Search Kitaake

Mutant Information

Mutant Name	FN4851-S [Download]
Generation	M2
Genus Species	Oryza Sativa
Cultivar	Kitaake
Alignment File (BAM File)	Download FN4851-S Alignment File
Seed Availability	Yes [Order Seeds]

Variant Information

Single base substitutions: 66

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

SBS Chr1 9254919 G-A HET
SBS Chr1 9816542 T-A HET
SBS Chr1 12901484 A-G HET
SBS Chr1 13209506 C-T HET
SBS Chr1 13252425 T-G HET
SBS Chr1 18799152 T-A HET
SBS Chr1 30987325 C-T HET
SBS Chr1 35643236 A-T HET
SBS Chr1 36031555 T-A HET
SBS Chr1 36139652 C-T HET
SBS Chr2 10902424 G-A HOMO
SBS Chr2 14746724 T-C HOMO
SBS Chr2 17562374 C-T HET
SBS Chr2 25357725 C-T HOMO
SBS Chr2 26007353 C-G HET
SBS Chr2 27145194 C-A HET
SBS Chr2 28566299 G-T HET
SBS Chr3 7573348 C-T HET
SBS Chr3 7573349 C-T HET
SBS Chr3 15110273 C-T HET
SBS Chr3 24760569 A-G HET
SBS Chr3 24982716 C-T HET
SBS Chr3 28939713 T-C HET
SBS Chr4 18954558 C-T HET OsKitaake04g095100
SBS Chr4 26218331 A-G HET
SBS Chr4 28955985 T-C HET
SBS Chr4 32671478 A-G HET
SBS Chr4 33805944 A-G HET
SBS Chr5 171236 A-G HET
SBS Chr5 1259535 G-T HET
SBS Chr5 10208131 T-G HOMO
SBS Chr5 25561051 T-A HET
SBS Chr5 28335917 G-T HET
SBS Chr6 2164302 C-T HOMO
SBS Chr6 22426603 G-A HET OsKitaake06g197000
SBS Chr6 23514615 C-G HET OsKitaake06g207300
SBS Chr6 27124448 T-C HET
SBS Chr7 2211658 G-A HET
SBS Chr7 2650314 A-T HET
SBS Chr7 2907574 C-T HET
SBS Chr7 3016846 A-T HET
SBS Chr7 6682660 A-T HET
SBS Chr7 7505865 T-C HET
SBS Chr7 13115636 T-A HET
SBS Chr7 15343173 A-C HET
SBS Chr7 16206052 G-A HET
SBS Chr7 23383603 A-T HET
SBS Chr8 10036613 C-A HOMO
SBS Chr8 10036615 C-T HOMO
SBS Chr8 17216962 C-T HET
SBS Chr9 9486698 T-A HET
SBS Chr9 10670012 G-C HET
SBS Chr9 11253104 G-T HET
SBS Chr9 14761467 G-C HOMO
SBS Chr9 16753463 A-T HET
SBS Chr10 10002313 G-A HET
SBS Chr11 221736 G-A HET
SBS Chr11 992168 C-T HET
SBS Chr11 6233245 C-T HET
SBS Chr11 16388467 G-A HET
SBS Chr11 17356058 C-T HET
SBS Chr12 5624090 G-A HET
SBS Chr12 10496491 A-T HET
SBS Chr12 12267722 A-G HET
SBS Chr12 16098992 A-T HET
SBS Chr12 24658159 C-T HET

Deletions: 18

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Deletion Chr4 501116 501116 1
Deletion Chr6 1034524 1034527 4
Deletion Chr7 3084716 3084716 1
Deletion Chr1 3183090 3183090 1
Deletion Chr10 6009993 6010002 10
Deletion Chr9 8530745 8530745 1
Deletion Chr5 10340274 10340274 1
Deletion Chr7 11972327 11972337 11
Deletion Chr9 16116170 16116190 21
Deletion Chr10 18236914 18236914 1
Deletion Chr1 18362893 18362893 1
Deletion Chr11 19487709 19487710 2
Deletion Chr6 20622525 20622526 2
Deletion Chr7 20730714 20730716 3 OsKitaake07g170700
Deletion Chr4 22017980 22017981 2
Deletion Chr9 22529426 22529426 1 OsKitaake09g206000
Deletion Chr5 30239652 30239652 1
Deletion Chr2 33320157 33320168 12

Insertions: 7

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Insertion Chr2 1000429 1000433 3
Insertion Chr4 24909595 24909597 1
Insertion Chr5 18880999 18881001 1
Insertion Chr1 27075818 27075821 2
Insertion Chr1 28932861 28932863 1
Insertion Chr7 10622903 10622906 2
Insertion Chr12 25762979 25762981 1

Inversions: 1

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes

Inversion Chr11 8573955 9446444

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	9254919	G-A	HET
SBS	Chr1	9816542	T-A	HET
SBS	Chr1	12901484	A-G	HET
SBS	Chr1	13209506	C-T	HET
SBS	Chr1	13252425	T-G	HET
SBS	Chr1	18799152	T-A	HET
SBS	Chr1	30987325	C-T	HET
SBS	Chr1	35643236	A-T	HET
SBS	Chr1	36031555	T-A	HET
SBS	Chr1	36139652	C-T	HET
SBS	Chr2	10902424	G-A	HOMO
SBS	Chr2	14746724	T-C	HOMO
SBS	Chr2	17562374	C-T	HET
SBS	Chr2	25357725	C-T	HOMO
SBS	Chr2	26007353	C-G	HET
SBS	Chr2	27145194	C-A	HET
SBS	Chr2	28566299	G-T	HET
SBS	Chr3	7573348	C-T	HET
SBS	Chr3	7573349	C-T	HET
SBS	Chr3	15110273	C-T	HET
SBS	Chr3	24760569	A-G	HET
SBS	Chr3	24982716	C-T	HET
SBS	Chr3	28939713	T-C	HET
SBS	Chr4	18954558	C-T	HET		OsKitaake04g095100
SBS	Chr4	26218331	A-G	HET
SBS	Chr4	28955985	T-C	HET
SBS	Chr4	32671478	A-G	HET
SBS	Chr4	33805944	A-G	HET
SBS	Chr5	171236	A-G	HET
SBS	Chr5	1259535	G-T	HET
SBS	Chr5	10208131	T-G	HOMO
SBS	Chr5	25561051	T-A	HET
SBS	Chr5	28335917	G-T	HET
SBS	Chr6	2164302	C-T	HOMO
SBS	Chr6	22426603	G-A	HET		OsKitaake06g197000
SBS	Chr6	23514615	C-G	HET		OsKitaake06g207300
SBS	Chr6	27124448	T-C	HET
SBS	Chr7	2211658	G-A	HET
SBS	Chr7	2650314	A-T	HET
SBS	Chr7	2907574	C-T	HET
SBS	Chr7	3016846	A-T	HET
SBS	Chr7	6682660	A-T	HET
SBS	Chr7	7505865	T-C	HET
SBS	Chr7	13115636	T-A	HET
SBS	Chr7	15343173	A-C	HET
SBS	Chr7	16206052	G-A	HET
SBS	Chr7	23383603	A-T	HET
SBS	Chr8	10036613	C-A	HOMO
SBS	Chr8	10036615	C-T	HOMO
SBS	Chr8	17216962	C-T	HET
SBS	Chr9	9486698	T-A	HET
SBS	Chr9	10670012	G-C	HET
SBS	Chr9	11253104	G-T	HET
SBS	Chr9	14761467	G-C	HOMO
SBS	Chr9	16753463	A-T	HET
SBS	Chr10	10002313	G-A	HET
SBS	Chr11	221736	G-A	HET
SBS	Chr11	992168	C-T	HET
SBS	Chr11	6233245	C-T	HET
SBS	Chr11	16388467	G-A	HET
SBS	Chr11	17356058	C-T	HET
SBS	Chr12	5624090	G-A	HET
SBS	Chr12	10496491	A-T	HET
SBS	Chr12	12267722	A-G	HET
SBS	Chr12	16098992	A-T	HET
SBS	Chr12	24658159	C-T	HET

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size(bp)	Number of Genes
Deletion	Chr4	501116	501116	1
Deletion	Chr6	1034524	1034527	4
Deletion	Chr7	3084716	3084716	1
Deletion	Chr1	3183090	3183090	1
Deletion	Chr10	6009993	6010002	10
Deletion	Chr9	8530745	8530745	1
Deletion	Chr5	10340274	10340274	1
Deletion	Chr7	11972327	11972337	11
Deletion	Chr9	16116170	16116190	21
Deletion	Chr10	18236914	18236914	1
Deletion	Chr1	18362893	18362893	1
Deletion	Chr11	19487709	19487710	2
Deletion	Chr6	20622525	20622526	2
Deletion	Chr7	20730714	20730716	3	OsKitaake07g170700
Deletion	Chr4	22017980	22017981	2
Deletion	Chr9	22529426	22529426	1	OsKitaake09g206000
Deletion	Chr5	30239652	30239652	1
Deletion	Chr2	33320157	33320168	12

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	8573955	9446444

Main menu

You are here

Search Kitaake

Variant Type

Chromosome

Position

Change

Genotype

Effect

Gene Affected

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Start

End

Size(bp)

Number of Genes

Variant Type

Chromosome

Position 1

Position 2

Number of Genes