Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4773-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4773-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 52

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3975680 A-G HET
SBS Chr1 39368799 G-T HET
SBS Chr1 40786217 T-A HET
SBS Chr2 4099818 C-A HET
SBS Chr2 4989059 G-A HET
SBS Chr2 7244025 T-C HET
SBS Chr2 22568219 A-G HET
SBS Chr2 23925940 C-T HET
SBS Chr3 2389556 A-G HET OsKitaake03g034000
SBS Chr3 32420759 T-C HET
SBS Chr4 5126868 A-C HET
SBS Chr4 10242233 T-C HET
SBS Chr4 10856327 C-T HET
SBS Chr4 17782856 G-T HET
SBS Chr4 33772194 G-A HOMO
SBS Chr5 7229890 G-A HET
SBS Chr5 7777438 G-A HET
SBS Chr5 21189785 G-T HET
SBS Chr5 23660275 C-T HET
SBS Chr6 6803024 G-T HOMO
SBS Chr6 28228155 T-G HOMO
SBS Chr7 1462163 G-A HET
SBS Chr7 12354416 C-T HET
SBS Chr7 14572688 G-A HET
SBS Chr7 14804562 C-T HET
SBS Chr7 19747115 A-C HET
SBS Chr8 157002 T-C HET
SBS Chr8 8281501 T-C HET
SBS Chr8 10390063 C-A HET
SBS Chr8 13211407 G-A HET
SBS Chr8 20978162 C-T HET
SBS Chr8 23593295 C-T HET
SBS Chr9 965750 T-A HET
SBS Chr9 1957385 C-T HET
SBS Chr9 5435973 G-T HET
SBS Chr9 6325123 G-A HET
SBS Chr9 7889372 C-T HET
SBS Chr10 285868 A-T HET
SBS Chr10 3318257 C-T HOMO
SBS Chr10 7967741 A-G HOMO
SBS Chr10 9503951 T-C HET
SBS Chr10 12197031 G-T HOMO
SBS Chr11 7986848 T-G HET
SBS Chr11 9679459 A-G HET
SBS Chr11 11592661 A-T HET
SBS Chr11 12216139 G-A HET
SBS Chr11 15093715 A-G HET
SBS Chr11 22787788 C-A HET
SBS Chr11 24273215 G-C HOMO
SBS Chr11 29194451 C-T HET
SBS Chr12 2639176 C-T HET
SBS Chr12 7682278 C-T HOMO

Deletions: 12

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr1 2497159 2497163 5
Deletion Chr2 6303001 6337000 34000 6
Deletion Chr9 10165825 10165837 13
Deletion Chr9 10620717 10620717 1
Deletion Chr4 11331423 11331423 1
Deletion Chr12 14738171 14738171 1
Deletion Chr11 14893538 14893538 1 2
Deletion Chr2 15861220 15861220 1
Deletion Chr12 25100440 25100440 1
Deletion Chr4 26109782 26109782 1
Deletion Chr5 26463590 26463591 2
Deletion Chr1 36887984 36887984 1

Insertions: 6

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 32367466 32367468 1
Insertion Chr5 6196990 6196992 1
Insertion Chr9 22414920 22414922 1
Insertion Chr2 17727125 17727127 1
Insertion Chr6 1417137 1417142 4
Insertion Chr10 21053160 21053162 1

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3975680	A-G	HET
SBS	Chr1	39368799	G-T	HET
SBS	Chr1	40786217	T-A	HET
SBS	Chr2	4099818	C-A	HET
SBS	Chr2	4989059	G-A	HET
SBS	Chr2	7244025	T-C	HET
SBS	Chr2	22568219	A-G	HET
SBS	Chr2	23925940	C-T	HET
SBS	Chr3	2389556	A-G	HET		OsKitaake03g034000
SBS	Chr3	32420759	T-C	HET
SBS	Chr4	5126868	A-C	HET
SBS	Chr4	10242233	T-C	HET
SBS	Chr4	10856327	C-T	HET
SBS	Chr4	17782856	G-T	HET
SBS	Chr4	33772194	G-A	HOMO
SBS	Chr5	7229890	G-A	HET
SBS	Chr5	7777438	G-A	HET
SBS	Chr5	21189785	G-T	HET
SBS	Chr5	23660275	C-T	HET
SBS	Chr6	6803024	G-T	HOMO
SBS	Chr6	28228155	T-G	HOMO
SBS	Chr7	1462163	G-A	HET
SBS	Chr7	12354416	C-T	HET
SBS	Chr7	14572688	G-A	HET
SBS	Chr7	14804562	C-T	HET
SBS	Chr7	19747115	A-C	HET
SBS	Chr8	157002	T-C	HET
SBS	Chr8	8281501	T-C	HET
SBS	Chr8	10390063	C-A	HET
SBS	Chr8	13211407	G-A	HET
SBS	Chr8	20978162	C-T	HET
SBS	Chr8	23593295	C-T	HET
SBS	Chr9	965750	T-A	HET
SBS	Chr9	1957385	C-T	HET
SBS	Chr9	5435973	G-T	HET
SBS	Chr9	6325123	G-A	HET
SBS	Chr9	7889372	C-T	HET
SBS	Chr10	285868	A-T	HET
SBS	Chr10	3318257	C-T	HOMO
SBS	Chr10	7967741	A-G	HOMO
SBS	Chr10	9503951	T-C	HET
SBS	Chr10	12197031	G-T	HOMO
SBS	Chr11	7986848	T-G	HET
SBS	Chr11	9679459	A-G	HET
SBS	Chr11	11592661	A-T	HET
SBS	Chr11	12216139	G-A	HET
SBS	Chr11	15093715	A-G	HET
SBS	Chr11	22787788	C-A	HET
SBS	Chr11	24273215	G-C	HOMO
SBS	Chr11	29194451	C-T	HET
SBS	Chr12	2639176	C-T	HET
SBS	Chr12	7682278	C-T	HOMO

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	2497159	2497163	5
Deletion	Chr2	6303001	6337000	34000	6
Deletion	Chr9	10165825	10165837	13
Deletion	Chr9	10620717	10620717	1
Deletion	Chr4	11331423	11331423	1
Deletion	Chr12	14738171	14738171	1
Deletion	Chr11	14893538	14893538	1	2
Deletion	Chr2	15861220	15861220	1
Deletion	Chr12	25100440	25100440	1
Deletion	Chr4	26109782	26109782	1
Deletion	Chr5	26463590	26463591	2
Deletion	Chr1	36887984	36887984	1

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes