Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 40

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	4102146	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	5373458	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	5373459	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	7772821	T-G	HET	INTRON
SBS	Chr1	28851140	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	30246359	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr2	11582874	C-G	HET	INTRON
SBS	Chr2	14580100	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	25019661	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	25022007	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	25022513	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	7129959	C-T	HOMO	INTRON
SBS	Chr3	14005514	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	5718644	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	13888214	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr4	19217082	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	21699147	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	27022202	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	27441010	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr4	30820887	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	2973363	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	20860796	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr5	21098587	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr6	1804152	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr6	13138894	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g22590
SBS	Chr6	13245130	C-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g22760
SBS	Chr6	16172610	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	16132610	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	21271620	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr8	8359394	G-A	HOMO	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g13950
SBS	Chr8	11105353	C-T	HOMO	INTRON
SBS	Chr11	6043787	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	8922571	G-A	HET	INTRON
SBS	Chr11	12995041	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	14100823	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	20110782	A-C	HOMO	INTRON
SBS	Chr11	20783228	T-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	26086243	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	26623301	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os11g44050
SBS	Chr12	16320948	G-C	HET	INTERGENIC

Deletions: 15

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	2972100	2972101	1
Deletion	Chr3	5856439	5856440	1
Deletion	Chr2	10070774	10070782	8	LOC_Os02g17490
Deletion	Chr9	15232956	15232971	15
Deletion	Chr6	16074650	16074652	2
Deletion	Chr5	16721703	16721714	11	LOC_Os05g28540
Deletion	Chr4	19996839	19996842	3
Deletion	Chr7	20471081	20471082	1
Deletion	Chr3	20594033	20651265	57232	9
Deletion	Chr2	23052546	23052548	2
Deletion	Chr8	23335357	23335382	25	LOC_Os08g36900
Deletion	Chr2	24795896	24795915	19	LOC_Os02g40920
Deletion	Chr7	25864506	25864507	1
Deletion	Chr7	27170209	27170210	1
Deletion	Chr4	30703689	30703698	9

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr11	22750230	22750230	1
Insertion	Chr1	2074858	2074858	1	LOC_Os01g04630
Insertion	Chr6	9246500	9246500	1

Inversions: 4

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr3	10680794	11346071
Inversion	Chr3	10748835	11346073	LOC_Os03g19170
Inversion	Chr9	20437346	20500035	LOC_Os09g35570
Inversion	Chr9	20437362	20500053	LOC_Os09g35570

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr6	6201745	Chr5	24433360

Main menu