Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4830-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4830-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 82

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 4747691 A-G HET
SBS Chr1 4775094 G-A HET
SBS Chr1 4775095 A-T HET
SBS Chr1 5985306 C-T HET
SBS Chr1 15064157 T-G HET
SBS Chr1 17144859 C-T HET
SBS Chr1 20485620 C-T HET
SBS Chr1 27403660 G-T HOMO
SBS Chr1 31831644 G-T HET
SBS Chr2 1449105 C-T HET
SBS Chr2 10810242 C-A HET
SBS Chr2 16993925 C-T HET
SBS Chr2 31609962 G-A HET
SBS Chr3 13465056 C-A HET
SBS Chr3 13552070 G-C HOMO
SBS Chr3 26272148 C-T HOMO
SBS Chr3 26272149 A-T HOMO
SBS Chr4 2522480 C-T HET
SBS Chr4 3044756 A-G HET
SBS Chr4 3391120 G-C HOMO
SBS Chr4 11264777 G-T HOMO
SBS Chr4 13687970 A-C HET
SBS Chr4 23493186 G-A HET
SBS Chr4 25574496 C-T HET
SBS Chr5 591799 G-T HET
SBS Chr5 6667469 G-T HET
SBS Chr5 9614831 G-A HET
SBS Chr5 9999392 C-A HET
SBS Chr5 13963071 G-A HET
SBS Chr5 15456697 C-A HET
SBS Chr5 16179239 A-T HET
SBS Chr5 16179240 A-T HET
SBS Chr5 16179241 C-T HET
SBS Chr5 20138603 T-C HET OsKitaake05g160300
SBS Chr5 20427219 T-C HET
SBS Chr5 27606352 C-T HET
SBS Chr5 27802060 G-T HET
SBS Chr5 29368555 A-T HET
SBS Chr5 29396107 A-G HET
SBS Chr6 172692 C-T HET
SBS Chr6 2400226 A-G HET
SBS Chr6 9928807 C-T HET
SBS Chr6 14276433 A-G HET
SBS Chr6 18045143 A-T HET
SBS Chr6 22522577 G-C HET
SBS Chr6 24354080 A-T HOMO
SBS Chr6 25987162 A-T HET
SBS Chr6 27559468 C-A HET
SBS Chr7 6367054 T-A HET
SBS Chr7 9433915 G-A HET
SBS Chr7 10757633 G-A HET
SBS Chr7 12275097 G-C HET
SBS Chr7 13252147 G-A HET
SBS Chr7 14476206 G-A HET
SBS Chr7 14487099 A-T HET
SBS Chr7 16997872 G-A HET
SBS Chr7 18840656 C-T HET
SBS Chr7 20827585 C-T HOMO
SBS Chr7 22535214 A-C HET
SBS Chr7 27567232 C-G HET
SBS Chr8 1770949 G-T HOMO
SBS Chr8 9773276 G-T HET
SBS Chr8 17869173 A-T HET
SBS Chr8 23069410 G-A HET
SBS Chr9 4184176 A-G HET
SBS Chr9 9178916 C-T HOMO
SBS Chr9 21936086 A-C HET OsKitaake09g194800
SBS Chr9 22211796 T-A HET
SBS Chr10 10690406 C-T HET
SBS Chr10 20874542 A-T HOMO
SBS Chr11 3995917 G-A HET
SBS Chr11 4348436 G-A HET
SBS Chr11 9179278 C-G HET
SBS Chr11 14764680 A-T HET
SBS Chr11 16354792 G-A HET
SBS Chr11 19048160 G-T HET
SBS Chr11 22945356 C-G HET
SBS Chr11 24578656 G-A HET OsKitaake11g198600
SBS Chr11 25497997 C-A HET
SBS Chr12 12926016 G-T HOMO
SBS Chr12 13646077 A-C HOMO
SBS Chr12 15180395 C-T HET

Deletions: 28

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr11 946665 946666 2
Deletion Chr2 1751050 1751054 5
Deletion Chr11 3424838 3424847 10
Deletion Chr7 3498241 3498242 2
Deletion Chr2 3607585 3607585 1 2
Deletion Chr7 5580109 5580112 4
Deletion Chr4 7341240 7341245 6
Deletion Chr6 10544001 10577000 33000 3
Deletion Chr12 11258797 11258798 2
Deletion Chr3 12635690 12635690 1
Deletion Chr5 13674434 13674434 1
Deletion Chr8 15483546 15483554 9
Deletion Chr9 16132472 16132472 1
Deletion Chr9 18309880 18309883 4
Deletion Chr10 18311261 18311262 2 OsKitaake10g129500
Deletion Chr8 18342611 18342611 1
Deletion Chr7 18396733 18396733 1
Deletion Chr5 20601001 21027000 426000 45
Deletion Chr5 21030001 21274000 244000 31
Deletion Chr8 21886004 21886011 8
Deletion Chr3 21991948 21991948 1
Deletion Chr2 23651437 23651437 1
Deletion Chr11 23882001 23907000 25000 2
Deletion Chr7 24607227 24607227 1
Deletion Chr6 25687306 25687314 9
Deletion Chr11 29021062 29021074 13
Deletion Chr4 33702147 33702147 1 2
Deletion Chr4 36557655 36557655 1

Insertions: 14

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr2 9852514 9852516 1
Insertion Chr2 25482668 25482670 1 OsKitaake02g251500
Insertion Chr4 30055270 30055273 2
Insertion Chr7 13340725 13340727 1
Insertion Chr7 14259034 14259036 1
Insertion Chr7 19796420 19796422 1
Insertion Chr8 165635 165638 2
Insertion Chr10 8392381 8392383 1
Insertion Chr5 14587229 14587231 1
Insertion Chr7 23082839 23082841 1
Insertion Chr8 2334934 2334937 2
Insertion Chr8 3245576 3245579 2
Insertion Chr11 23549920 23549922 1
Insertion Chr12 19136832 19136834 1

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr12 4715940 4716168
Inversion Chr1 18407338 18407499
Inversion Chr8 24874083 24874271

Translocations: 4

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes

Translocation Chr6 9449072 Chr5 20605203 OsKitaake05g164300
Translocation Chr6 10576612 Chr5 20604707
Translocation Chr5 20601234 Chr3 34429451
Translocation Chr5 21582343 Chr3 34482855

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	4747691	A-G	HET
SBS	Chr1	4775094	G-A	HET
SBS	Chr1	4775095	A-T	HET
SBS	Chr1	5985306	C-T	HET
SBS	Chr1	15064157	T-G	HET
SBS	Chr1	17144859	C-T	HET
SBS	Chr1	20485620	C-T	HET
SBS	Chr1	27403660	G-T	HOMO
SBS	Chr1	31831644	G-T	HET
SBS	Chr2	1449105	C-T	HET
SBS	Chr2	10810242	C-A	HET
SBS	Chr2	16993925	C-T	HET
SBS	Chr2	31609962	G-A	HET
SBS	Chr3	13465056	C-A	HET
SBS	Chr3	13552070	G-C	HOMO
SBS	Chr3	26272148	C-T	HOMO
SBS	Chr3	26272149	A-T	HOMO
SBS	Chr4	2522480	C-T	HET
SBS	Chr4	3044756	A-G	HET
SBS	Chr4	3391120	G-C	HOMO
SBS	Chr4	11264777	G-T	HOMO
SBS	Chr4	13687970	A-C	HET
SBS	Chr4	23493186	G-A	HET
SBS	Chr4	25574496	C-T	HET
SBS	Chr5	591799	G-T	HET
SBS	Chr5	6667469	G-T	HET
SBS	Chr5	9614831	G-A	HET
SBS	Chr5	9999392	C-A	HET
SBS	Chr5	13963071	G-A	HET
SBS	Chr5	15456697	C-A	HET
SBS	Chr5	16179239	A-T	HET
SBS	Chr5	16179240	A-T	HET
SBS	Chr5	16179241	C-T	HET
SBS	Chr5	20138603	T-C	HET		OsKitaake05g160300
SBS	Chr5	20427219	T-C	HET
SBS	Chr5	27606352	C-T	HET
SBS	Chr5	27802060	G-T	HET
SBS	Chr5	29368555	A-T	HET
SBS	Chr5	29396107	A-G	HET
SBS	Chr6	172692	C-T	HET
SBS	Chr6	2400226	A-G	HET
SBS	Chr6	9928807	C-T	HET
SBS	Chr6	14276433	A-G	HET
SBS	Chr6	18045143	A-T	HET
SBS	Chr6	22522577	G-C	HET
SBS	Chr6	24354080	A-T	HOMO
SBS	Chr6	25987162	A-T	HET
SBS	Chr6	27559468	C-A	HET
SBS	Chr7	6367054	T-A	HET
SBS	Chr7	9433915	G-A	HET
SBS	Chr7	10757633	G-A	HET
SBS	Chr7	12275097	G-C	HET
SBS	Chr7	13252147	G-A	HET
SBS	Chr7	14476206	G-A	HET
SBS	Chr7	14487099	A-T	HET
SBS	Chr7	16997872	G-A	HET
SBS	Chr7	18840656	C-T	HET
SBS	Chr7	20827585	C-T	HOMO
SBS	Chr7	22535214	A-C	HET
SBS	Chr7	27567232	C-G	HET
SBS	Chr8	1770949	G-T	HOMO
SBS	Chr8	9773276	G-T	HET
SBS	Chr8	17869173	A-T	HET
SBS	Chr8	23069410	G-A	HET
SBS	Chr9	4184176	A-G	HET
SBS	Chr9	9178916	C-T	HOMO
SBS	Chr9	21936086	A-C	HET		OsKitaake09g194800
SBS	Chr9	22211796	T-A	HET
SBS	Chr10	10690406	C-T	HET
SBS	Chr10	20874542	A-T	HOMO
SBS	Chr11	3995917	G-A	HET
SBS	Chr11	4348436	G-A	HET
SBS	Chr11	9179278	C-G	HET
SBS	Chr11	14764680	A-T	HET
SBS	Chr11	16354792	G-A	HET
SBS	Chr11	19048160	G-T	HET
SBS	Chr11	22945356	C-G	HET
SBS	Chr11	24578656	G-A	HET		OsKitaake11g198600
SBS	Chr11	25497997	C-A	HET
SBS	Chr12	12926016	G-T	HOMO
SBS	Chr12	13646077	A-C	HOMO
SBS	Chr12	15180395	C-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr11	946665	946666	2
Deletion	Chr2	1751050	1751054	5
Deletion	Chr11	3424838	3424847	10
Deletion	Chr7	3498241	3498242	2
Deletion	Chr2	3607585	3607585	1	2
Deletion	Chr7	5580109	5580112	4
Deletion	Chr4	7341240	7341245	6
Deletion	Chr6	10544001	10577000	33000	3
Deletion	Chr12	11258797	11258798	2
Deletion	Chr3	12635690	12635690	1
Deletion	Chr5	13674434	13674434	1
Deletion	Chr8	15483546	15483554	9
Deletion	Chr9	16132472	16132472	1
Deletion	Chr9	18309880	18309883	4
Deletion	Chr10	18311261	18311262	2	OsKitaake10g129500
Deletion	Chr8	18342611	18342611	1
Deletion	Chr7	18396733	18396733	1
Deletion	Chr5	20601001	21027000	426000	45
Deletion	Chr5	21030001	21274000	244000	31
Deletion	Chr8	21886004	21886011	8
Deletion	Chr3	21991948	21991948	1
Deletion	Chr2	23651437	23651437	1
Deletion	Chr11	23882001	23907000	25000	2
Deletion	Chr7	24607227	24607227	1
Deletion	Chr6	25687306	25687314	9
Deletion	Chr11	29021062	29021074	13
Deletion	Chr4	33702147	33702147	1	2
Deletion	Chr4	36557655	36557655	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr12	4715940	4716168
Inversion	Chr1	18407338	18407499
Inversion	Chr8	24874083	24874271

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Chromosome

Position 2

Number of Genes