Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4792-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4792-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 62

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 3980043 T-C HET
SBS Chr1 6937700 C-T HOMO
SBS Chr1 8641484 G-A HET
SBS Chr1 21396581 C-T HOMO
SBS Chr1 23116488 A-G HOMO
SBS Chr1 28374009 G-C HOMO
SBS Chr1 40355568 A-G HET
SBS Chr2 1313600 A-G HET
SBS Chr2 13287952 G-T HET
SBS Chr2 26006216 G-A HET
SBS Chr2 26598130 G-A HET
SBS Chr2 26598131 C-A HET
SBS Chr2 30368681 A-G HET
SBS Chr2 35788732 A-T HOMO
SBS Chr3 9418131 G-A HET
SBS Chr3 11360114 G-T HET
SBS Chr4 2904598 G-A HET
SBS Chr4 3992825 G-A HOMO
SBS Chr4 17470157 G-A HET
SBS Chr4 23185367 G-A HOMO
SBS Chr4 32741982 T-A HET
SBS Chr4 35672244 T-C HET
SBS Chr5 1456231 T-C HET
SBS Chr5 3548035 G-A HET
SBS Chr5 14457086 C-T HOMO
SBS Chr6 1677218 C-A HET
SBS Chr6 4717346 G-T HET
SBS Chr6 20710691 T-A HET
SBS Chr7 9881035 C-T HET
SBS Chr7 9984143 C-T HET
SBS Chr7 10525345 G-A HET
SBS Chr7 17345965 T-C HOMO
SBS Chr7 22255943 T-C HET
SBS Chr7 26556572 C-T HET
SBS Chr8 2701544 A-G HOMO
SBS Chr8 8750860 C-G HET
SBS Chr8 10550783 C-G HET
SBS Chr8 11179359 A-G HET
SBS Chr8 13378451 T-C HET
SBS Chr8 17882407 C-T HET
SBS Chr9 8221513 C-T HET
SBS Chr9 11812045 T-C HET
SBS Chr9 11853652 C-A HET
SBS Chr9 14336245 C-A HET
SBS Chr10 9470341 C-T HET
SBS Chr10 12941568 G-A HET
SBS Chr10 17198772 A-G HET
SBS Chr10 17342277 G-T HET
SBS Chr10 18630978 G-A HET
SBS Chr10 21088388 C-A HET
SBS Chr11 3680346 A-T HET
SBS Chr11 3841848 T-A HOMO
SBS Chr11 5530444 A-G HET
SBS Chr11 24455489 T-G HOMO
SBS Chr11 24455490 G-T HOMO
SBS Chr11 26453898 G-T HOMO
SBS Chr12 5173257 G-A HET
SBS Chr12 9533720 G-A HET
SBS Chr12 16051468 C-G HET
SBS Chr12 19164114 T-C HET
SBS Chr12 21363638 G-A HET
SBS Chr12 21667703 G-T HET

Deletions: 26

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr2 900801 900807 7 OsKitaake02g012700
Deletion Chr12 1104061 1104061 1
Deletion Chr2 2037264 2037264 1
Deletion Chr7 3606645 3606656 12
Deletion Chr2 5859080 5859087 8
Deletion Chr10 7214001 7444000 230000 12
Deletion Chr7 7220930 7220931 2
Deletion Chr4 7468012 7468012 1
Deletion Chr5 8106182 8106182 1
Deletion Chr7 9094659 9094660 2
Deletion Chr12 9796001 9809000 13000 2
Deletion Chr5 9884416 9884426 11
Deletion Chr10 12079599 12079599 1
Deletion Chr9 12393417 12393433 17
Deletion Chr4 15643786 15643786 1
Deletion Chr11 17498691 17498691 1
Deletion Chr1 20969281 20969283 3
Deletion Chr2 23171398 23171398 1
Deletion Chr1 23341477 23341479 3
Deletion Chr8 27060530 27060530 1
Deletion Chr4 27413001 27497000 84000 12
Deletion Chr6 27850571 27850575 5
Deletion Chr1 28530434 28530434 1
Deletion Chr1 30437537 30437542 6
Deletion Chr4 35737001 35880000 143000 25
Deletion Chr1 42966384 42966385 2

Insertions: 10

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr3 25370302 25370304 1
Insertion Chr6 29828564 29828566 1
Insertion Chr7 23949325 23949327 1
Insertion Chr9 2891713 2891715 1
Insertion Chr11 27540385 27540388 2
Insertion Chr12 5268105 5268109 3
Insertion Chr12 6376453 6376455 1
Insertion Chr2 14839743 14839745 1
Insertion Chr4 27733992 27733994 1
Insertion Chr9 15668781 15668783 1

Inversions: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr3 14671835 15317478
Inversion Chr3 14671837 15317475
Inversion Chr4 27413612 28019158 OsKitaake04g200100
Inversion Chr4 27496535 28019169 OsKitaake04g201100

Translocations: 2

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr10 7235362 Chr4 19466465
Translocation Chr10 7235766 Chr4 19466455

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	3980043	T-C	HET
SBS	Chr1	6937700	C-T	HOMO
SBS	Chr1	8641484	G-A	HET
SBS	Chr1	21396581	C-T	HOMO
SBS	Chr1	23116488	A-G	HOMO
SBS	Chr1	28374009	G-C	HOMO
SBS	Chr1	40355568	A-G	HET
SBS	Chr2	1313600	A-G	HET
SBS	Chr2	13287952	G-T	HET
SBS	Chr2	26006216	G-A	HET
SBS	Chr2	26598130	G-A	HET
SBS	Chr2	26598131	C-A	HET
SBS	Chr2	30368681	A-G	HET
SBS	Chr2	35788732	A-T	HOMO
SBS	Chr3	9418131	G-A	HET
SBS	Chr3	11360114	G-T	HET
SBS	Chr4	2904598	G-A	HET
SBS	Chr4	3992825	G-A	HOMO
SBS	Chr4	17470157	G-A	HET
SBS	Chr4	23185367	G-A	HOMO
SBS	Chr4	32741982	T-A	HET
SBS	Chr4	35672244	T-C	HET
SBS	Chr5	1456231	T-C	HET
SBS	Chr5	3548035	G-A	HET
SBS	Chr5	14457086	C-T	HOMO
SBS	Chr6	1677218	C-A	HET
SBS	Chr6	4717346	G-T	HET
SBS	Chr6	20710691	T-A	HET
SBS	Chr7	9881035	C-T	HET
SBS	Chr7	9984143	C-T	HET
SBS	Chr7	10525345	G-A	HET
SBS	Chr7	17345965	T-C	HOMO
SBS	Chr7	22255943	T-C	HET
SBS	Chr7	26556572	C-T	HET
SBS	Chr8	2701544	A-G	HOMO
SBS	Chr8	8750860	C-G	HET
SBS	Chr8	10550783	C-G	HET
SBS	Chr8	11179359	A-G	HET
SBS	Chr8	13378451	T-C	HET
SBS	Chr8	17882407	C-T	HET
SBS	Chr9	8221513	C-T	HET
SBS	Chr9	11812045	T-C	HET
SBS	Chr9	11853652	C-A	HET
SBS	Chr9	14336245	C-A	HET
SBS	Chr10	9470341	C-T	HET
SBS	Chr10	12941568	G-A	HET
SBS	Chr10	17198772	A-G	HET
SBS	Chr10	17342277	G-T	HET
SBS	Chr10	18630978	G-A	HET
SBS	Chr10	21088388	C-A	HET
SBS	Chr11	3680346	A-T	HET
SBS	Chr11	3841848	T-A	HOMO
SBS	Chr11	5530444	A-G	HET
SBS	Chr11	24455489	T-G	HOMO
SBS	Chr11	24455490	G-T	HOMO
SBS	Chr11	26453898	G-T	HOMO
SBS	Chr12	5173257	G-A	HET
SBS	Chr12	9533720	G-A	HET
SBS	Chr12	16051468	C-G	HET
SBS	Chr12	19164114	T-C	HET
SBS	Chr12	21363638	G-A	HET
SBS	Chr12	21667703	G-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	900801	900807	7	OsKitaake02g012700
Deletion	Chr12	1104061	1104061	1
Deletion	Chr2	2037264	2037264	1
Deletion	Chr7	3606645	3606656	12
Deletion	Chr2	5859080	5859087	8
Deletion	Chr10	7214001	7444000	230000	12
Deletion	Chr7	7220930	7220931	2
Deletion	Chr4	7468012	7468012	1
Deletion	Chr5	8106182	8106182	1
Deletion	Chr7	9094659	9094660	2
Deletion	Chr12	9796001	9809000	13000	2
Deletion	Chr5	9884416	9884426	11
Deletion	Chr10	12079599	12079599	1
Deletion	Chr9	12393417	12393433	17
Deletion	Chr4	15643786	15643786	1
Deletion	Chr11	17498691	17498691	1
Deletion	Chr1	20969281	20969283	3
Deletion	Chr2	23171398	23171398	1
Deletion	Chr1	23341477	23341479	3
Deletion	Chr8	27060530	27060530	1
Deletion	Chr4	27413001	27497000	84000	12
Deletion	Chr6	27850571	27850575	5
Deletion	Chr1	28530434	28530434	1
Deletion	Chr1	30437537	30437542	6
Deletion	Chr4	35737001	35880000	143000	25
Deletion	Chr1	42966384	42966385	2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	14671835	15317478
Inversion	Chr3	14671837	15317475
Inversion	Chr4	27413612	28019158	OsKitaake04g200100
Inversion	Chr4	27496535	28019169	OsKitaake04g201100

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes