Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 37

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	19402636	C-A	HET	INTRON
SBS	Chr1	41165845	G-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	539825	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	8058530	T-A	HET	SPLICE_SITE_REGION
SBS	Chr2	15781115	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr2	25021312	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	12573556	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	32790129	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	4121545	G-C	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g07740
SBS	Chr4	11416897	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr5	1780684	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	7830271	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	9723526	C-A	HET	INTRON
SBS	Chr5	13143699	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr5	24369063	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	6560653	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	14360571	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g25130
SBS	Chr7	14830531	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g25830
SBS	Chr7	14891838	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g25950
SBS	Chr7	16266739	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	3777108	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	18353544	G-A	HET	INTRON
SBS	Chr8	26559708	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr8	26559709	G-T	HET	INTRON
SBS	Chr9	6460002	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os09g11580
SBS	Chr9	20195326	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr10	6083219	C-G	HET	INTRON
SBS	Chr10	12677780	A-G	HET	INTRON
SBS	Chr10	15375407	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr10	17618425	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	1514632	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	7705718	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	10501958	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	28489457	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	2504955	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	7705237	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	7705739	T-C	HET	INTERGENIC

Deletions: 21

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr3	1965809	1971844	6035	2
Deletion	Chr8	2403000	2403006	6
Deletion	Chr10	2455809	2455810	1
Deletion	Chr3	3194454	3196478	2024	LOC_Os03g06390
Deletion	Chr1	5702111	5702115	4
Deletion	Chr1	5816398	5816406	8	LOC_Os01g10900
Deletion	Chr7	10673158	10673161	3	LOC_Os07g18030
Deletion	Chr3	11714621	11714622	1
Deletion	Chr11	11889836	11889838	2
Deletion	Chr4	13774510	13774511	1
Deletion	Chr8	15620401	15620419	18
Deletion	Chr2	15789655	15789657	2	LOC_Os02g26890
Deletion	Chr7	19838714	19842747	4033	LOC_Os07g33210
Deletion	Chr10	20544611	20544612	1
Deletion	Chr4	22436419	22436422	3	LOC_Os04g37730
Deletion	Chr4	22444196	22444199	3
Deletion	Chr1	23121724	23121725	1
Deletion	Chr12	23257168	23257170	2
Deletion	Chr11	26619479	26619486	7
Deletion	Chr11	28520613	28520627	14
Deletion	Chr3	36197599	36197600	1

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Insertion	Chr4	1566632	1566632	1	LOC_Os04g03579
Insertion	Chr8	16212030	16212031	2
Insertion	Chr3	20267689	20267689	1
Insertion	Chr8	10066631	10066631	1
Insertion	Chr8	20425353	20425354	2

Inversions: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr7	5986784	6085254	LOC_Os07g10930
Inversion	Chr7	5986801	6085265	LOC_Os07g10930
Inversion	Chr4	6133729	6134043
Inversion	Chr5	22030005	22426275	2
Inversion	Chr8	23804774	24005371	2

Translocations: 5

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr10	5301364	Chr6	14553641	LOC_Os10g09800
Translocation	Chr8	25425784	Chr1	34371006
Translocation	Chr8	26037324	Chr1	228121	2
Translocation	Chr8	26037410	Chr1	228112	2
Translocation	Chr3	32459731	Chr1	35462537

Main menu