Search Nipponbare

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 23

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	10231688	G-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	30288519	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	4268849	G-C	HOMO	INTRON
SBS	Chr10	11852717	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr10	22903797	C-G	HET	INTRON
SBS	Chr10	3447010	G-A	HOMO	INTRON
SBS	Chr12	9204225	C-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr2	21927057	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	22446411	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr2	27469449	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	30812953	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr2	6601304	C-G	HOMO	SPLICE_SITE_REGION
SBS	Chr2	9576755	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	17334041	G-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	19377074	T-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os03g33960
SBS	Chr4	7848769	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	13914334	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os05g24120
SBS	Chr5	20949134	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr5	3399798	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr7	11611787	G-T	HET	INTRON
SBS	Chr7	19475527	A-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr7	8420659	A-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr9	11080901	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g18080

Deletions: 2

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr2	5433998	5434002	4	LOC_Os02g10340
Deletion	Chr2	7623792	7623794	2

Insertions: 1

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr1	18484655	18484656	2

No Inversion

No Translocation

Main menu