Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4847-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4847-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 29

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 1340576 C-A HET
SBS Chr1 2697507 C-A HOMO
SBS Chr1 17633822 T-C HOMO
SBS Chr1 22254176 T-G HOMO
SBS Chr1 37598493 A-G HOMO
SBS Chr2 724020 C-T HOMO
SBS Chr2 14991826 C-T HET
SBS Chr2 21508857 A-G HET
SBS Chr2 23646104 C-A HET
SBS Chr4 13474712 G-A HET
SBS Chr4 23466520 C-A HET
SBS Chr4 29674268 G-C HET
SBS Chr7 2018258 T-A HET
SBS Chr7 9432359 T-A HET
SBS Chr7 9432360 T-A HET
SBS Chr7 20497399 T-C HET
SBS Chr7 28304734 A-T HET
SBS Chr8 1875390 G-A HET
SBS Chr9 5668123 C-T HOMO
SBS Chr9 21807005 T-C HET
SBS Chr10 3559672 C-T HOMO
SBS Chr10 17474041 T-A HOMO
SBS Chr11 3735709 G-T HET
SBS Chr11 7161687 C-G HET
SBS Chr12 18302605 C-T HET
SBS Chr12 19202282 G-C HET
SBS Chr12 22825534 T-G HET
SBS Chr12 22825536 C-T HET
SBS Chr12 23609989 T-C HET

Deletions: 15

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr7 40845 40845 1
Deletion Chr1 1321485 1321485 1
Deletion Chr4 2569478 2569478 1
Deletion Chr7 2701117 2701117 1
Deletion Chr12 3670001 3677000 7000 2
Deletion Chr6 4707038 4707046 9
Deletion Chr11 6920595 6920686 92
Deletion Chr2 7549733 7549734 2
Deletion Chr4 8174267 8174268 2
Deletion Chr8 12823002 12823002 1
Deletion Chr1 17136314 17136468 155
Deletion Chr1 17137101 17137129 29
Deletion Chr2 18362384 18362385 2
Deletion Chr5 21590388 21590389 2
Deletion Chr8 23602070 23602070 1

Insertions: 2

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr12 23319506 23319518 11
Insertion Chr2 23314543 23314546 2

Inversions: 3

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr7 2847885 2848027
Inversion Chr7 22355868 22621932 OsKitaake07g189401
Inversion Chr7 22355874 22621934 OsKitaake07g189401

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	1340576	C-A	HET
SBS	Chr1	2697507	C-A	HOMO
SBS	Chr1	17633822	T-C	HOMO
SBS	Chr1	22254176	T-G	HOMO
SBS	Chr1	37598493	A-G	HOMO
SBS	Chr2	724020	C-T	HOMO
SBS	Chr2	14991826	C-T	HET
SBS	Chr2	21508857	A-G	HET
SBS	Chr2	23646104	C-A	HET
SBS	Chr4	13474712	G-A	HET
SBS	Chr4	23466520	C-A	HET
SBS	Chr4	29674268	G-C	HET
SBS	Chr7	2018258	T-A	HET
SBS	Chr7	9432359	T-A	HET
SBS	Chr7	9432360	T-A	HET
SBS	Chr7	20497399	T-C	HET
SBS	Chr7	28304734	A-T	HET
SBS	Chr8	1875390	G-A	HET
SBS	Chr9	5668123	C-T	HOMO
SBS	Chr9	21807005	T-C	HET
SBS	Chr10	3559672	C-T	HOMO
SBS	Chr10	17474041	T-A	HOMO
SBS	Chr11	3735709	G-T	HET
SBS	Chr11	7161687	C-G	HET
SBS	Chr12	18302605	C-T	HET
SBS	Chr12	19202282	G-C	HET
SBS	Chr12	22825534	T-G	HET
SBS	Chr12	22825536	C-T	HET
SBS	Chr12	23609989	T-C	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr7	40845	40845	1
Deletion	Chr1	1321485	1321485	1
Deletion	Chr4	2569478	2569478	1
Deletion	Chr7	2701117	2701117	1
Deletion	Chr12	3670001	3677000	7000	2
Deletion	Chr6	4707038	4707046	9
Deletion	Chr11	6920595	6920686	92
Deletion	Chr2	7549733	7549734	2
Deletion	Chr4	8174267	8174268	2
Deletion	Chr8	12823002	12823002	1
Deletion	Chr1	17136314	17136468	155
Deletion	Chr1	17137101	17137129	29
Deletion	Chr2	18362384	18362385	2
Deletion	Chr5	21590388	21590389	2
Deletion	Chr8	23602070	23602070	1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	2847885	2848027
Inversion	Chr7	22355868	22621932	OsKitaake07g189401
Inversion	Chr7	22355874	22621934	OsKitaake07g189401

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes