Search Results

Mutant Information

Variant Information

Single base substitutions: 38

Variant Type	Chromosome	Position	Change	Genotype	Effect	Gene Affected
SBS	Chr1	7226453	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	24004886	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr1	35301225	T-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	35867631	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	36177170	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr1	41459489	C-T	HET	SYNONYMOUS_CODING
SBS	Chr2	641086	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr2	29018066	A-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr3	330284	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	6939733	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	15857618	G-T	HET	INTRON
SBS	Chr3	24652225	T-A	HET	INTRON
SBS	Chr3	24652226	A-T	HET	INTRON
SBS	Chr3	27559385	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr3	29440832	A-G	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	1385721	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g03250
SBS	Chr4	3002231	G-C	HET	INTRON
SBS	Chr4	3660265	G-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr4	23688051	G-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os04g39740
SBS	Chr4	31345965	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr5	2673888	T-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr5	27823278	C-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr6	25654994	G-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr7	13626533	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	2254654	T-C	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr8	4722956	C-A	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr8	7815455	C-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr8	13149054	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr8	18743498	C-A	HET	NON_SYNONYMOUS_CODING	LOC_Os08g30450
SBS	Chr9	12986114	A-C	HET	INTERGENIC
SBS	Chr9	20828806	C-T	HOMO	INTRON
SBS	Chr10	16170449	G-T	HOMO	INTERGENIC
SBS	Chr11	15181786	G-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr11	17500112	C-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	1708462	A-T	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	4099526	T-A	HET	INTERGENIC
SBS	Chr12	11366556	C-T	HET	INTRON
SBS	Chr12	26611983	G-A	HET	INTERGENIC

Deletions: 21

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)	Number of Genes
Deletion	Chr5	3101363	3101369	6
Deletion	Chr3	6809997	6810000	3
Deletion	Chr7	7509335	7509353	18	LOC_Os07g13120
Deletion	Chr4	7667663	7667674	11
Deletion	Chr8	10473667	10473724	57
Deletion	Chr12	11358794	11358803	9
Deletion	Chr6	12069271	12069272	1
Deletion	Chr10	14115484	14115485	1
Deletion	Chr1	15981992	15981994	2
Deletion	Chr3	16099932	16099933	1	LOC_Os03g28010
Deletion	Chr3	17488493	17488494	1
Deletion	Chr7	20076249	20076250	1
Deletion	Chr5	22214863	22214869	6	LOC_Os05g37910
Deletion	Chr11	22493999	22494020	21
Deletion	Chr10	23180561	23180575	14	LOC_Os10g43020
Deletion	Chr1	25069779	25069793	14
Deletion	Chr2	25687930	25687931	1
Deletion	Chr1	27013250	27013251	1
Deletion	Chr1	36030730	36030731	1	LOC_Os01g62260
Deletion	Chr1	36289690	36289691	1
Deletion	Chr1	37068677	37068686	9	LOC_Os01g63880

Insertions: 3

Variant Type	Chromosome	Start	End	Size (bp)
Insertion	Chr1	43134513	43134518	6
Insertion	Chr2	35638525	35638528	4
Insertion	Chr11	5471010	5471010	1

Inversions: 2

Variant Type	Chromosome	Position 1	Position 2	Number of Genes
Inversion	Chr9	11057029	12987016	LOC_Os09g21490
Inversion	Chr11	16376705	17008551

Translocations: 1

Variant Type	Chromosome	Position 1	Chromosome	Position 2	Number of Genes
Translocation	Chr12	11163240	Chr9	4217748	LOC_Os12g19250

Main menu