Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 30

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	5486497	C-A	HET	INTRON
SBS	Chr1	15041399	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr1	19605223	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	31353277	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	32406284	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr2	17259792	C-A	HET	INTRON
SBS	Chr2	19567243	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	9585465	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	15298751	C-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	16189414	T-C	HET	INTRON
SBS	Chr3	26945923	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	6010671	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	7127219	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	13350420	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g23360
SBS	Chr4	33192593	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr6	13219431	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os06g22730
SBS	Chr6	24077427	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	14357609	A-G	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os07g25130
SBS	Chr7	17704026	C-G	HET	INTRON
SBS	Chr7	18997728	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	3346181	A-G	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr8	4028244	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g07220
SBS	Chr8	27649648	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g43780
SBS	Chr10	5929868	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr10	11496796	C-T	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os10g22220
SBS	Chr10	21896070	C-G	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr11	2194085	G-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	11897151	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	10603237	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	20189888	T-C	HET	INTERGENIC

Deletions: 14

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr8	3592779	3592780	1
Deletion	Chr4	6132861	6132887	26
Deletion	Chr2	7392369	7392379	10
Deletion	Chr3	7902517	7902518	1
Deletion	Chr10	9778558	9778565	7
Deletion	Chr1	10247899	10247900	1
Deletion	Chr10	14714521	14714527	6
Deletion	Chr8	18563396	18563402	6	LOC_Os08g30200
Deletion	Chr9	19433001	19471000	38000	10
Deletion	Chr2	23233277	23233278	1
Deletion	Chr4	25128611	25129094	483	LOC_Os04g42470
Deletion	Chr5	29621136	29621140	4	LOC_Os05g51640
Deletion	Chr1	34203598	34203599	1
Deletion	Chr1	34475286	34475289	3	LOC_Os01g59600

Insertions: 5

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr8	3853898	3853898	1
Insertion	Chr1	9584101	9584103	3
Insertion	Chr3	12624598	12624600	3
Insertion	Chr5	25310621	25310621	1
Insertion	Chr7	3549873	3549874	2

Inversions: 3

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr5	25570450	25731478	LOC_Os05g43940
Inversion	Chr4	26175484	26179706	LOC_Os04g44220
Inversion	Chr4	26175495	26179710	LOC_Os04g44220

No Translocation

Main menu