Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 39

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	24690807	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	24690808	C-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	34700206	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	34919998	G-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	35131959	T-C	HOMO	INTRON
SBS	Chr1	38121089	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	6579241	T-C	HET	INTRON
SBS	Chr2	7228280	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	19637963	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr3	28765579	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	32893619	G-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr4	3126619	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g06030
SBS	Chr4	6097393	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr4	7038196	A-G	HET	INTRON
SBS	Chr4	7719000	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr4	8481018	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	13819503	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr4	13819504	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr4	14547660	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	27255574	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	3579783	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr6	30889907	T-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr7	14811037	T-C	HET	INTRON
SBS	Chr7	24716780	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	25552703	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	10338465	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	4107808	C-G	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr9	9117637	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	14739303	G-A	HET	INTRON
SBS	Chr9	16391425	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	17759055	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr10	19850627	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr10	20905829	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	17375797	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	18390261	C-T	HET	UTR_3_PRIME
SBS	Chr11	23861834	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	6742291	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	24688905	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr12	26628309	G-A	HOMO	INTERGENIC

Deletions: 17

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr1	5196550	5196573	23	LOC_Os01g09980
Deletion	Chr11	5205897	5205898	1
Deletion	Chr1	5389519	5389538	19
Deletion	Chr7	5537856	5537861	5
Deletion	Chr6	9275815	9275821	6	LOC_Os06g16280
Deletion	Chr12	9367172	9367176	4
Deletion	Chr10	13934282	13934397	115	LOC_Os10g26680
Deletion	Chr11	14309180	14309187	7
Deletion	Chr1	15424706	15424707	1
Deletion	Chr9	20332780	20332797	17
Deletion	Chr11	20707357	20708402	1045
Deletion	Chr8	22298326	22298378	52
Deletion	Chr7	23930088	23930094	6
Deletion	Chr8	25457849	25457860	11
Deletion	Chr5	26437373	26437377	4
Deletion	Chr3	31733598	31733601	3
Deletion	Chr1	40463832	40463833	1

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr8	22865527	22865527	1
Insertion	Chr8	15615026	15615027	2
Insertion	Chr2	35638525	35638528	4
Insertion	Chr10	9284393	9284393	1
Insertion	Chr6	28897523	28897523	1

Inversions: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr11	21442005	22638961

Translocations: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr9	15387185	Chr2	29394692	LOC_Os09g25620
Translocation	Chr9	15388312	Chr3	54571	2
Translocation	Chr11	21355675	Chr8	10356753	LOC_Os08g16910
Translocation	Chr11	21442016	Chr8	10327154	LOC_Os08g16870

Main menu