30000 3
Deletion Chr7 27702039 27702039 1
Deletion Chr2 29597068 29597086 19
Deletion Chr3 35445719 35445719 1
Deletion Chr1 36105458 36105475 18

Insertions: 11

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 6090806 6090808 1
Insertion Chr3 15050695 15050698 2
Insertion Chr4 26554230 26554234 3
Insertion Chr5 4711284 4711286 1
Insertion Chr7 5172183 5172185 1
Insertion Chr11 22388452 22388454 1
Insertion Chr1 22829005 22829007 1
Insertion Chr3 6938380 6938383 2
Insertion Chr3 31430918 31430920 1
Insertion Chr9 21827792 21827794 1
Insertion Chr9 22183452 22183454 1

Inversions: 5

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr1 4304768 4959518 2
Inversion Chr1 4304774 4959526 2
Inversion Chr6 4429271 4966500 2
Inversion Chr9 7214926 7697429
Inversion Chr1 40526449 40526582

Translocations: 12

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr6 4429258 Chr3 17465047 OsKitaake06g060800
Translocation Chr6 4966499 Chr3 17470902 2
Translocation Chr8 5888723 Chr5 18654694
Translocation Chr8 5903034 Chr5 18654728
Translocation Chr9 7697383 Chr3 5306939
Translocation Chr11 11174624 Chr7 18008909
Translocation Chr11 11174630 Chr7 18008656
Translocation Chr8 24918897 Chr3 5305866
Translocation Chr12 25157455 Chr8 3342044 OsKitaake08g037400
Translocation Chr12 26282925 Chr8 3342032 OsKitaake08g037400
Translocation Chr4 35785832 Chr2 30960534 OsKitaake04g306000
Translocation Chr4 35785844 Chr2 30960517 OsKitaake04g306000

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	2876473	G-A	HOMO
SBS	Chr1	10470091	A-C	HOMO
SBS	Chr1	21002541	G-A	HOMO
SBS	Chr1	24210206	A-T	HET
SBS	Chr1	32356077	T-G	HOMO
SBS	Chr1	34840561	G-T	HET
SBS	Chr1	34840562	C-T	HET
SBS	Chr1	38784123	G-T	HET
SBS	Chr1	43404232	T-A	HET
SBS	Chr1	43524012	G-A	HET
SBS	Chr2	10060363	A-G	HET
SBS	Chr2	11224811	C-T	HET
SBS	Chr2	22980854	C-T	HET
SBS	Chr2	22980857	C-A	HET
SBS	Chr2	31996916	G-A	HET
SBS	Chr3	4370722	C-T	HET
SBS	Chr3	8566486	A-T	HET
SBS	Chr3	8979905	G-C	HET
SBS	Chr3	9640797	G-T	HET
SBS	Chr3	13577163	C-T	HET
SBS	Chr3	22609649	G-A	HET
SBS	Chr3	25156925	C-T	HET
SBS	Chr3	32379414	G-A	HET
SBS	Chr3	35444822	T-C	HET
SBS	Chr3	37281593	C-G	HET
SBS	Chr4	4539269	G-A	HET
SBS	Chr4	6750771	A-T	HET
SBS	Chr4	10465567	T-C	HET
SBS	Chr4	13818010	C-A	HET
SBS	Chr4	15076119	G-T	HET
SBS	Chr4	24315189	C-A	HET
SBS	Chr4	26526908	A-T	HET
SBS	Chr4	28281093	G-C	HET
SBS	Chr4	34514667	A-G	HOMO
SBS	Chr4	34859973	T-A	HOMO
SBS	Chr5	9009987	G-T	HET
SBS	Chr5	9009988	C-T	HET
SBS	Chr5	14779237	C-A	HET
SBS	Chr5	17659781	T-C	HET
SBS	Chr5	18357730	T-C	HET
SBS	Chr5	24008808	A-C	HET
SBS	Chr5	26075129	G-T	HET
SBS	Chr5	26868960	C-T	HET
SBS	Chr6	5611589	C-T	HET
SBS	Chr6	5908499	C-T	HOMO
SBS	Chr6	9773503	G-C	HET
SBS	Chr6	28350616	G-T	HET
SBS	Chr6	28350617	A-C	HET
SBS	Chr6	30316724	C-T	HOMO
SBS	Chr7	729312	T-G	HOMO
SBS	Chr7	6194064	A-G	HET
SBS	Chr7	17759184	G-A	HET
SBS	Chr8	10181179	C-T	HET
SBS	Chr8	12862535	T-A	HOMO
SBS	Chr8	17125580	G-A	HET
SBS	Chr8	20247264	A-G	HET
SBS	Chr8	22617797	G-A	HET
SBS	Chr8	23106423	C-G	HET
SBS	Chr9	4172313	C-T	HOMO
SBS	Chr9	4245180	T-G	HET
SBS	Chr9	4245186	A-G	HET
SBS	Chr9	7219592	C-A	HET
SBS	Chr9	7264111	C-T	HET
SBS	Chr9	7411446	C-T	HET
SBS	Chr9	8283688	C-T	HET
SBS	Chr9	8968379	T-A	HET
SBS	Chr9	9937167	A-T	HET
SBS	Chr9	13195047	G-A	HET
SBS	Chr9	16708643	T-A	HET
SBS	Chr10	2744443	C-G	HOMO
SBS	Chr10	19525304	A-T	HET
SBS	Chr10	20468114	G-A	HET
SBS	Chr11	4113410	A-T	HET
SBS	Chr11	5390604	A-G	HET
SBS	Chr11	10918627	C-T	HET
SBS	Chr11	18792372	G-T	HET
SBS	Chr11	25604466	G-A	HET
SBS	Chr11	27343942	C-A	HET
SBS	Chr11	28269199	G-T	HOMO
SBS	Chr12	18526570	T-C	HOMO
SBS	Chr12	25825385	C-A	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr6	2806833	2806833	1
Deletion	Chr8	3323859	3323859	1
Deletion	Chr2	5404899	5404900	2
Deletion	Chr7	5953628	5953629	2
Deletion	Chr9	6921001	7215000	294000	23
Deletion	Chr6	7225338	7225339	2
Deletion	Chr2	12506023	12506023	1
Deletion	Chr2	12560750	12560750	1
Deletion	Chr6	13833421	13833425	5
Deletion	Chr8	17088504	17088521	18
Deletion	Chr9	17456504	17456507	4
Deletion	Chr9	17515167	17515167	1
Deletion	Chr7	18009001	18034000	25000	2
Deletion	Chr2	18217548	18217551	4
Deletion	Chr4	19049717	19049723	7	OsKitaake04g095966
Deletion	Chr12	20036160	20036160	1
Deletion	Chr12	24243001	24259000	16000	2
Deletion	Chr8	24889001	24919000	30000	3
Deletion	Chr7	27702039	27702039	1
Deletion	Chr2	29597068	29597086	19
Deletion	Chr3	35445719	35445719	1
Deletion	Chr1	36105458	36105475	18

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr1	4304768	4959518	2
Inversion	Chr1	4304774	4959526	2
Inversion	Chr6	4429271	4966500	2
Inversion	Chr9	7214926	7697429
Inversion	Chr1	40526449	40526582

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes