Search Kitaake
Mutant Information |
---|
Mutant Name | FN4845-S [Download] |
Generation | M2 |
Genus Species | Oryza Sativa |
Cultivar | Kitaake |
Alignment File (BAM File) | Download FN4845-S Alignment File |
Seed Availability | Yes [Order Seeds] |
Variant Information |
---|
Single base substitutions: 93
Variant Type |
Chromosome |
Position |
Change |
Genotype |
Effect |
Gene Affected |
SBS | Chr1 | 1887494 | T-C | HET | ||
SBS | Chr1 | 6722383 | G-T | HET | ||
SBS | Chr1 | 13432727 | C-T | HET | ||
SBS | Chr1 | 25318089 | G-A | HET | ||
SBS | Chr1 | 32784072 | C-T | HET | ||
SBS | Chr2 | 2355733 | C-T | HET | OsKitaake02g034600 | |
SBS | Chr2 | 4481393 | A-G | HET | ||
SBS | Chr2 | 12254805 | A-G | HET | ||
SBS | Chr2 | 13937209 | T-A | HET | ||
SBS | Chr2 | 18232552 | T-C | HET | ||
SBS | Chr2 | 20606349 | G-A | HOMO | ||
SBS | Chr2 | 22820022 | A-G | HET | ||
SBS | Chr2 | 29195357 | T-C | HET | ||
SBS | Chr2 | 34958077 | G-A | HOMO | ||
SBS | Chr2 | 35031600 | G-A | HOMO | ||
SBS | Chr2 | 36638412 | A-T | HOMO | ||
SBS | Chr3 | 1584509 | A-T | HOMO | ||
SBS | Chr3 | 6474832 | A-G | HET | ||
SBS | Chr3 | 7532216 | A-G | HET | ||
SBS | Chr3 | 18855140 | G-C | HET | ||
SBS | Chr3 | 21079574 | C-T | HET | ||
SBS | Chr3 | 26696157 | A-T | HET | ||
SBS | Chr3 | 32375961 | T-G | HET | ||
SBS | Chr3 | 32390727 | C-T | HET | ||
SBS | Chr4 | 796186 | A-G | HET | ||
SBS | Chr4 | 6251504 | C-A | HOMO | OsKitaake04g031200 | |
SBS | Chr4 | 17449565 | G-A | HET | ||
SBS | Chr4 | 23317081 | G-T | HET | ||
SBS | Chr4 | 23556223 | C-T | HET | ||
SBS | Chr4 | 24238116 | G-A | HET | ||
SBS | Chr4 | 27537862 | A-T | HET | ||
SBS | Chr4 | 30000041 | C-T | HET | ||
SBS | Chr4 | 32427579 | G-T | HET | OsKitaake04g259400 | |
SBS | Chr4 | 34909108 | T-A | HET | ||
SBS | Chr5 | 4405290 | A-G | HET | ||
SBS | Chr5 | 16839296 | G-T | HET | ||
SBS | Chr5 | 18446643 | G-T | HET | ||
SBS | Chr5 | 19257721 | A-G | HET | ||
SBS | Chr5 | 19809735 | C-G | HET | ||
SBS | Chr5 | 22064908 | A-T | HET | ||
SBS | Chr5 | 27706530 | T-A | HET | ||
SBS | Chr6 | 874534 | T-C | HET | ||
SBS | Chr6 | 2537728 | G-A | HET | ||
SBS | Chr6 | 8791863 | C-G | HET | ||
SBS | Chr6 | 9929553 | G-T | HET | ||
SBS | Chr6 | 10808263 | G-A | HET | ||
SBS | Chr6 | 10838873 | A-G | HET | ||
SBS | Chr6 | 23980710 | A-G | HET | ||
SBS | Chr6 | 25883367 | A-G | HET | ||
SBS | Chr6 | 28585473 | A-T | HET | ||
SBS | Chr7 | 3275595 | T-C | HET | ||
SBS | Chr7 | 8764465 | T-A | HET | ||
SBS | Chr7 | 15957051 | T-C | HET | ||
SBS | Chr7 | 17437203 | G-A | HET | ||
SBS | Chr7 | 24391139 | T-C | HET | OsKitaake07g217100 | |
SBS | Chr7 | 24748951 | C-A | HOMO | ||
SBS | Chr7 | 29030857 | C-A | HET | ||
SBS | Chr8 | 4191694 | G-A | HET | ||
SBS | Chr8 | 6798245 | A-G | HET | ||
SBS | Chr8 | 6803844 | A-G | HET | ||
SBS | Chr8 | 7784497 | A-G | HET | ||
SBS | Chr8 | 10465587 | T-A | HET | ||
SBS | Chr8 | 11186368 | G-A | HET | ||
SBS | Chr8 | 21755149 | T-C | HET | ||
SBS | Chr8 | 23282204 | G-A | HET | ||
SBS | Chr9 | 532668 | C-A | HET | ||
SBS | Chr9 | 3526556 | G-A | HET | ||
SBS | Chr9 | 7190490 | C-A | HET | ||
SBS | Chr9 | 12487672 | A-G | HET | ||
SBS | Chr9 | 12826489 | G-A | HET | ||
SBS | Chr10 | 3132112 | G-A | HET | ||
SBS | Chr10 | 9569355 | A-G | HET | ||
SBS | Chr10 | 11061850 | A-G | HET | ||
SBS | Chr10 | 12134402 | G-A | HET | ||
SBS | Chr10 | 12791552 | A-G | HET | ||
SBS | Chr10 | 18061060 | G-T | HOMO | ||
SBS | Chr10 | 20924644 | A-T | HET | OsKitaake10g161400 | |
SBS | Chr10 | 22621546 | C-A | HET | ||
SBS | Chr11 | 3698272 | G-T | HET | ||
SBS | Chr11 | 5388916 | G-A | HET | ||
SBS | Chr11 | 10245442 | G-A | HET | ||
SBS | Chr11 | 12601335 | C-T | HET | ||
SBS | Chr11 | 16623187 | T-C | HET | ||
SBS | Chr11 | 17755701 | A-G | HET | ||
SBS | Chr11 | 21555066 | T-C | HET | ||
SBS | Chr11 | 26097906 | G-A | HET | ||
SBS | Chr12 | 2141918 | G-C | HET | ||
SBS | Chr12 | 3168832 | T-A | HOMO | ||
SBS | Chr12 | 4354978 | G-A | HET | ||
SBS | Chr12 | 7980415 | C-T | HET | ||
SBS | Chr12 | 11603707 | G-T | HET | ||
SBS | Chr12 | 15126878 | G-T | HET | ||
SBS | Chr12 | 16142878 | T-C | HET |
Deletions: 31
Variant Type |
Chromosome |
Start |
End |
Size(bp) |
Number of Genes |
Deletion | Chr6 | 3114260 | 3114264 | 5 | OsKitaake06g043400 |
Deletion | Chr11 | 3712001 | 3812000 | 100000 | 12 |
Deletion | Chr4 | 5181374 | 5181392 | 19 | |
Deletion | Chr8 | 7210833 | 7210833 | 1 | |
Deletion | Chr4 | 9151715 | 9151716 | 2 | 2 |
Deletion | Chr12 | 9168177 | 9168241 | 65 | |
Deletion | Chr6 | 10887407 | 10887414 | 8 | |
Deletion | Chr9 | 10971537 | 10971561 | 25 | |
Deletion | Chr10 | 12819988 | 12820005 | 18 | |
Deletion | Chr2 | 13317897 | 13317897 | 1 | |
Deletion | Chr9 | 13705156 | 13705164 | 9 | |
Deletion | Chr1 | 13782837 | 13782838 | 2 | |
Deletion | Chr9 | 14294629 | 14294631 | 3 | |
Deletion | Chr11 | 14944034 | 14944034 | 1 | |
Deletion | Chr6 | 15531606 | 15531606 | 1 | |
Deletion | Chr10 | 16388494 | 16388503 | 10 | |
Deletion | Chr3 | 16896490 | 16896490 | 1 | |
Deletion | Chr1 | 17240414 | 17240415 | 2 | |
Deletion | Chr4 | 20167217 | 20167217 | 1 | |
Deletion | Chr4 | 21620410 | 21620411 | 2 | OsKitaake04g122400 |
Deletion | Chr4 | 21763775 | 21763783 | 9 | |
Deletion | Chr5 | 23511001 | 23533000 | 22000 | OsKitaake05g205000 |
Deletion | Chr11 | 26973083 | 26973089 | 7 | |
Deletion | Chr4 | 28371342 | 28371342 | 1 | |
Deletion | Chr11 | 29481217 | 29481217 | 1 | |
Deletion | Chr4 | 29969318 | 29969329 | 12 | |
Deletion | Chr3 | 33247717 | 33247717 | 1 | |
Deletion | Chr2 | 33537591 | 33537600 | 10 | |
Deletion | Chr1 | 35763581 | 35763582 | 2 | |
Deletion | Chr1 | 39518982 | 39518984 | 3 | OsKitaake01g426400 |
Deletion | Chr1 | 40186247 | 40186247 | 1 |
Insertions: 11
Inversions: 6
Translocations: 8
Variant Type |
Chromosome |
Position 1 |
Chromosome |
Position 2 |
Number of Genes |
Translocation | Chr3 | 19925062 | Chr1 | 30455414 | |
Translocation | Chr3 | 19925335 | Chr1 | 30455422 | |
Translocation | Chr8 | 21935141 | Chr4 | 20332809 | |
Translocation | Chr8 | 22506071 | Chr4 | 20335051 | |
Translocation | Chr8 | 23191926 | Chr1 | 1402999 | |
Translocation | Chr8 | 23192840 | Chr1 | 1402993 | |
Translocation | Chr8 | 28209257 | Chr1 | 3720862 | OsKitaake08g237700 |
Translocation | Chr8 | 28209259 | Chr1 | 3720862 | OsKitaake08g237700 |